陈颖丽
- 作品数：30 被引量：66H指数：5
- 供职机构：内蒙古大学物理科学与技术学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金内蒙古自治区自然科学基金教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学理学更多>>
- 与m6A修饰和免疫基因相关的长链非编码RNA在前列腺癌中的作用
- 2023年
- 前列腺癌是男性癌症死亡的第二大原因,前列腺癌患者五年生存率仅为30%。m6A修饰和长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)在前列腺癌的预后中起着非常重要的作用。因此,研究m6A与lncRNA之间的关系对改善前列腺癌患者的预后生存将有所帮助。本文研究了与m6A相关的lncRNA和与免疫基因相关的lncRNA,通过LASSO分析构建了基于六个lncRNA基因的预后模型,将前列腺癌样本分为高、低风险组,KM生存分析显示高风险组患者预后较差。通过单因素和多因素分析发现该模型可能是预测前列腺癌患者的独立因素。通过突变数据分析发现肿瘤突变负荷与该模型存在密切联系;免疫浸润分析得出高、低风险组中免疫细胞浸润存在差异;GO和KEGG分析结果发现m6A修饰主要富集在肌肉收缩、离子通道活性上。这些研究结论有望提高前列腺癌患者的预后生存率。
- 吉永福陈颖丽
- 关键词：前列腺癌长链非编码RNA
- 多种信息融合的细胞凋亡蛋白质的亚细胞定位预测
- 2016年
- 研究表明mRNA的序列和结构特性与蛋白质的亚细胞定位有一定关系。本文提取了细胞凋亡蛋白质的两种mRNA信息:三阅读框3-mer mRNA序列频数信息、mRNA二级结构-序列模式信息,并结合细胞凋亡蛋白质的氨基酸物理化学性质、氨基酸黏性特征和进化信息,构成特征向量来表示mRNA和蛋白质序列,利用支持向量机算法,对四种不同亚细胞位置的细胞凋亡蛋白质进行预测。研究发现融合mRNA信息与氨基酸信息后预测效果更佳,在Jackknife检验下,预测总精度达到82.18%,且独立测试集预测总精度达到78.26%。结果表明,mRNA的序列和结构特性有助于细胞凋亡蛋白质的亚细胞定位预测。
- 薛济先陈颖丽翟媛媛
- 关键词：MRNA二级结构亚细胞定位
- 与肺癌相关的基因共表达网络的构建与分析
- 2016年
- 肺癌是目前世界范围内发病率和死亡率最高的恶性肿瘤,它是一种复杂的分子网络疾病。为了进一步了解肺癌致病的分子机制,我们使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)方法,对肺癌组织与其癌旁正常组织的差异表达基因进行分析,进而对差异表达基因进行模块的划分以及枢纽基因(hub gene)的识别,共得到了八个模块。通过计算每个模块特征向量基因(module eigengene)与样本特征的皮尔森相关系数,最终得到一个与肺癌高关联的模块(blue模块),发现blue模块的枢纽基因为碳酸酐酶4 (carbonic anhydrase 4, CA4),这一枢纽基因在模块中起着重要的作用。使用在线工具DAVID (Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)对blue模块进行GO功能富集及KEGG通路分析。GO分析显示blue模块具有Rho 蛋白的信号转导调控、生物粘附、糖结合等生物功能;KEGG分析显示blue模块参与了轴突导向和O 型聚糖的生物合成通路。这些分析结果表明,文中识别的肺癌高关联模块和枢纽基因在肺癌的发生发展过程中起着潜在的重要作用。
- 翟媛媛陈颖丽薛济先
- 关键词：肺癌
- 不同亚细胞位置的细胞凋亡蛋白质的结构特性分析
- 2009年
- 细胞凋亡蛋白质是一类与人类疾病密切相关的蛋白质,在肿瘤、神经退行性疾病等病理过程中都有细胞凋亡存在。
- 陈颖丽李前忠
- 关键词：细胞凋亡结构特性
- 蛋白质亚细胞定位、功能模体和相关问题的理论研究
- 李前忠陈颖丽李凤敏
- 该项目所属科学技术领域为生物信息学和理论生物物理学。主要研究内容及发现点：蛋白质的亚细胞定位研究是蛋白质功能研究的基础，了解蛋白质的亚细胞定位信息，可以为推断蛋白质的生物学功能提供必要的帮助，同时也是解释蛋白质功能的重要...
- 关键词：
- 关键词：生物信息学理论生物物理学蛋白质
- 基于多信息融合的长链非编码RNA的亚细胞定位预测
- 2020年
- 长链非编码RNA(lncRNA)的亚细胞位置信息对于了解其复杂的生物学功能和生物学过程具有重要的意义。建立了一个lncRNA的亚细胞定位数据集,包括细胞核、细胞质基质、核糖体和外泌体四个位置,提取了lncRNA的多种特征信息,并对各类特征进行了特征融合。在利用SMOTE(Synthetic Minority Oversampling Technique)方法对数据集进行平衡优化的基础上,采用支持向量机(SVM)算法对lncRNA的亚细胞定位进行分类预测。Jackknife检验结果显示总体预测成功率可达98.54%,表明所提取的特征信息对于lncRNA的亚细胞定位预测有很好的效果,可以为了解lncRNA的生物学功能提供帮助。
- 尤晓庆郭东华陈颖丽
- 关键词：长链非编码RNA亚细胞定位SMOTE
- 不同亚细胞位置的细胞凋亡蛋白质的结构特性分析
- ＜正＞细胞凋亡蛋白质是一类与人类疾病密切相关的蛋白质,在肿瘤、神经退行性疾病等病理过程中都有细胞凋亡存在。由于这些蛋白质在生物体的生长发育和动态平衡中起重
- 陈颖丽李前忠
- 关键词：细胞凋亡结构特性
- 文献传递
- 利用生物系统超弱光子辐射研究电场对作物种子的影响被引量：6
- 1998年
- 利用生物系统超弱光子辐射研究电场对作物种子的影响郭维生，张利绒，陈颖丽，赵国军，申燕伟，李凤敏，杨体强，冯璐（内蒙古大学物理学系，０１００２１，呼和浩特）ＴｈｅＳｔｕｄｙｏｆｔｈｅＥｆｅｃｔｓｏｆＥｌｅｃｔｒｉｃＦｉｅｌｄｏｎｔｈｅＣｒｏｐＳｅｅｄｓ...
- 郭维生张利绒陈颖丽赵国军申燕伟李凤敏杨体强冯璐
- 关键词：生物系统超弱光子辐射电场种子处理
- 应用物理专业数学物理方法课程的教学改革初探
- 本文结合作者的教学实践，针对应用物理专业类课程，对数学物理方法在教学内容、教学手段和培养学生创新能力等方面的改革进行了初步探索与尝试。
- 陈颖丽
- 关键词：教学改革
- 基于化学位移和伪氨基酸组分信息预测抗凋亡蛋白质与促凋亡蛋白质
- 2014年
- 凋亡蛋白质是一种有着特殊功能的蛋白质,在生物体的生长和维持体内平衡中扮演着重要的角色.在细胞凋亡过程中抗与促凋亡蛋白质对细胞凋亡的调控起着不同的作用.如果抗凋亡蛋白质或者促凋亡蛋白质失活,将导致癌症和其它疾病的发生,所以对抗凋亡蛋白质和促凋亡蛋白质的识别,将有助于更好的了解凋亡蛋白的致病机理.建立一个新的凋亡蛋白质数据集,并基于化学位移信息和伪氨基酸组分信息采用支持向量机(SVM)方法对新的数据集进行了预测.融合后的特征信息用Jackknife检验预测成功率达到77.01%,从预测结果可以看出提取有效的特征信息是提高预测成功率的重要因素.
- 于淼陈颖丽
- 关键词：化学位移支持向量机
