郑丹凤
- 作品数：9 被引量：15H指数：2
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- 相关领域：医药卫生更多>>
- 324份新冠病毒感染者咽拭子标本qRT-PCR检测结果分析被引量：3
- 2021年
- 目的探讨新型冠状病毒(新冠病毒)感染后病毒载量变化规律,比较感染者不同种类标本核酸检测结果一致性。方法以2020年1月21日至2020年3月18日泉州市报告的48例新冠病毒感染者为对象,依据实时荧光定量反转录多聚酶链反应(qRT-PCR)咽拭子核酸检测结果,分为未复阳组29例和复阳组19例,回顾性分析所采集的324份咽拭子标本、55份深咳痰标本及36份肛拭子标本的核酸检测结果。结果未复阳组和复阳组发病到核酸检测CT值达峰值时间间隔分别为(7.1±4.8) d、(6.4±4.8) d,差异无统计学意义;未复阳组在CT值达峰值后病毒载量下降,发病后(20.7±5.7) d连续两次核酸检测阴性;复阳组病毒载量在CT值达峰值后病载下降中反跳出现第二峰,发病后(29.9±6.1) d连续两次核酸检测阴性,时间间隔比未复阳组长(t=-3.84,P<0.01);不同种类标本(采集时间、对象相同)核酸检测结果比较显示,咽拭子标本与深咳痰标本检测结果Orf1ab基因一致性差、N基因一致性一般(Kappa值<0.00、Kappa值=0.30);咽拭子标本与肛拭子标本检测结果Orf1ab基因一致性较差、N基因一致性一般(Kappa值=0.15、0.29);深咳痰标本两种基因检出率均高于咽拭子标本(配对χ^(2)值=6.50、15.43,P<0.01)。结论新冠病毒感染者中未复阳组与复阳组病程中病毒载量变化峰型不同,且复阳组发病至连续两次核酸检测阴性时间间隔较长,原因有待探究;不同种类标本的核酸检测结果,以N基因结果一致性均略好,深咳痰、咽试子标本基因检出率前者高于后者。
- 陈晓玲郑友限刘建忠陈志扬郑丹凤龚彩婷吴小凤黄晓伟
- 关键词：KAPPA值
- 泉州市2017—2020年手足口病病原学监测结果被引量：2
- 2022年
- 目的对泉州市手足口病(HFMD)实验室监测结果进行分析,掌握HFMD病原学变化情况,为防控提供依据。方法对2017—2020年各县(市、区)哨点医院送检的2083份院内首次就诊的手足口病例咽拭子标本,用荧光定量RTPCR方法进行肠道病毒核酸检测并分析数据。结果2083份咽拭子标本中多种肠道病毒(HEV)总阳性率为80.5%;肠道病毒病原分型结果显示EV71占4.9%,CA16占22.0%,非EV71、非CA16占73.1%;阳性数在5~6月和8~10月形成高峰;以<5岁的儿童为主(91.4%);男女比例2.0:1。结论2017—2020年泉州市HFMD非EV71非CA16肠道病毒占比较高。应加强对肠道病毒其他型别的监测,及时发现病原转变,为防控提供依据。
- 郑丹凤黄晓伟陈志扬郑友限陈晓玲
- 关键词：手足口病病原学监测
- 食源性致病菌检测方法改进结果分析
- 2013年
- 目的了解泉州市食源性致病菌污染状况,探讨更为快速、敏感和特异的食源性致病菌检测方法,为食品污染物监测提供技术支持。方法按福建省2012年食源性致病菌监测实施方案要求,采集泉州市7类食品共212份样品进行检测,并对常规致病菌分离培养法和Real-time PCR法的检测结果进行比较分析。结果本市食品存在食源性致病菌污染,检测市售食品样品212份,7类食品中共致病菌检出率为8.0%,以蜡样芽胞杆菌检出率最高,尤其在熟制米面制品中。结论我市食品卫生状况不容乐观,在食源性致病菌检测中,可将常规致病菌分离法与Real-time PCR法进行结合,既可提高食源性致病菌检出率,又可缩短时间,提高食品污染物监测敏感性,值得基层实验室推广使用。
- 陈培蓉林碧莲杨育红郑丹凤陈志扬陈明春
- 关键词：食源性致病菌REAL-TIMEPCR病原检测食品安全
- 2014—2017年泉州地区急性胃肠炎暴发疫情中诺如病毒的病原特征被引量：5
- 2019年
- 目的分析泉州地区2014—2017年急性病毒性胃肠炎疫情的病原学特征.方法收集泉州地区2014—2017年15起急性病毒性胃肠炎暴发疫情期间的患者标本,采用实时荧光定量PCR方法检测诺如病毒GⅠ/GⅡ型、扎如病毒、星状病毒及轮状病毒,对检测结果进行统计学分析;诺如病毒检测阳性的标本,对其多聚酶和衣壳蛋白基因VP1区进行PCR扩增并测序,并用DNAstar和MEGA7.0软件进行序列分析.结果本研究共采集96份来源于15起急性病毒性胃肠炎暴发疫情的患者临床标本,共检出诺如病毒30份,阳性率为31.25%,其中GⅡ型23份、GⅠ型7份;随机选择10份阳性标本进行核酸序列分析,其中9份为GⅡ.P16/GⅡ.2亚型,1份GⅠ.6亚型.系统进化树分析表明该GⅡ.P16/GⅡ.2亚型诺如病毒新重组株与近期国内外暴发流行的GⅡ.P16/GⅡ.2亚型高度同源.结论引起泉州地区2014—2017年急性病毒性胃肠炎暴发疫情的主要病原为诺如病毒GⅡ.P16/GⅡ.2亚型和GⅠ.6亚型;其中GⅡ.P16/GⅡ.2亚型在泉州地区首次出现,为近期优势毒株.
- 郑友限陈志扬郑丹凤刘江艺吴小凤陈明春
- 关键词：诺如病毒病毒性胃肠炎进化分析
- 泉州市儿童非流感急性呼吸道感染病例病毒病原谱分析被引量：2
- 2023年
- 目的了解泉州市儿童非流感急性呼吸道感染(ARI)病例病毒病原谱特征。方法以2021年2月至2022年1月于泉州市儿童医院就诊的非流感儿童ARI病例为研究对象,采用实时荧光定量聚合酶链式反应法(qPCR)检测7种常见呼吸道病毒,包括鼻病毒(HRV)、呼吸道合胞病毒(RSV)、副流感病毒(HPIV)、腺病毒(HAdV)、人偏肺病毒(HMPV)、冠状病毒(HCoV)和人博卡病毒(HBoV),并对阳性标本基因分型,分析病毒病原谱分布特征。结果192例非流感ARI儿童病例病毒检出率45.3%(87例,至少检出1种病毒),7种病毒检出率由高到低:HRV(14.6%,28例)、RSV(14.1%,27例)、HPIV(13.5%,26例)、HAdV(4.7%,9例)、HCoV(1.6%,3例)、HBoV(1.0%,2例)和HMPV(0.5%,1例)。病毒总检出率以夏秋季较高(χ^(2)=10.99,P<0.05);不上学儿童病例检出率(51.8%)较上学高(36.6%,χ^(2)=4.40,P<0.05)。基因分型显示,27例RSV中,RSV-A占59.3%(16例)、RSV-B占33.3%(9例),分型阴性占7.4%(2例);26例HPIV中,HPIV-3检出占42.3%(11例)、HPIV-1占23.1%(6例)、HPIV-4占15.4%(4例)、HPIV-2占7.7%(2例),HPIV亚型间的双重感染占11.5%(3例);此外3例HCoV分型结果为2例OC43型、1例NL63型;1例HMPV分型为B型。87例阳性病例中单重感染占86.2%(75例),双重感染13.8%(12例),检出混合感染病毒有HCoV、HPIV、HRV、HAdV、RSV。结论泉州市非流感感染儿童ARI病例病毒病原谱分布广泛且各病毒分布存在差异,应加强该人群病毒多病原监测,逐步完善监测系统及预警机制。
- 陈晓玲江靖郑友限潘淑萍郑丹凤龚彩婷刘建忠
- 关键词：儿童病原谱
- 泉州市肾综合征出血热疑似病例与部分地区宿主动物监测结果
- 2024年
- 目的分析泉州市肾综合征出血热(HFRS)疑似病例及部分地区宿主动物监测结果,为出血热防控提供依据。方法用描述性流行病学方法分析2020年3月至2024年2月泉州市779例HFRS疑似病例血清学及部分地区宿主动物监测结果。结果泉州市2020—2023年HFRS发病率总体呈下降趋势(趋势χ^(2)=9.95,P<0.01);HFRS疑似病例抗体阳性率14.9%(116/779),其中汉坦病毒(HV)核酸检出率69.8%(81/116);基因分型中汉城病毒(SEOV)型占97.5%(79/81);发病高峰在春夏季;抗体阳性病例主要在晋江市、南安市和石狮市;男女性别比1.5:1,以50~69岁组为主;职业分布以农民为主,其次为家务/待业人员;宿主动物监测点共捕获鼠形动物652只,褐家鼠为优势种;鼠形动物HV感染率5.8%(38/652),均为SEOV型;各鼠种中感染率最高者是褐家鼠9.9%(36/365,χ^(2)=24.68,P<0.01)。结论泉州地区HFRS疫情总体呈下降趋势,主要由SEOV型引起,褐家鼠为优势鼠种。建议加强重点地区和人群监测,及时采取针对性的防控措施。
- 郑丹凤陈志扬龚彩婷林满芳
- 关键词：基因分型褐家鼠
- 泉州地区2014～2017年H7N9禽流感病毒感染患者的临床和病毒特点分析被引量：1
- 2018年
- 本研究对福建省泉州地区2014~2017年12例H7N9禽流感病毒感染患者的临床特点和病毒基因特点进行了分析。结果显示,泉州市实验室确诊H7N9禽流感病毒感染患者的总体病死率（2/12,17%）低于全国平均水平,其流行病学特征与临床特点（C反应蛋白和低密度脂蛋白升高以及淋巴细胞减少症较常见）与中国其他地区报道的人感染H7N9疫情中感染患者的结果一致;不同的是,谷草转氨酶、谷丙转氨酶、肌酸激酶升高的患者以及出现白细胞减少症的患者比例较低。所获得的三个患者的HA和NA基因序列分析显示,泉州地区患者感染的H7N9禽流感病毒都属于长江三角洲谱系,且亲缘关系近;3株病毒HA蛋白的裂解位点均为PKGR/G,没有出现高致病性突变,NA蛋白292位氨基酸也没有出现奥司他韦（达菲）耐药突变,但PB2蛋白中都出现了与毒力相关的E627K突变。泉州地区H7N9禽流感病毒患者的临床特点和病毒基因特征可为人感染H7N9病毒的病原学监测及疫情的科学防控和风险评估提供参考依据。
- 郑友限陈明春陈志扬刘建忠郑丹凤吴小凤张超颖李锋平
- 关键词：禽流感病毒病毒特征
- 泉州市2022-2023年新冠病毒Omicron变异株基因组特征及S蛋白突变位点动态分析
- 2024年
- 本研究旨在了解泉州市新型冠状病毒(Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)流行株的基因型别分布及全基因组特征,动态研究S蛋白关键结构域的突变规律。采用纳米孔测序获取2022年3月至2023年6月泉州市新冠病毒监测病例毒株的全基因组序列,对数据过滤后的641条优质序列进行基因型别鉴定、序列比对及突变位点统计,通过聚类热图动态分析S蛋白关键结构域的氨基酸突变规律,借助VarEPS系统完成变异对病毒传播和适应性影响评估。监测期间泉州地区流行株均为Omicron变异株,总体呈BA.2-BA.5-XBB谱系顺序更替,与同期全国流行趋势基本一致;核苷酸与氨基酸突变位点数分别为81个(79~84个)、57个(55~62个)且逐步增加;S蛋白RBM区有氨基酸变异更替现象,如G446V到G446S、T478K到T478R/N、F486I/V到F486S/P;近期在非BA.2.75流行期间频繁检出BA.2.75于NTD区的高频突变位点,如W152R、F157L、I210V且有上升趋势;不同时期在Furin裂解点或S2亚基区可检出不同的氨基酸突变,与同期流行株基因型别更替相关。这些氨基酸突变均可一定程度上降低S蛋白与中和抗体的稳定性,但对其与ACE2的结合状态改变不大,多为中性突变。从基因层面开展新冠病毒变异动态监测,可以帮助我们掌握区域基因型别特征及病毒变异进化规律,探索变异对病毒传播和适应性影响,及时预警关键变异。
- 陈晓玲郑丹凤龚彩婷郑丹凤郑友限龚彩婷陈霖霖王伟明
- 关键词：新型冠状病毒S蛋白
- 泉州地区2014—2015年手足口病病原检测结果分析被引量：2
- 2017年
- 目的分析泉州地区手足口病病原检测结果,了解其病原学特征,为防控提供依据。方法通过手足口病监测网络平台,收集2014—2015年泉州各监测哨点医院送检的1 225份疑似患者咽拭子标本,用实时荧光RT-PCR法先进行肠道病毒通用型(EV)核酸检测,对阳性标本再进行肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇肠道病毒A16型(CoxA16)分型,分析检测结果。结果 1 225份标本中,手足口病EV核酸阳性标本936份,阳性率76.4%;2015年阳性率(83.7%)高于2014年(68.3%);其中EV71型占32.7%,CoxA16型占17.4%,其他肠道病毒型占49.9%。发病高峰在3~6月。肠道病毒感染以1~3岁儿童为主,男性高于女性。结论 2014—2015年泉州市手足口病存在季节、人群及地区分布差异,主要病原为其他肠道病毒和EV71,应引起重视。
- 郑丹凤张超颖陈志扬郑友限
- 关键词：手足口病病原学特征肠道病毒
