郑之北
- 作品数:32 被引量:97H指数:5
- 供职机构:杭州市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金:浙江省医药卫生科学研究基金杭州市科技发展计划项目浙江省科技厅重点资助项目更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学化学工程更多>>
- 儿科常见人疱疹病毒的检测及基因分型
- 人疱疹病毒是免疫功能低下者常见的病原体,儿童因免疫系统发育不成熟,感染人疱疹病毒易全身播散,造成机体多器官多系统的损伤。早期诊断和及时治疗对控制病情和改善预后至关重要,且因各种人疱疹病毒的致病性、对药物敏感性各不相同,因...
- 郑之北吴亦栋尚世强杜立中
- 关键词:人疱疹病毒儿科疾病基因分型
- 文献传递
- 杭州地区甲型副伤寒沙门菌基因组流行病学的初步研究被引量:3
- 2018年
- 目的 了解近年来杭州地区甲型副伤寒沙门菌的基因组流行病学特征.方法 采用二代测序技术(NGS)对2002—2013年杭州地区分离的60株甲型副伤寒沙门菌代表株进行测序并下载公共数据库中的391株甲型副伤寒沙门菌基因组数据.以ATCC9150基因组为参考序列,鉴定所有基因组的单核苷酸多态性(SNP)位点并去除重组,构建基于SNP位点的系统发育树.用SRST2和多位点序列分型(MLST)工具扫描获得MLST型别,用SISTR扫描获得核心基因组多位点序列分型(cgMLST)型别,用SRST2和BLASTN扫描获得耐药基因.选择7种抗生素对60株杭州菌株进行药物敏感试验.结果 451株甲型副伤寒沙门菌基因组序列去重组后共鉴定得到19258个SNP位点,菌株平均距离为0.0070,距离小于0.05的占96.73%,提示451株甲型副伤寒沙门菌基因组差异较小.58株杭州ST85型分离株基因组序列高度相似,提示2002—2013年杭州地区甲型副伤寒疫情主要由ST85型菌株克隆传播引起.杭州菌株与5株国内5省菌株遗传距离较远(平均距离为0.057),与15株云南菌株距离较近(平均距离为0.0032),与柬埔寨菌株的距离最近(平均距离为0.0018),提示ST85型菌株存在跨国传播的可能性.2株杭州ST129型分离株中,HZ333与分离自江苏的两株菌近源(平均距离为0.0097),提示ST129型部分菌株存在国内传播的可能性.60株杭州菌株除2株未分型外,其余58株菌被分为9个cgMLST型别;公共数据库中391株菌除57株未分型外,其余334株菌被分为165个cgMLST型别.60株杭州菌株均携带耐药基因,其中56株菌携带aac6-Iy耐药基因,4株菌携带aac6-Iaa耐药基因;公共数据库中的391株甲型副伤寒沙门菌除了13株菌未携带耐药基因,其他378株菌均携带aac6-Iy耐药基因.60株杭州菌株中56株菌对7种抗生素均敏感;3株菌对复方新诺明耐药;1株菌对氨苄西林、四环素耐药.结论 2002—2013年杭州地区甲型副�
- 汪皓秋俞骅郑伟郑之北潘劲草
- 关键词:甲型副伤寒沙门菌单核苷酸多态性多位点序列分型耐药基因
- 多重PCR-基因芯片技术检测多种人疱疹病毒
- 目的:建立可同时检测单纯疱疹病毒1型和2型(HSV-1、HSV-2)、水痘-带状疱疹病毒(VZV)、人巨细胞病毒(CMV)、爱泼斯坦-马尔病毒(EBV)和人类疱疹病毒6型(HHV-6A、HHV-6B) 等多种人疱疹病毒的...
- 郑之北吴亦栋尚世强杜立中
- 关键词:人疱疹病毒基因芯片
- 文献传递
- 卫生检验原始记录电子化管理探讨被引量:4
- 2009年
- 郑之北李学梅赵敏邱晓枫姚怀芳胡钟铭吴小刚
- 关键词:卫生检验
- 细菌16SrRNA基因荧光定量PCR诊断新生儿败血症被引量:22
- 2007年
- 目的探讨新生儿败血症的快速可靠诊断方法,以提高临床检测细菌的速度及准确性。方法以细菌16S rRNA 基因为靶序列,设计通用引物及 TaqMan 探针,建立细菌16S rRNA 基因实时荧光定量 PCR 反应体系;选择临床引起新生儿败血症的常见菌如金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌和大肠埃希菌等进行浓度梯度实验;对临床疑为新生儿败血症的830例感染性疾病的新生儿抽取静脉血分别做细菌16S rRNA 基因荧光定量 PCR 和血培养检测。结果临床常见分离株金黄色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、大肠埃希菌荧光定量 PCR 检测结果均为阳性;巨细胞病毒、EB 病毒、乙肝病毒,新型隐球菌及白色念珠菌,人基因组 DNA 及空白对照均为阴性。细菌荧光定量 PCR 最低能检测到3个细菌,其荧光定量 CT 值为37.90;对临床疑为感染性疾病的830例患儿标本中,荧光定量 PCR 检测血标本阳性率5.18%(43/830),血培养阳性率2.41%(20/830),前者明显高于后者,差异具有统计学意义,P<0.01,30例非感染性疾病患儿血标本荧光定量 PCR 检测及细菌培养均为阴性。若以血培养作为对照,荧光定量 PCR 方法的诊断敏感性为100%,特异性为97.16%,正确诊断指数为0.972。结论建立了细菌16S rRNA 基因荧光定量 PCR 诊断新生儿败血症方法。其检测快速、简便,为新生儿败血症提供早期、敏感的病原学诊断依据。
- 吴亦栋尚世强李建平杨祖钦郑之北杜立中赵正言
- 关键词:败血病聚合酶链反应
- 沙门菌H抗原的xTAG法鉴定被引量:4
- 2016年
- 目的利用Luminex xTAG技术,建立能高通量鉴别沙门菌H抗原的xTAG悬浮芯片法,用于沙门菌的血清型别鉴定。方法以沙门菌编码H抗原的fliC和fljB基因为目标基因,选取其保守片段设计上游通用引物,选取可变片段设计下游特异性引物;合成时上游引物的5′端用生物素标记,下游引物的5′端连接特定的TAG序列;标本经多重PCR扩增并标记生物素和TAG序列后,与含anti-TAG序列的编码磁珠混合液杂交分型,通过生物素与链霉亲和素-藻红蛋白的反应报告结果。利用建立的xTAG悬浮芯片法鉴定145株沙门菌日常分离株的H抗原,并与传统的血清凝集试验比较。结果31种沙门菌H抗原经多重PCR扩增后,与xTAG磁珠杂交后可鉴别分型,各H抗原间无交叉反应,且重复性良好,与大肠埃希菌、霍乱弧菌、副溶血性弧菌及志贺菌DNA等亦无交叉反应。对145株沙门菌进行H抗原鉴定,与传统的血清凝集试验比较,其敏感度为95.1%,特异度为100%。结论利用xTAG悬浮芯片法鉴定沙门菌H抗原,特异准确,可在4~5 h内完成90多株常见血清型沙门菌的H抗原鉴定。
- 郑之北郑伟濮小英文艳苹潘劲草汪皓秋
- 关键词:沙门菌H抗原
- 杭州市急性呼吸道感染儿童中WU多瘤病毒感染的流行病学及基因特征分析被引量:1
- 2015年
- 目的了解杭州市急性呼吸道感染儿童中WU多瘤病毒(WU polyomavirus,WUPy V)流行特征和基因型别。方法收集2011年3月至2013年6月间至浙江省儿童医院就诊的急性呼吸道感染患儿的鼻咽吸取物,用聚合酶链反应(PCR)法扩增VP2编码基因和VP2/1中间序列,测序后进行分型。选取代表性病毒株进行基因组测序。结果收集的722份标本中,10份为WUPy V阳性,检出率为1.4%。WUPy V感染主要发生在夏季、秋季和冬季。患儿平均年龄为13.6月龄,男女性别比为9∶1,性别差异无统计学意义(P=0.09)。WUPy V感染所致疾病为肺炎、喉炎和细支气管炎。WUPy V基因型别为Ⅰa型。代表性毒株HZ13024的基因组大小为5229 bp,与Gen Bank中WUPy V基因组序列相似性为99.8%~99.9%。结论杭州市儿童急性呼吸系统疾病中存在WUPy V感染,感染率较我国其他地区低,基因型别为Ⅰa型。
- 文艳苹于新芬周银燕寇宇郑伟郑之北
- 关键词:WU多瘤病毒流行病学
- 以“过程控制”理念改进实验室内部审核被引量:9
- 2012年
- 内部审核(以下简称"内审")对推动质量管理体系有效运转、识别潜在改进机会的重要性勿庸置疑,但在实际工作中,常面临内审难以深入甚至流于形式的问题。尤其是按照ISO/IEC 17025:2005《检测和校准实验室能力的通用要求》和《实验室资质认定评审准则》建立的质量管理体系。
- 郑之北虞爱旭赵敏岑斌曾文芳
- 关键词:过程控制
- 常见人疱疹病毒诊治技术的系列开发研究及临床应用
- 尚世强陶然吴亦栋杜立中沈征余钟声董关萍郑之北段群军楼金吐俞锡林史建蓉
- 1.课题来源与背景:该课题以浙江省科技厅重点项目《常见人疱疹病毒PCR-基因芯片技术的建立及临床应用》(2005C23025)为基础,同时结合国家自然科学基金项目《甘露聚糖结合凝集素(MBL)阻断HCMV侵入靶细胞机制的...
- 关键词:
- 关键词:疱疹病毒基因芯片
- 细菌16S rRNA基因实时荧光定量及分型方法的建立
- 目的探索快速可靠的败血症和化脓性脑膜炎等细菌性感染疾病诊断的新方法。方法分析细菌16S rRNA基因序列,在高度保守区自行设计通用引物和探针,以及革兰氏阳性和阴性分型探针,对12种标准菌株、23种临床培养分离株、乙型肝炎...
- 吴亦栋尚世强杨祖钦郑之北杜立中
- 文献传递