陈飞
- 作品数:7 被引量:16H指数:3
- 供职机构:南京农业大学更多>>
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- 相关领域:农业科学自动化与计算机技术更多>>
- 一种苹果脆片品质无损分级的方法
- 本发明涉及苹果脆片外部品质分级标准及计算机视觉技术对苹果脆片品质的无损分级方法,属于一种新型的苹果脆片品质无损分级技术。通过计算机视觉装置,获取脆片图像,对脆片图像进行处理,提取大小、形状、颜色和纹理特征参数,优选特征参...
- 潘磊庆魏康丽屠康王振杰孙柯肖慧赵保民陈飞
- 葡萄bHLH转录因子家族全基因组分析被引量:7
- 2013年
- 通过生物信息学的方法,鉴定得到110个葡萄的bHLtl基因,分别命名为VvbHLH001一VvbHLHll0。葡萄bHLH基因可以分为24个亚家族,以非随机的方式分布在19条染色体上,其中有10组基因发生了串联复制。基因芯片表达分析显示葡萄bHLH基因具有器官特异性表达,如亚家族Ib(2)在根中特异表达,可能与根活力有关;VvbHl2g)03和VvbHLttl6基因在花蕊及花序中特异表达,推测与花器官发育有关。研究结果可为进一步开展bHLH家族的基因功能和分子进化机制的研究提供基础。
- 尹欢蔡斌李成慧陈飞
- 关键词:葡萄BHLH转录因子生物信息学
- 苹果钙依赖型蛋白激酶基因家族的进化研究被引量:4
- 2013年
- 在全基因组水平挖掘了26个苹果的CDPK基因,并通过基因结构和结构域组织的比较得到各成员之间的异同点,再通过蛋白质三级结构的分析,获得了苹果CDPK在重要的关键位点的突变,而这可能引起结构的自抑制和激活的重大差别。结合多个物种CDPK的挖掘,并与苹果CDPK各成员建立的系统发育树进行分析,得到了苹果26个CDPK的起源和21次扩增历史。借助于苹果CDPK表达的EST数据了解了苹果CDPK的初步表达情况,这些完善的苹果CDPK成员间复杂的进化历史对于开展后续验证成员间彼此的功能联系以及基因的利用奠定了基础。
- 陈飞尹欢梁英海蔡斌
- 关键词:苹果钙依赖型蛋白激酶进化历史基因复制
- 葡萄KFC基因家族成员CDPK和PPCK的起源、进化和功能分析
- 人类有8000多年的葡萄食用历史。现今葡萄是全球栽培面积第一和产量位居第三的水果,极具重要的经济价值和历史文化价值。作为非模式植物,葡萄中的代表欧亚种黑比诺葡萄已经完成了全基因组测序,标志着研究水平进入了后基因组时代。在...
- 陈飞
- 关键词:葡萄分子进化
- 一种苹果脆片品质无损分级的方法
- 本发明涉及苹果脆片外部品质分级标准及计算机视觉技术对苹果脆片品质的无损分级方法,属于一种新型的苹果脆片品质无损分级技术。通过计算机视觉装置,获取脆片图像,对脆片图像进行处理,提取大小、形状、颜色和纹理特征参数,优选特征参...
- 潘磊庆魏康丽屠康王振杰孙柯肖慧赵保民陈飞
- 文献传递
- 葡萄谱系特有基因生物信息学识别、基因结构与表达特性分析被引量:2
- 2013年
- 以葡萄全基因组29 971蛋白序列为查询序列,与包括葡萄在内的31个已测序植物蛋白序列、TIGR和NCBI数据库中的EST和非冗余蛋白质序列进行非同源性比对分析,保留E值大于0.01的序列,去除重复序列、转座子和注释不准确的基因序列,保留的非同源基因识别为葡萄谱系特有基因;并对谱系特有基因的结构和具有芯片表达信息的谱系特有基因的表达特性进行了分析。结果表明:共识别了2 009个葡萄谱系特有基因,与葡萄保守基因相比较,葡萄谱系特有基因平均外显子数量较少,为2个;平均外显子长度较短,为232 bp;平均内含子长度较长,为1 723 bp,与拟南芥、水稻等谱系特有基因结构特点相似,谱系特有基因可能具有相似的起源和进化模式。在47个具有芯片表达信息和相应UniGene信息的基因中,Vv04s0023g01710、Vv00s0187g00160、Vv17s0000g09800、Vv14s0083g00260分别在叶片、茎、细胞培养物、果实中相对表达量最高,相对表达量分别为2 120、2 282、5 566、1 428;有25个谱系特有基因仅在某一器官中表达,表明谱系特有基因具有器官特异性特点;分析34个谱系特有基因在4种非生物胁迫下基因表达情况,表明大部分基因表达受到明显抑制或不受诱导,推测非生物胁迫影响了这些谱系特有基因正常功能,也说明这些谱系特有基因较少参与非生物胁迫过程。
- 梁英海陈飞王刚王敏冯冠乔程宗明
- 关键词:葡萄生物信息学基因表达