萧笑
- 作品数：3 被引量：15H指数：2
- 供职机构：第四军医大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金中央高校基本科研业务费专项资金陕西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 钙依赖性磷脂结合蛋白Annexin Ⅱ的研究进展被引量：10
- 2007年
- AnnexinⅡ是Annexins超家族中A亚家族的重要成员,具有钙离子介导的磷脂结合特性.主要表达在人体内皮细胞、单核/巨噬细胞、骨髓细胞和某些肿瘤细胞中.本文着重就AnnexinⅡ的基因结构、蛋白结构、生物学功能及其与疾病的关系进行阐述.
- 萧笑王元张思河
- 关键词：ANNEXIN钙离子磷脂类
- 一种碱基精度的肿瘤基因组单体型异质性识别算法被引量：2
- 2017年
- 针对肿瘤组织的异质性的子克隆解析,提出了一种通过多级子克隆的体细胞突变模式来识别单体型异质性的算法。该算法基于肿瘤组织的多文库测序数据提取文库特征和双末端读段约束,通过对体细胞突变位点的等位基因变异频率进行聚类估算出子克隆数目的一个先验;同时设计了一种拼接识别算法,通过遍历位点对应的读段来拼接单体型序列,拼接出的单体型序列的精度为碱基水平;采用后验概率的最大似然估计解出子克隆的个数、配比及演化关系。仿真实验表明,当基础文库满足一定测序覆盖度时,该算法对单体型异质性的识别精度可达到99%以上,能够取代目前数据分析中常用的两步法,且获得高精确的识别结果。
- 耿彧赵仲孟刘建业许静许静萧笑王嘉寅
- 关键词：肿瘤异质性
- TGF-β1通过RUNX2调控人肝星状细胞系LX-2中骨桥蛋白表达被引量：3
- 2013年
- 目的:探讨人肝星状细胞系LX-2中促纤维化因子TGF-β1对骨桥蛋白(Osteopontin,OPN)的转录调控作用,研究其潜在关系及作用通路。方法:经重组因子TGF-β1刺激后,western blot检测人肝星状细胞系LX-2中OPN和RUNX2的表达水平。通过生物信息学分析软件预测RUNX2在OPN启动子序列上的结合位点。构建基于pGL3-Basic的人OPN启动子载体和相应截短体,与RUNX2共转染HEK293细胞,结合双荧光素酶报告基因实验分析RUNX2对OPN启动子的转录调控作用。结果:经TGF-β1刺激后,LX-2细胞系中OPN与RUNX2的蛋白表达水平均升高,提示二者均为TGF-β1下游效应分子。TESS生物信息学分析显示OPN启动子序列-78^-73存在RUNX2的结合位点ACCACA。通过双荧光素酶报告基因实验结果显示:RUNX2对OPN启动子具有正向调控作用,且通过截短删除之前预测的结合位点后,该调控作用消失。结论:TGF-β1可促进人肝星状细胞系中OPN的表达,该作用部分通过其下游转录因子RUNX2作用于OPN启动子区域的ACCACA序列而实现。
- 王睿萧笑王红红赵丽娜徐立刘志国
- 关键词：RUNX2骨桥蛋白TGF-Β1人肝星状细胞
