葛宇清
- 作品数：25 被引量：110H指数：7
- 供职机构：浙江中医药大学附属第一医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金浙江省自然科学基金浙江省教育厅科研计划更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 牛茄子叶绿体全基因组特征及系统发育分析
- 2024年
- 目的以牛茄子Solanum capsicoides新鲜叶片为材料,对叶绿体基因组序列进行组装、注释和分析,探究牛茄子的序列特征和同属其他物种的系统发育关系。方法基于Illumina HiSeq高通量测序,获得牛茄子完整叶绿体基因组序列,利用生物信息学方法进一步对其功能及特征、密码子偏好性、IR区域边界、核苷酸多样性、系统发育关系进行分析。结果牛茄子叶绿体基因组全长为155465 bp,为典型的四分体结构,总GC含量为37.85%,其中大单拷贝区、小单拷贝区和反向重复序列的长度分别为88265、18462、24369 bp;共编码131个基因,包括86个蛋白编码基因、37个tRNA基因、8个rRNA基因。简单重复序列检测表明,叶绿体基因组包括51个SSR位点,其中以A和T组成的单核苷酸重复次数最多,占45.1%。密码子偏好性分析表明,亮氨酸是使用频率最高的氨基酸,AUU是使用次数最多的密码子,密码子偏向使用A/U结尾。属内叶绿体基因组比较分析显示,IR边界区域相对保守,但仍存在部分基因扩张和收缩等现象;核苷酸多样性分析获得了4个高突变热点:trnQ-psbK、psbF-psbE、clpP、ycf1,可作为物种鉴定和遗传多样性研究的潜在特征。系统发育分析显示牛茄子和喀西茄的亲缘关系更近,存在姐妹关系。结论牛茄子叶绿体基因组的组装和系统发育分析,为茄属植物的分类和群体间遗传多样性的研究提供理论依据。
- 龚秋怡董姝洁许琴葛宇清
- 关键词：茄属叶绿体基因组密码子偏好性系统发育分析
- 桔梗皂苷D联合伊马替尼对K562细胞的增殖抑制作用及机制研究
- 2017年
- 目的探讨桔梗皂甙D(platycodin,PD)与伊马替尼(imatinib,IM)联合用药抑制慢性粒细胞白血病细胞株K562的作用及机制研究。方法体外培养CML细胞株K562,CCK-8测定PD和IM单药及联合用药对K562细胞增殖的抑制作用;流式细胞仪检测Annexin V/PI标记的细胞凋亡率,Western blot方法检测cleaved caspase-3、cleaved caspase-9、PARP、cleaved PARP、Bcr/abl、p-AKT、p-m TOR蛋白表达。结果联合用药组对K562细胞的增殖抑制作用和诱导细胞凋亡率较单独用药组效果明显,差异均有统计学意义(均P<0.01)。与单药组比较,联合用药组可以明显上调cleaved caspase-3、cleaved caspase-9、cleaved PARP蛋白表达,同时下调PARP、Bcr/abl、p-AKT、p-m TOR蛋白的表达,差异均有统计学意义(P<0.01或0.05)。结论 PD与IM联合用药在抑制细胞增殖、诱导凋亡、抑制Bcr/abl蛋白和PI3K/AKT/m TOR信号通路方面明显优于单独用药。
- 代群葛宇清
- 关键词：伊马替尼K562BCR/ABL融合基因
- 一种基于表达趋势的微小核糖核酸靶基因预测方法
- 本发明根据微小核糖核酸与靶基因的信使核糖核酸具有负相关的特点，从配对的微小核糖核酸与基因的信使核糖核酸的表达谱出发，找到了一种可行的表达趋势的微小核糖核酸靶基因预测的生物信息学方法，可直接针对微小核糖核酸的靶基因进行锁定...
- 陈喆吴剑丙刘培潘辉葛宇清
- 文献传递
- 桔梗皂苷D联合伊马替尼对白血病耐药细胞K562/R的抑制增殖和作用机制研究被引量：4
- 2018年
- 桔梗皂苷D（platycodin D,PD）对多种恶性肿瘤有显著抑制作用,对白血病细胞有明显的增殖抑制和诱导凋亡的作用,但其是否有效提高耐药细胞对伊马替尼的敏感性及其发挥功能的分子机制仍未阐明。为了研究PD与伊马替尼（imatinib,IM）联合用药对慢性粒细胞白血病耐药细胞株K562/R的作用及机制。细胞增殖实验检测桔梗皂苷D对伊马替尼增殖抑制功能的影响,采用CCK8测定PD和IM单药及联合用药对K562/R增殖的抑制作用;流式细胞术检测Annexin V-FITC/PI双标记细胞凋亡率的变化,Western blot法检测cleaved caspase-3,cleaved caspase-9,PARP,cleaved PARP,Bcr/abl,p-AKT,p-mTOR蛋白表达。结果显示桔梗皂苷D联合伊马替尼对K562/R细胞的增殖抑制作用和细胞凋亡率比单独用药组效果明显。Western blot法检测结果显示与单药组比较,联合用药组可以明显上调cleaved caspase-3,cleaved caspase-9,cleaved PARP蛋白表达,同时下调PARP,Bcr/abl,p-AKT,p-mTOR蛋白的表达。结果表明桔梗皂苷D可以提高耐药细胞对伊马替尼的敏感性,联合用药在抑制细胞增殖、诱导凋亡、抑制Bcr/abl蛋白和激活PI3K/AKT/mTOR信号通路方面明显优于单独用药。
- 代群葛宇清
- 关键词：桔梗皂苷D伊马替尼BCR/ABL融合基因
- 一种海马药材基因组DNA提取方法
- 本发明一种海马药材基因组DNA提取方法，针对海马药材中表面杂质与真菌、螨虫等污染物多的特点，经本发明清洗液清洗后，有效去除表面的杂质和内部污染物；针对海马药材加工和储藏过程中导致基因组部分降解，DNA浓度低的特点，本发明...
- 张光霁程汝滨葛宇清陈梦
- 文献传递
- 一种氨基葡萄糖合成酶、工程菌及其应用
- 本发明公开了一种氨基葡萄糖合成酶、工程菌及其应用，该氨基葡萄糖合成酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明从一株枯草芽孢杆菌中克隆获得高活性的氨基葡萄糖合成酶基因BS‑glmS，利用BS‑glmS基因构建重组表...
- 程汝滨葛宇清方昀朱玲燕陈梦
- 文献传递
- 一种用于海马药材鉴定的引物、DNA序列及鉴定方法
- 本发明涉及一种用于海马药材鉴定的引物、DNA序列及鉴定方法，属于分子生物学领域，所述引物的序列如下：ATP6‑F：5'‑CAACCCCTTGAAACTGACAATGACA‑3'ATP‑R：5'‑GCTTGRATTATAG...
- 葛宇清张光霁程汝滨孙思雅来梦茹
- 文献传递
- 中医肿瘤瘀毒互结致病理论研究和应用
- 张光霁陈喆那仁满都拉申力楼招欢葛宇清刘培马小琼舒琦瑾包剑锋
- 恶性肿瘤是严重危害人民健康的重大疾病，肺癌、乳腺癌和肝癌位居前三；大量文献报道，气滞血瘀型肿瘤临床最为常见。通过历代文献查阅，项目组对历代医家肿瘤病机认识进行梳理，结合现代临床，创新性地提出中医肿瘤瘀毒互结的相关理论，认...
- 关键词：
- 关键词：肿瘤治疗中医治疗
- 一种哺乳动物微小核糖核酸基因预测的方法
- 本发明根据哺乳动物微小核糖核酸(microRNA)前体序列具有高度跨物种保守性的特点，从已知的微小核糖核酸序列出发，找到了一种可行的基于同源预测的微小核糖核酸基因鉴定的生物信息学方法，可直接针对微小核糖核酸基因进行锁定，...
- 陈喆吴剑丙刘培葛宇清潘辉
- 文献传递
- eIF4E介导慢性髓系白血病细胞耐药及隐丹参酮对其的干预研究
- 葛宇清程汝滨武利强尚小广姚金娜何雯洁
- 慢性髓系白血病(CML)占所有白血病发病率的15%-20%，临床上CML患者耐药和复发成为限制CML疗效的主要原因。通过比较CML细胞K562及其伊马替尼耐药细胞株K562-R，发现在耐药细胞中翻译起始因子eIF4E活性...
- 关键词：
- 关键词：慢性髓系白血病隐丹参酮
