李小明
- 作品数:2 被引量:3H指数:1
- 供职机构:华南农业大学食品学院更多>>
- 发文基金:国家教育部“211”工程国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 花生白藜芦醇合酶基因的克隆与生物信息学分析被引量:1
- 2012年
- 利用Protparam、iPSORT prediction、ProtScale、SOPMA、Swiss-Modeling和Scan Prosite等生物信息学工具分别对其理化性质、信号肽、疏水性、亲水性、二级结构和三级结构进行分析。以花生粤油45总DNA和总RNA为模板,采用PCR和RT-PCR技术克隆花生白藜芦醇合酶基因的DNA和cDNA序列,并利用SWISS-PROT、DNAMAN等生物信息学工具对其基因和蛋白质序列进行了分析。测序结果显示,该基因的DNA和cDNA序列长度分别为1 498 bp和1 251 bp,cDNA序列具有完整的开放性阅读框,编码389个氨基酸的多肽。该白藜芦醇合酶氨基酸368-378位点上存在芪合酶家族的特征位点GVLFGFGPGLT。同源性分析表明,其碱基序列与已报道的花生白藜芦醇合酶基因的一致性为99%,其氨基酸序列与已报道的花生白藜芦醇合酶氨基酸序列的一致性为100%。
- 黄秀琴郭丽琼李小明林俊芳袁致浩谭铭琛
- 关键词:花生白藜芦醇合酶基因克隆
- 葡萄白藜芦醇合酶基因的克隆及序列分析被引量:2
- 2011年
- 目的:从葡萄中克隆白藜芦醇合酶基因vrs1并对其序列进行生物信息学分析。方法:利用葡萄总RNA为模板,采用RT-PCR技术克隆白藜芦醇合酶基因vrs1并亚克隆进T-Vector。利用生物信息学工具对其核酸和蛋白序列进行分析。结果:测序结果显示其cDNA序列全长为1 257bp,含有一个1 179bp的开放阅读框。生物信息学分析表明葡萄白藜芦醇合酶基因编码392个氨基酸,分子量为42.9kDa,理论等电点为5.97,具有芪合酶家族固有的氨基酸保守结构域,二级结构主要由α-螺旋、无规则卷曲、延伸链和β-转角组成。结论:该基因的克隆、生物信息学分析为进一步研究其功能奠定了基础。
- 李小明郭丽琼黄秀琴林俊芳白曦
- 关键词:葡萄白藜芦醇合酶基因克隆