张志清
- 作品数:9 被引量:109H指数:5
- 供职机构:西北农林科技大学动物科技学院陕西省农业分子生物学重点实验室更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家高技术研究发展计划河南省杰出人才创新基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 从Cyt b基因全序列分析中国10个黄牛品种的系统进化关系被引量:27
- 2006年
- 基于Cyt b基因全长序列,对我国10个地方黄牛品种的遗传多态性和系统发育关系进行了分析.中国黄牛Cyt b基因序列富含碱基A和T,A+T平均含量为56.7%,密码子第3位点核苷酸表现出较强的碱基组成偏倚,该位点上G的含量最低,为3.5%,而A的含量最高,为44.6%,核苷酸组成偏差指数为0.45.在47个个体1 140 bp的序列中检测到30个变异位点,约占核苷酸总数的2.63%,密码子第3位点的突变率(76.7%)远高于第1位点(16.7%)和第2位点(6.6%),第2位点的非同义替代率(100%)远高于第1位点(40%)和第3位点(4.3%).定义了15种单倍型.将10个品种作为一个大的种群分析时,发现中国黄牛Cyt b基因具有较高的单倍型多样性(Hd=0.783±0.046)和一定程度的核苷酸多样性(Pi=0.00828±0.00030),这与中国黄牛地理分布广、种群庞大和起源复杂有关系.基于Kimura 2-parameter距离采用UPGMA法构建的10个黄牛品种分子系统树中将47个个体分别与瘤牛和普通牛聚在一起,说明中国黄牛主要起源于瘤牛和普通牛.北方牛受普通牛的影响较大,南方牛受瘤牛的影响较大,但是对于亲缘关系复杂的中原地区黄牛而言,瘤牛和普通牛对它们的影响力大小因品种而异,因而它们分别和北方牛和南方牛之间的亲缘关系远近程度也存在差异.不同品种之间的亲缘关系差异可能与它们的地理分布差异具有一定的关系.
- 蔡欣陈宏雷初朝王珊张志清薛恺王新庄
- 关键词:黄牛CYTB基因遗传多态性系统进化
- 延边牛线粒体DNA D-loop序列多态性研究被引量:7
- 2005年
- 对4头延边牛个体与GenBank中4头朝鲜牛个体的线粒体DNA(mtDNA)D环(D-loop区)910bp全序列进行了比较分析。结果发现,8头黄牛个体mtDNAD-loop序列由8种单倍型组成,单倍型比例为100%,表明2个黄牛品种mtDNA遗传多态性很丰富;在4头延边牛D-loop区序列中,共检测到核苷酸多态位点17个,核苷酸变异率为1.87%;在4头朝鲜牛中共检测到核苷酸多态位点10个,核苷酸变异率为1.10%;延边牛和朝鲜牛mtDNAD-loop全序列突变类型均为转换、颠换和插入/缺失,其中以转换为主;序列分析显示朝鲜牛与延边牛的同源性很高,达98.90%~99.67%,表明朝鲜牛和延边牛亲缘关系很近。
- 王朝锋陈宏雷初朝孙维斌党瑞华张志清
- 关键词:延边牛MTDNAD-LOOP单倍型
- 晋南牛父系和母系起源研究
- 为了研究晋南牛的父系起源和母系起源,随机抽取30头晋南公牛,分别对Y染色体INRA124微卫星位点和线粒体DNACytb基因进行分析.Y染色体INRA124微卫星分析表明:30个个体中,具有132bp的等位基因约占总样本...
- 张志清陈宏刘波雷初朝张润锋蓝贤勇
- 关键词:晋南牛Y染色体CYTB母系起源
- 文献传递
- 秦川牛及其杂种牛生长性能及杂种优势研究?
- 通过对4月龄纯种秦川牛(QQ)67头,秦安杂种牛(秦川牛♀×红安格斯牛♂,AQ)36头、秦德杂种牛(秦川牛♀×德国黄牛♂,DQ)14头和秦利杂种牛(秦川牛♀×利木赞牛♂,LQ)47头,共计164头杂交一代牛生长发育性状特...
- 刘波陈宏蓝贤勇张志清张争锋胡沈荣张润峰
- 关键词:杂种优势
- 文献传递
- 秦川牛及其杂种牛POU1F1基因多态与生长性能相关性被引量:39
- 2005年
- 本研究首次利用PCR-RFLP技术研究相同季节4月(±10d)龄纯种秦川牛(QQ)及杂种牛秦安(AQ)、秦德(DQ)、秦利(LQ)4个群体164个个体POU1F1基因多态性及其与体重、体尺等生长性状指标之间的相关性。结果表明,QQ及AQ、DQ、LQ群体POU1F1-HinfI基因座的451bp的PCR产物被限制性酶HinfI消化后表现多态性,它们的等位基因A/B频率分别为:0.232/0.768、0.333/0.667、0.178/0.822和0.181/0.819,且均处于Hardy-Weinberg平衡状态。同时,4个群体POU1F1基因座不同基因型与体重、体尺等生长性状指标相关分析的结果表明,4个群体内AB、BB基因型个体在胸围、十字部高指标上显著高于群体AA型个体(P<0.05),即BB、AB>AA(P<0.05),可作为秦川牛体尺指标(胸围、十字部高)候选基因之一。但在体长指标上均无显著差异(P>0.05),所以不宜作为体长指标候选基因。初步认为BB基因型为优势基因型,相应地B为优势等位基因,对选择有正向效应。
- 刘波陈宏蓝贤勇雷初朝张志清张润锋
- 关键词:POU1F1基因多态性
- 秦川牛及其杂种牛生长性能及杂种优势研究被引量:24
- 2006年
- 通过对4月龄纯种秦川牛(QQ)67头,安秦杂种牛(红安格斯牛♂×秦川牛♀,AQ)36头、德秦杂种牛(德国黄牛♂×秦川牛♀,DQ)14头和利秦杂种牛(利木赞牛♂×秦川牛♀,LQ)47头,共计164头牛生长发育性状特点及杂种优势的研究,发现LQ、DQ、AQ与QQ相比,在体重、体长、体高、胸围、十字部高等重要指标上具有明显的杂种优势。初步鉴定3个杂交组合后代在生长性能方面优于秦川牛纯种,表现杂种优势,达到改良目的。其中LQ与其他两个杂交群体相比,在生长发育过程中表现出更好的发育趋势,即LQ>DQ>AQ>QQ,是较为理想的杂交组合,而AQ和DQ群体在后期发育和被毛颜色上有不可替代的优越性。
- 刘波陈宏蓝贤勇张志清张润峰
- 关键词:畜牧学杂种优势杂种牛
- 南阳牛mtDNA D—loop序列多态性分析被引量:3
- 2003年
- 本文对 3头南阳牛线粒体 DNA D- loop区 91 0 bp的核苷酸序列进行了分析。结果发现 ,3头南阳牛 D- loop区的核苷酸序列有 3种单倍型。南阳牛 1、2和 3号 D- loop区的平均核苷酸变异率分别为 0 .44%、4.84%和 0 .44% ,其高变区的平均核苷酸变异率分别为 0 .81 %、7.5 7%和 0 .0 0 %。南阳牛 1号的核苷酸变异类型只有转换一种形式 ,南阳牛 2号的核苷酸变异类型有转换、颠换、插入和缺失四种形式 ,南阳牛 3号的核苷酸变异类型有转换和插入两种形式。在 3头牛的核苷酸变异类型中 ,均以转换最常见。说明南阳牛 mt DNA D- loop区表现出丰富的核苷酸变异多态性。从线粒体D- loop区核苷酸序列的 3种单倍型分析 ,提示南阳牛可能有两种不同的母系起源。
- 雷初朝陈宏张志清杨公社雷雪芹孙维斌李瑞彪
- 关键词:南阳牛线粒体DNAD-LOOP多态性黄牛
- 晋南牛父系和母系起源研究被引量:3
- 2005年
- 为了研究晋南牛的父系起源和母系起源,随机抽取30头晋南公牛,分别对Y染色体INRA124微卫星位点和线粒体DNAcytb基因进行分析。Y染色体INRA124微卫星分析表明:30个个体中,具有132bp的等位基因约占总样本76.7%,表明晋南牛具有76.7%的普通牛父系血统;具有130bp的等位基因,约占总样本23.3%,表明晋南牛具有32.2%的瘤牛父系血统。cytb基因的HinfI酶切分析表明,在这31个个体中,没有发现牦牛和班腾牛的母系起源。
- 张志清陈宏刘波雷初朝张润锋蓝贤勇
- 关键词:晋南牛CYTB母系起源父系母系CYTB基因
- 中国四个黄牛品种的父系和母系起源研究
- 为了研究四个黄牛品种的父系和母系起源问题,本实验运用微卫星技术、PCR-RFLP技术和PCR-SSCP技术对Y染色体10个微卫星位点、线粒体DNACytb基因和Y染色体基因SRY基因HMG-box部分序列进行分析,我们得...
- 张志清
- 关键词:黄牛普通牛南阳牛鲁西牛晋南牛母系起源
- 文献传递