党江鹏
- 作品数：3 被引量：18H指数：2
- 供职机构：陕西师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 云斑车蝗线粒体基因组全序列测定与分析被引量：11
- 2008年
- 采用长距PCR扩增及保守引物步移法并结合克隆测序测定并注释了云斑车蝗Gastrimargus marmoratus(Thunberg)的线粒体基因组全序列。结果表明:云斑车蝗线粒体基因组全序列为15904bp(GenBank登录号为EU527334),A+T含量略高于非洲飞蝗Locusta migratoria,为76.04%,包括13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因和一段1057bp的A+T富集区。蛋白质基因的起始密码子中,除COⅠ和ND5为TTG以外,均为昆虫典型的起始密码子ATN。ND5基因使用了不完全终止密码子T,其余基因均为典型的TAA或TAG。预测了22个tRNA基因的二级结构,发现tRNASer(AGN)缺少DHU臂,tRNASer(UGY)的反密码子环上有9个碱基。预测了云斑车蝗12S和16S rRNA二级结构,分别包括3个结构域30个茎环和6个结构域44个茎环。A+T富集区含有3个串联重复序列。
- 党江鹏刘念叶伟黄原
- 关键词：直翅目蝗总科线粒体基因组RNA二级结构
- 黄脸油葫芦线粒体基因组:一种新的基因排列方式被引量：9
- 2008年
- 采用长距PCR扩增及保守引物步移法测定并注释了黄脸油葫芦(Teleogryllus emma)线粒体基因组全序列。结果表明,黄脸油葫芦的线粒体基因组全长15660bp,A+T含量为73.1%。谷氨酸、色氨酸及天冬酰胺的转运RNA基因由N链编码,形成了直翅目中的第三种基因排列顺序,其余结构与其它螽亚目昆虫的线粒体结构一致。基因间隔序列共计73bp,间隔长度从1—24bp不等;有14对基因间存在共54bp重叠,重叠碱基数在1—11bp之间。13个蛋白质编码基因中12个基因(除COⅠ基因外)的起始密码为标准的ATN组成,COI基因的起始密码子为TTA。有10个基因在基因3'端能找到完全的TAA或TAG终止密码子,而有三个基因(COII,ND5和ND4)终止密码子为不完整的T。除tRNASer(AGN)外,其余21个tRNA基因的二级结构均属典型的三叶草结构。黄脸油葫芦940bp的A+T富集区中存在一个被认为与复制起始有关的保守的二级结构,该结构不仅存在于直翅目昆虫中,而且也存在于双翅目、鳞翅目和膜翅目中,但是未见于昆虫纲的早期分化类群——弹尾目中。
- 叶伟党江鹏谢令德黄原
- 关键词：黄脸油葫芦线粒体基因组蟋蟀科直翅目
- 云斑车蝗线粒体基因组序列测定与分析
- 基于长PCR的二次PCR策略,采用PCR直接测序和克隆测序相结合的方法,对直翅目蝗总科昆虫云斑车蝗线粒体基因组进行测定和拼接和注释。联合GenBank收录以及本实验室所测定的其他29种直翅目昆虫的线粒体基因组数据,以线粒...
- 党江鹏
- 关键词：线粒体基因组直翅目测序系统发育
- 文献传递
