张莉莉
- 作品数：27 被引量：31H指数：3
- 供职机构：中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金新疆维吾尔自治区科技支疆项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 一种解析植物内生细菌菌群的方法
- 本发明公开了一种解析植物内生细菌菌群的方法。本发明提供了用于解析植物内生细菌菌群的引物对，其靶序列为细菌16SrDNA的V3‑V4区的全长或部分；且所述引物对中的一条引物3’末端最后一个碱基与植物线粒体18SrDNA有差...
- 张莉莉陈丽莹
- 文献传递
- 水稻种子的细菌含量和群落结构及其影响因素分析
- 2023年
- 【目的】种子是植物微生物群代际传递的重要途径,但种子携带的微生物群落尚缺乏系统的研究。本研究以水稻种子为模型,定量分析种子的细菌含量、测定种子的细菌群落结构、探究地域与品种对细菌含量及群落结构的影响和鉴定水稻种子的核心菌群。【方法】选取18个水稻品种,每个品种分别来自中国海南和天津2个地域,共36组样本。每组样本包含5或10个DNA样本,每个DNA样本由3粒种子提取的总DNA构成。使用细菌特异性16S rDNA介导的荧光定量PCR技术测定种子的细菌含量,并分析影响因素;使用16S rDNA扩增子测序技术测定种子的细菌群落结构,并用生物信息学方法分析了影响因素和核心菌群。【结果】本研究测定了1080粒水稻种子的细菌含量,发现经过表面除菌的水稻种子内部存在共栖细菌,平均每克种子的细菌含量为1.53×10^(6)。水稻品种对种子的细菌含量有显著影响,而地域无影响。测定180个扩增子文库的细菌群落结构,发现水稻种子的菌群与水稻植株有相似之处,均以变形菌门为主要的细菌门类;地域对水稻种子的细菌群落结构有重要影响,不同地域的水稻种子在主坐标分析(principal co-ordinate analysis,PCoA)中有明显分离;而粳稻和籼稻之间无显著差异。还发现水稻种子存在核心菌群,且相对丰度高达总菌群的85.56%。【结论】本研究系统地揭示了水稻种子的细菌含量、群落结构及其影响因素,为利用种传微生物促进水稻健康提供了数据和方法支持。
- 张佳彬陈丽莹尤茜张莉莉贺学礼
- V5V6区引物解析植物内生细菌菌群的方法
- 本发明公开了V5V6区引物解析植物内生细菌菌群的方法。本发明提供用于解析植物内生细菌菌群的引物对，由引物甲和引物乙组成，靶序列为细菌16S rDNA的V5‑V6区的全长或部分；所述引物甲是核苷酸序列如序列表中序列1所示的...
- 张莉莉陈丽莹张玉满方荣祥
- 文献传递
- 通过非培养法对植物组织内生细菌进行定量检测的方法
- 本发明公开了通过非培养法对植物组织内生细菌进行定量检测的方法。本发明方法包括：向从无菌愈伤组织中提取的基因组DNA中添加不同拷贝数的细菌DNA，以细菌16S rRNA基因特异性引物对进行荧光定量PCR，得到植物组织细菌含...
- 张莉莉方荣祥陈丽莹
- 灰飞虱核心共生菌的鉴定
- 2022年
- 媒介昆虫的核心共生菌能被用作基因工程菌发挥抗病毒功能。灰飞虱是一种重要的农业害虫,其传播的水稻条纹病毒造成水稻的大面积减产甚至绝收。【目的】本研究对不同稻区及温室饲养的灰飞虱进行菌群组成分析并初步鉴定灰飞虱的核心共生菌。【方法】通过16S rDNA介导的二代测序技术,分析了2018–2020年间采集自云南昆明、河南开封、河南范县稻区以及温室的灰飞虱的菌群组成。【结果】所有37个灰飞虱测序样本均携带细胞内和细胞外共生菌,细胞内生菌沃尔巴克氏体属(Wolbachia)为灰飞虱最稳定的核心共生菌,在所有样本中存在,平均相对丰度51.96%,其代表性序列OTU45占据该属85条OTU序列总数的96.55%。除Wolbachia之外,其他常见核心菌均为胞外菌,其中4种平均相对丰度最高的常见核心菌分别为不动杆菌属、泛菌属、肠杆菌属和假单胞菌属,在10种常见核心菌中平均占比0.25%–2.97%。不同稻区的灰飞虱各有优势菌,昆明为立克次体属,范县为杀雄菌属和Cardinium,开封为醋杆菌属、泛菌属和Sulcia。这些田间的优势菌包括多种细胞内生菌。稻田灰飞虱在温室进行24 h蔗糖饲喂后,Wolbachia相对丰度显著升高,菌群结构与温室灰飞虱更加接近;继代培养后,除Wolbachia之外的细胞内生菌丢失或以低丰度存在于部分样本中。【结论】本研究初步阐明灰飞虱的菌群组成并鉴定了常见核心菌及3个中国稻区的优势共生菌,为通过核心菌进行抗病毒的研究提供了可选择的共生工程菌靶标。
- 孙红波姜军陈丽莹宋泽润刘达杨杰霍岩霍岩方荣祥
- 关键词：灰飞虱温室稻田
- 使灰飞虱获得水稻条纹病毒的方法及其人工饲料
- 本发明公开了一种使灰飞虱获得水稻条纹病毒的方法及其人工饲料。本发明所提供的使灰飞虱获得水稻条纹病毒的方法，包括如下步骤：给灰飞虱饲喂含有水稻条纹病毒的人工饲料，从而使所述灰飞虱获得水稻条纹病毒；所述人工饲料的组成如下：每...
- 陈丽莹霍岩张莉莉
- 文献传递
- 利用枸杞作为烟草花叶病毒瞬时表达外源蛋白的生物反应器
- 本发明公开了利用枸杞作为烟草花叶病毒瞬时表达外源蛋白的生物反应器。本发明公开了将含有外源蛋白质的编码基因的重组烟草花叶病毒表达载体导入农杆菌中，得到重组农杆菌；利用所得重组农杆菌感染枸杞，可以实现在枸杞中表达外源蛋白质。...
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- GrpE蛋白或其编码基因作为特异性抗灰飞虱及水稻条纹病毒的分子靶标的应用
- 本发明公开了GrpE蛋白或其编码基因作为特异性抗灰飞虱及水稻条纹病毒的分子靶标的应用。本发明提供了一种蛋白质，来源于灰飞虱(Laodelphax striatellus)，命名为LsGrpE蛋白，为序列表中序列1所示的蛋...
- 张莉莉宋直钰霍岩
- 文献传递
- 一种解析水稻叶际内生细菌菌群结构的方法
- 本发明公开了一种解析植物叶际内生细菌菌群结构的方法。该方法包括如下步骤：a)提取植物及其叶际内生菌总DNA；b)以总DNA为模板，采用引物对1(序列1和序列2)进行第一次PCR扩增，得到PCR产物1；以所述PCR产物1为...
- 张莉莉陈丽莹
- 表面表达ACC脱氨酶的水稻黄单胞菌及其构建方法与应用
- 本发明公开了重组水稻黄单胞菌及其构建方法与应用。本发明的重组水稻黄单胞菌的构建方法，包括将融合蛋白的编码基因导入受体水稻黄单胞菌，得到重组水稻黄单胞菌，所述融合蛋白是由细胞外膜表面展示所用的锚定蛋白与所述ACC脱氨酶融合...
- 张莉莉杨杰赵璟陈丽莹
- 文献传递
