曾贤彬
- 作品数：14 被引量：36H指数：4
- 供职机构：西南民族大学更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 麦洼牦牛H-FABP、HSL基因遗传多态性及与生长性状的关联分析
- 麦洼牦牛作为青藏高原型牦牛的优良地方品种，主要分布于川西北地区的阿坝藏族羌族自治州、甘孜藏族自治州和甘肃省的甘南地区，是我国牦牛这一特有牛种中最早被人认识和研究的重要地方品种之一。牦牛生活在环境污染少、未施过化肥和农药的...
- 柴志欣王永罗晓林钟金城刘仲娜曾贤彬
- 关键词：麦洼牦牛心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性
- 犏牛精子发生阻滞的比较转录组研究被引量：10
- 2014年
- 犏牛是牦牛与普通牛的杂交后代,其雄性不育是牦牛杂交改良中的一大难题.运用高通量测序技术对健康成年犏牛和牦牛的睾丸组织进行转录组测序和比较研究,探讨了犏牛激素调节、精子发生及细胞凋亡等相关基因的表达情况.结果表明,犏牛、牦牛睾丸组织中分别有17784和18529个基因表达,在犏牛中表达显著上调和下调的基因分别有5000和4089个.犏牛睾丸组织中睾酮合成相关基因和抑制素基因表达均显著上调,认为前者的表达上调可能促进睾丸内睾酮分泌和后者的表达,而后者的表达上调可能分别抑制和几乎不影响脑垂体前叶合成、分泌促卵泡刺激素和黄体生成素.比较睾丸组织中细胞标记基因在两种牛间的表达差异,发现犏牛精原干细胞、支持细胞、间质细胞、肌样细胞(睾丸纤维化)和已分化精原细胞的标记基因分别呈显著表达上调和下调,而减数分裂后期或精子形成期呈极显著下调.精原干细胞自我更新与分化异常可能导致犏牛精子发生障碍,认为其与视黄酸信号通路障碍密切相关.Syce3,Fkbp6和Dmrt7等在犏牛睾丸组织中极显著表达下调与同源染色体间、尤其是性染色体间的联会复合体数量减少有关.Spo11和Dmc1分别参与双链断裂和同源修复过程,其在犏牛睾丸中表达下调分别可能使联会复合体减少和同源修复失常.参与高度浓缩细胞核的相关基因,尤其是Tnp2,Hmgb4和H1fnt等几乎不表达,其调控表达基因Crem,GRTH/DDX25等极显著表达下调,该现象与犏牛生精细胞最终只能分化至圆形精子细胞阶段的结果相符.促凋亡相关基因,如p53,TNF-α,Trail,Bmp8b,Bax,Caspase-3,Caspase-6和Caspase-7表达均显著上调,而抑凋亡基因,如survivin,Bcl-2等显著下调,这可能是导致犏牛睾丸组织中有更多的生精细胞发生凋亡的原因之一.通过对生殖相关基因的表达分析研究,为揭示犏牛雄性不育机理以及牦牛�
- 曾贤彬柴志欣王永马志杰杨琴宋乔乔钟金城
- 关键词：犏牛牦牛睾丸转录组精子发生
- 牦牛CAPN2基因的电子克隆及生物信息学分析被引量：3
- 2013年
- 目的:对牦牛CAPN2基因进行电子克隆和序列分析,以期为进一步研究牦牛该基因与其肉质性状相关性以及基因结构和表达奠定理论基础。方法:利用人的CAPNA2基因cDNA序列为探针,在EST数据库进行同源性筛选,运用CAP3进行拼接得到完整序列并结合生物信息学进行序列分析。结果:牦牛CAPN2基因全长3 200bp,包含一个2 103bp的开放阅读框,共编码700个氨基酸;牦牛CAPN2的核苷酸序列与普通牛、羊、马、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的一致性分别为99%、97%、90%、87%、85%、79%、90%。经聚类分析,牦牛首先与普通牛聚在一起,然后与羊、猪聚为一类;人与小鼠聚为一类;这两类相聚为一大类后,再依次与马、鸡相聚,其结果与以往的生物学分类结果一致。牦牛CAPN2基因编码蛋白的分子式为C3569H5503N255O1082S26,相对分子质量为79 935.2,理论等电点PI为4.86。结论:牦牛与普通牛、羊、马、猪、小鼠、鸡、人在CAPN2基因的编码序列具有较高有一致性。该基因编码的蛋白为位于细胞质中的水溶性蛋白。
- 刘仲娜柴志欣曾贤彬钟金城
- 关键词：牦牛EST电子克隆
- 麦洼牦牛SRY基因克隆及序列分析被引量：5
- 2013年
- SRY是Y染色体上具体决定生物雄性性别的基因片段,是多数哺乳动物性别决定基因之一。本试验采用克隆测序SRY基因并结合生物信息学对其序列进行分析,利用软件Codon W分析麦洼牦牛、普通牛、绵羊、山羊、猪、小鼠、鸡和人该基因编码区的密码子偏好性。克隆测序得到SRY基因序列含1个690bp的开放阅读框,共编码229个氨基酸;其编码区核苷酸序列与普通牛、绵羊、山羊、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的一致性分别为99.9%、93.9%、91.2%、76.5%、43.3%、21.4%、69.1%。经聚类分析,麦洼牦牛首先与普通牛聚在一起,绵羊与山羊聚为一类,这两类相聚后再依次与猪、人、小鼠相聚,最后与鸡聚为一类,其结果与以往的生物学分类结果一致。该基因编码的蛋白质分子式为C1155H1827N351O348S11,相对分子质量为2655.0,理论等电点PI为9.55,亲水性平均数为-0.855。其密码子偏好性分析显示,T3s为0.2905、C3s为0.3240、A3s为0.3728、G3s为0.2963,第3位碱基中出现G和C占第3位碱基总量的48%,同义密码子数为61。上述数据表明麦洼牦牛SRY基因编码序列与普通牛、绵羊、山羊、猪、人具有较高的一致性,在物种进化过程中较为保守。该基因对含A的密码子有较高的偏爱性,尽量避开以G结尾的密码子,且其所编码的蛋白质为亲水性蛋白。
- 刘仲娜钟金城柴志欣马志杰曾贤彬宋乔乔
- 关键词：麦洼牦牛SRY基因聚类分析密码子偏好性
- 犏牛和牦牛睾丸的细胞特异基因表达研究
- 牦牛和普通牛的种间杂种犏牛雄性不育是牦牛杂交改良中的一大难题。本研究运用新一代高通量测序技术(RNA-seq)对健康成年牦牛和犏牛的睾丸组织进行转录组测序,分析两者睾丸组织中特异标记基因的表达差异状况。结果表明：①肌样细...
- 曾贤彬姬秋梅马志杰刘仲娜杨琴宋乔乔钟金城
- 关键词：犏牛牦牛标记基因精子发生
- 西藏牦牛mtDNA ND5遗传多样性及系统进化分析
- 为了解西藏牦牛遗传多样性和资源,探讨西藏牦牛类群间的亲缘关系,为西藏牦牛资源的保存和利用提供理论依据.对西藏15个品种或类群的150头牦牛的ND5基因进行基因全序列测定,利用生物信息学软件分析其遗传多样性及亲缘关系.结果...
- 海汀钟金城姬秋梅信金伟张成福曾贤彬
- 关键词：西藏牦牛
- 基于转录组测序对犏牛和牦牛睾丸组织的分析研究
- 牦牛与普通牛的种间杂种犏牛雄性不育机理一直是畜牧科学研究的热点之一,关于犏牛雄性不育机理,国内外学者从解剖生理学、内分泌学、组织形态学、细胞遗传学、生物化学、分子遗传学等方面进行了许多研究,但至今尚未得到确切的、有说服力...
- 钟金城姬秋梅柴志欣刘仲娜曾贤彬宋乔乔杨琴马志杰
- 关键词：犏牛牦牛转录组差异表达分析
- 牦牛HSFY基因的克隆及其结构分析被引量：1
- 2013年
- Y染色体上的热休克转录因子(HSFY)是精子发生障碍的候选基因之一。通过克隆牦牛HSFY基因,并与普通牛Y染色体上的84条HSFY序列比对。结果表明:牦牛HSFY基因由2个外显子和1个内含子组成,与普通牛基因组中的相应序列的一致性高达99.54%。牦牛、普通牛的该基因具有4处插入/缺失,且序列与其相邻序列极为相似。在1 012-1 020 bp(Ⅰ)处有AAAGAAGA/TG等9个核苷酸缺失,位于内含子内;在1 071-1 073 bp(Ⅱ)、1 249-1 251 bp(Ⅲ)处分别有AAG、CCA/C等3个核苷酸缺失,位于第二外显子内,分别导致赖氨酸和组氨酸的缺失;在1 708-1 710 bp(Ⅳ)处有CAA 3个核苷酸缺失,位于3'末端非编码区。在普通牛的84条HSFY基因序列中Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ插入/缺失分别有29、3、2、1次。未发现Ⅱ、Ⅲ同时缺失的拷贝,但Ⅱ、Ⅲ缺失均伴有Ⅰ缺失,且导致了蛋白三维结构的变化。牦牛HSFY是在睾丸中表达的多拷贝基因,经密码子偏好性分析,该基因编码的蛋白质偏好使用以A或T结尾的密码子。
- 曾贤彬王永刘仲娜马志杰海汀钟金城
- 关键词：牦牛精子发生
- CAPN1和CAST基因在牦牛不同组织中的表达差异研究被引量：7
- 2014年
- 为检测钙蛋白酶基因(CAPN1)和钙蛋白酶抑制基因(CAST)在牦牛心、肝、脾、肺、肾、胃、眼肌、腹肌等不同组织中的表达水平,采用实时荧光定量PCR技术分析这2个基因的表达规律。结果显示,CAPN1和CAST基因在牦牛的8种组织中均有表达,但在不同组织的表达量存在差异。CAPN1基因在眼肌中的表达量最高,其次为腹肌,在肌肉中的表达量显著高于内脏组织,内脏组织中,在肝脏的表达量最高,其次为肾脏,胃中的表达量最低;CAST基因在胃中的表达量最高,其次为眼肌、腹肌,在肾脏中的表达量最低。
- 姚慧陈智华钟金城曾贤彬柴志欣
- 关键词：牦牛CAPN1基因CAST基因实时荧光定量PCR基因表达差异
- 犏牛精子发生阻滞的比较转录组研究
- 犏牛是牦牛与普通牛的杂交后代，其F1代雄性不育是牦牛杂交改良中的一大难题。本文通过采用高通量测序技术(RNA-seq)分别对健康成年犏牛和牦牛的睾丸组织进行转录组测序和比较研究，探讨犏牛激素调节、精子发生和细胞凋亡等相关...
- 曾贤彬
- 关键词：犏牛牦牛转录组精子发生
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