邢家强
- 作品数：4 被引量：3H指数：1
- 供职机构：兰州生物制品研究所有限责任公司更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 风疹病毒E1蛋白与受体结合特定结合域的预测被引量：1
- 2014年
- 目的 同源模建E1蛋白及其受体髓鞘少突胶质细胞糖蛋白（myelin oligodendrocyte glycoprotein,MOG）的三维结构,应用分子对接的方法预测E1蛋白与其受体MOG的候选结合氨基酸残基。方法 采用MODELLER程序预测E1蛋白及其受体MOG的三维结构,并应用CASTp server进行活性口袋的预测;采用ProtScale进行疏水性分析,应用基于隐马尔可夫模型（HMM）算法的SMART程序搜索蛋白序列的motif;采用PyMOL-APBS软件设计E1蛋白及其受体MOG分子的腔介质结构,分析其表观静电势,应用PLATINUM程序进行分子对接,寻找其结合位点。结果E1蛋白由3个结构Ⅱ组成,其中D1、D3处于结构的底部,形成一个大的口袋,C-末端与D2的一侧形成另一个大的口袋,其余口袋主要集中在D2上半部的融合面中;MOG的结构模型为8个反平行的β折叠组成的一个β折叠桶,预测结构的主链构象的所有氨基酸均处于允许区。在MOG N-末端1～17位的氨基酸残基形成一个moti（flow complexityregion）,46～127位的氨基酸残基形成了一个motif V型免疫球蛋白样结构Ⅱ（Immunoglobulin V-Type,IGv）;lowcomplexity region段氨基酸残基表现为强疏水性。MOG N-末端的5个残基基序及ARG101～GLU107构成的β转角共同形成一个突起的结构,插入到E1蛋白的活性口袋中,与口袋中的ALA86、TYR90、TYR101、PHE102、ASN103、GLY105、SER107、TYR109、ALA122、PHE123、HIS125、SER126相互结合。结论 应用计算机模拟技术预测了E1蛋白与其受体MOG结合的特定结合Ⅱ,为今后进一步研究其相互作用奠定了基础。
- 邢家强刘晓凡窦强林杰魏至栋
- 关键词：风疹病毒同源模建分子对接
- 应用不同代次兔肾细胞培养风疹病毒松叶株的研究被引量：1
- 2013年
- 目的为提高兔肾细胞产量用于增加风疹病毒生产。方法 SPF级家兔肾细胞经传代培养10代,对不同代次兔肾细胞进行遗传稳定性、外源因子及兔脑原虫检测后接种风疹病毒松叶株(Matsuba strain)的试验。结果兔肾细胞产量得到提高,由1对兔肾平均生产1瓶细胞增加为8瓶,细胞核型检查传至第10代的细胞染色体数目与初代细胞一致,细胞培养物均一性提高。第0～第3代细胞病毒培养物滴度间无显著性差异,χ2检验返回相关性的P值均大于0.95。结论第1～第3代细胞培养风疹病毒与第0代相比,可获得相同滴度的病毒培养物,p3代兔肾细胞应用于疫苗生产可显著提高细胞及病毒产量。
- 刘晓凡邢家强魏至栋窦强林杰徐小明
- 关键词：病毒滴度
- 牛肾细胞的冻存及复苏后连续传代的研究被引量：2
- 2014年
- 目的:研究牛肾细胞的冻存及复苏后连续传代的可行性,为轮状疫苗生产提供稳定、一致的细胞基质。方法:将原代牛肾细胞培养至一代消化后冻存,复苏后进行连续传代培养,观察和记录细胞生长情况。从原代开始,每隔5代对牛肾细胞做染色体核型分析,检查牛肾细胞传代稳定性。结果:牛肾细胞冻存后复苏可连续传至15代,细胞增殖数量、培养时间相对稳定,细胞生长良好,细胞形态未发生明显改变;牛肾细胞在传代过程中遗传性状稳定,未发现有染色体缺失或异倍体现象。结论:牛肾细胞冻存复苏后可连续传代培养,能够为轮状病毒疫苗生产提供稳定、一致的细胞基质。
- 林杰窦强邢家强张平魏至栋
- 关键词：冻存传代稳定性
- 轮状病毒非结构蛋白NSP1与干扰素调节因子结合结构域的分析
- 2016年
- 目的同源模建轮状病毒NSP1 C末端效应区及干扰素调节因子IRF3、IRF5、IRF7结合结构域（IAD）的三维结构,应用分子对接的方法,预测NSP1与IRF的候选结合氨基酸残基。方法以Prot Scale进行疏水性分析,APBS进行表观静电势的分析,采用MODELLER程序进行三维结构的预测,对NSP1 C末端效应区和IRF3、IRF5、IRF7的IAD应用PLATINUM程序进行分子对接,寻找它们的结合位点。结果 NSP1与IRF3、IRF5、IRF7的作用表现为2个不同类型,其中NSP1与IRF3的作用位点集中在效应区LEU 3~ARG 67一个较大范围内;作用方式呈现多样性（疏水作用、芳香共轭作用以及氢键作用）;NSP1与IRF5、IRF7的作用位点集中在效应区SER74~GLU87一个较小的范围内,作用方式也表现为单一的氢键作用。结论应用计算机模拟技术预测了NSP1和IRF3、IRF5、IRF7的作用方式及结合位点,为进一步研究NSP1对IRF的作用提供一些新的思路。
- 邢家强李佳林贺倩李宏斌于梅林杰窦强魏至栋
- 关键词：同源模建分子对接
