陈华云
- 作品数:35 被引量:66H指数:5
- 供职机构:中山大学达安基因诊断中心更多>>
- 发文基金:国家科技重大专项国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 多重实时荧光定量PCR检测急性肝炎患者HBV和HCV方法的建立与意义分析被引量:2
- 2014年
- 目的建立一种新的可以快速筛查急性肝炎患者HBV和HCV感染的多重实时荧光定量PCR方法。方法收集596例急性肝炎患者血清或血浆样本,应用自主构建的多重实时荧光定量PCR方法同时检测HBV和HCV,同时应用HBV和HCV单管检测试剂进行检测分析。结果新建立的多重实时荧光定量PCR体系,可以有效地检测HBV和HCV的阳性质控品及阳性样本。多重实时荧光定量PCR体系特异性较好,检测HBV和HCV时,两者之间无交叉反应,且以多种血浆病毒的核酸样品为模板进行检测时结果全为阴性;多重实时荧光定量PCR体系检测HBV、HCV的灵敏度分别为20 IU/ml、50 IU/ml;多重实时荧光定量PCR体系精密度好,检测HBV、HCV的CV值分别为0.11%、0.096%。在检测临床样本时,多重复合体系检测血清或血浆中HBV和HCV的检出率与单独检测HBV和HCV具有很好的一致性,且HBV和HCV的一致率分别达到97.7%(k=0.952)、98.8%(k=0.976);同时有6例样本出现HBV和HCV共感染。结论新型多重实时荧光定量PCR方法对快速检测及筛查HBV和HCV较快捷,而且特异性好、灵敏度高、精密度好。因此多重实时荧光定量PCR方法对2种肝炎病毒的检测具有重要意义。
- 陈泽惠李欣钰肖湘文丁渭刘淑园陈华云
- 多重PCR点突变筛查技术在CYP2C19基因分型中的应用被引量:4
- 2011年
- 目的建立一种多重PCR点突变筛查技术,用以细胞色素氧化酶P4502C19(CYP2C19)的基因分型。方法设计含有拱桥式次黄嘌呤的多重PCR引物(DMP)。在一个PCR管内,同时检测CYP2C19的。*1、*2、*3等位基因。结果多重PCR点突变筛查技术,最低检测下限可以达到2.8ng,具有较高的检测灵敏度。其成功检出248份健康人抗凝静脉血CYP2C19等位基因*1、*2、*3。并与部分标本测序法结果比较,结果与测序法结果完全一致。结论成功建立了多重PCR点突变筛查技术,该技术特异性高、操作简单、价格低廉,为基础研究、个体化用药提供了合理可靠的检测手段。
- 高云陈嘉昌王侦彭焕玉李明朱振宇陈华云
- 关键词:细胞色素C氧化酶基因分型
- 基于游离RNA的无创性产前诊断研究进展被引量:4
- 2011年
- 孕妇血浆血清中游离RNA作为一种新的胎儿遗传信息材料给无创性产前诊断带来了新的契机。已经证实,游离胎儿RNA分子主要来源于胎盘,且稳定存在于母体血循环中,易于检测。同时,其由于无需依赖胎儿性别或父源性多态性位点而具有十分明显的应用优势。目前,已经有研究将血浆血清中游离RNA与胎儿非整倍体、宫内发育迟缓以及子痫前期等妊娠相关疾病联系起来,并且取得了十分可喜的研究成果。
- 王侦陈嘉昌陈华云朱振宇
- 关键词:胎儿非整倍体宫内发育迟缓子痫前期无创性产前诊断
- 人脑胶质瘤ERCC2 mRNA表达与化疗药物敏感性的关系被引量:1
- 2007年
- 背景与目的:以往细胞株的研究提示,核苷酸切除修复系统中的重要因子ERCC2表达与BCNU耐药相关,然而在人脑胶质瘤是否同样如此,还没有明确资料。本研究将对人脑胶质瘤临床标本进行体外药敏试验,并分析其与ERCC2表达的关系。方法:在人脑胶质瘤手术时收集新诊断的原发性胶质瘤新鲜标本61例,采用MTT法进行体外药敏试验,测定脑瘤常用化疗药DDP、BCNU、VCR和VM26的敏感性。并对收集的肿瘤标本采用实时定量RT-PCR方法检测ERCC2mRNA的表达,然后对二者结果进行相关性分析。结果:体外药物敏感性检测中,49例样本获得成功检测,成功率达到80%。体外药敏结果在49例样本中差别较大。四种化疗药物DDP、BCNU、VCR和VM26在血浆峰浓度下的肿瘤生长抑制率(IR)分别为(37.8±2.6)%、(29.7±3.1)%、(31.3±2.7)%和(40.7±2.7)%。49例肿瘤标本的ERCC2mRNA相对表达范围较广,为0.01 ̄10.50。相关性分析显示ERCC2表达同BCNU敏感性负相关(Spearman相关系数为-0.373,P=0.004),而与DDP、VCR以及VM26的敏感性没有统计学意义。结论:人脑胶质瘤组织中ERCC2mRNA表达与BCNU敏感性相关,但与DDP、VCR和VM26的体外敏感性无关。
- 陈华云陈芙蓉邵翠杰牟永告赛克魏大年张湘衡关皑丽陈忠平
- 关键词:BCNUERCC2核苷酸切除修复胶质瘤
- DNA修复基因ERCC1启动子区甲基化与胶质瘤放射敏感性的相关性研究被引量:8
- 2007年
- 背景与目的:胶质瘤的放射治疗效果与其放射敏感性密切相关,有许多因素影响着胶质瘤的放射敏感性。研究已经发现某些基因启动子区CpG岛的甲基化会导致基因的表达沉默,从而影响肿瘤放射敏感性。本文初步探讨了DNA修复基因ERCC1启动子区CpG甲基化与脑胶质瘤放射敏感性的关系。方法:培养4种胶质瘤细胞株MGR1、MGR2、SF767、T98G,集落形成实验法检测其放射敏感性,以2Gy照射后细胞存活集落数(SF2)作为标准表示。应用亚硫酸氢钠修饰后测序的方法对4株细胞中ERCC1基因启动子区CpG岛的甲基化状态进行分析。进而分析其甲基化状态与放射敏感性的关系。结果:4种胶质瘤细胞株的放射敏感性存在较大差异,SF2均数范围从0.18到0.70;在ERCC1启动子区CpG为去甲基化状态细胞株的SF2值较高(MGR1,0.59±0.09;T98G,0.70±0.05),表示对放射线较抗拒;ERCC1启动子区CpG为甲基化状态细胞株的SF2值较低(MGR2,0.18±0.05;SF767,0.32±0.08),表示对放射线较敏感(t=-4.43,P<0.05)。结论:ERCC1启动子区CpG甲基化状态可能与胶质瘤细胞株放射敏感性相关,有希望成为预测胶质瘤放疗敏感性的新指标。
- 刘志刚陈华云夏云飞关皑丽陈忠平
- 关键词:胶质瘤甲基化表观遗传学
- 一种实时荧光RT-PCR检测脊髓灰质炎病毒的试剂盒
- 本发明公开了一种实时荧光RT-PCR检测脊髓灰质炎病毒的试剂盒,包括RNA提取试剂、脊髓灰质炎RT-PCR反应体系、阴性质控品和阳性质控品,所述脊髓灰质炎RT-PCR反应体系包括脊髓灰质炎引物探针混合液、RT-PCR反应...
- 陈瑶李明杜红延陈华云高秀洁
- 文献传递
- 多基因甲基化畸变在胃癌转移和侵袭中的作用机制研究
- 在世界范围内,胃癌是排名第四位的最常见恶性肿瘤,排名第二位的致死性肿瘤。在我国,胃癌是头号肿瘤杀手,约占全部肿瘤死亡患者的20%以上。胃癌患者死亡的最主要原因是肿瘤转移,其中淋巴道转移是影响胃癌治疗和预后的关键因素。近年...
- 陈华云
- 关键词:胃癌肿瘤转移负性调控表观遗传学
- 应用MGB探针检测人乙型肝炎病毒的基因型
- 2014年
- 目的检测血浆或血清样本中人乙型肝炎病毒HBV的基因型,建立了基于MGB探针的实时荧光定量PCR检测体系。方法在HBV基因组型特异性碱基的聚集区域设计荧光定量PCR引物及探针,为保证特征特异性及高分辨率,选择设计MGB探针,然后将PCR扩增的产物纯化后进行基因克隆,克隆成功后提取的质粒制备为阳性质控品,从而建立完整的MGB探针法的荧光定量PCR检测体系,最后对该检测体系进行方法学评价。结果成功建立了基于MGB探针的HBV荧光定量PCR的基因分型检测体系。方法学评价显示,该检测体系的灵敏度达50 IU/mL;重复性好;特异性良好,以多种血浆病毒的核酸样品为模板进行检测时结果全为阴性。结论本研究建立基于MGB探针的HBV荧光定量PCR的基因分型检测方法,可以很好地定性的检测血浆或血清样本及血液制品中的人乙型肝炎病毒HBV的基因型及含量,对于该疾病的临床治疗具有重要的意义。
- 陈泽惠李欣钰肖湘文丁渭刘淑园陈华云
- 关键词:荧光定量PCR
- 乳腺癌组织HER2/neu基因表达的研究
- 该研究的目的是以TaqMan技术为基因建立荧光定量RT-PCR检测HER2/neu基因mRNA表达的方法,通过对不同病理类型原发性乳腺癌患者组织中HER2/neu基因mRNA的定量,初步了解HER2/neu基因mRNA在...
- 陈华云
- 关键词:乳腺癌荧光定量RT-PCR基因表达
- 文献传递
- 改进的反向斑点杂交方法被引量:1
- 2011年
- 目的改进反向斑点杂交的操作方法,探索更为简便快捷的实验流程。方法优化杂交液II的组分,使用HPV基因分型、β-地中海贫血基因突变和HBV基因分型三个试剂盒验证改进的实验方法。结果 HPV基因分型、β-地中海贫血基因突变和HBV基因分型试剂盒的实验结果证实,使用优化后的杂交液II,链霉亲和素过氧化物酶在杂交温度能够有效地与生物素结合,试剂盒的灵敏度不受影响且膜条的背景低。结论改进的反向斑点杂交方法不影响试剂盒的灵敏度,并且操作简便、实验时间短、实验结果背景低。
- 林炳生张太松胥顺董瑞华陈华云李明程钢
- 关键词:反向斑点杂交