章涛
- 作品数:5 被引量:10H指数:2
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- 我国新疆皮肤利什曼病病原体SSU rDNA多变区序列分析被引量:4
- 1998年
- 我国新疆皮肤利什曼病病原体(CLP)种株鉴定尚有分歧。本研究用一对利什曼原虫属特异引物R222和R333,直接从皮肤利什曼病病人皮肤病变组织、热带利什曼原虫(Leishmaniatropica)和婴儿利什曼原虫(L.infantum)基因组DNA中扩增出一SSUrDNA特异片段,克隆到pGEM○R-TEasyVector上,并以双脱氧链末端终止法测序。序列分析显示扩增的CLP、L.infantum和L.tropicaSSUrDNA序列皆为391bp长,L.tropica与CLP的序列之间387个碱基相同,存在4个点突变;L.infantum与CLP的序列之间383个碱基相同,存在7个点突变和2个移码突变;L.tropica与L.infantum的序列之间387个碱基相同,存在3个点突变和2个移码突变。表明扩增的CLP、L.infantum和L.tropicaSSUrD-NA多变区序列高度同源,但仍存在少数点突变,或插入/缺失;该SSUrDNA序列变异可反应种间差异;新疆皮肤利什曼病病原体与L.tropica较相近。
- 章涛胡孝素敬保迁戴保民郑学礼
- 关键词:皮肤利什曼病病原体PCRRDNA克隆
- 新疆皮肤利什曼病病原体SSUrRNA基因克隆与序列分析被引量:1
- 2000年
- [目的 ]分析新疆皮肤利什曼病病原体SSUrRNA基因序列 ,为该病原体种株鉴定分析提供实验依据。[方法 ]应用利什曼原虫特异引物R2 2 2及R333,PCR扩增SSUrRNA基因多变区的片段 ,克隆于T Easyvector,并以双脱氧链末端终止法进行序列测定 ,用DNASIS软件和GenBank微机联网检索分析所测XJCLP、L infantum及L tropicaSSUrRNA基因序列。[结果 ]XJCLP、L infantum及L tropicaSSUrRNA基因插入片段长度均为 394bp。XJCLP与L tropicaSSUrRNA基因 394bp序列存在 3个点突变 ,两者有 391个碱基相同 ,相似性为 99 2 %。XJCLP与L infantumSSUrRNA基因序列存在 3个点突变及 1个移码突变 ,两者有 390个碱基相同 ,类似性为99 0 %。L infantum与L tropica的SSUrRNA基因序列存在 1个移码突变 ,相似性为 99 7%。XJCLP、L infantum及L tropicaSSUrRNA基因序列一级结构与RNA二级结构均不同。经用GenBank检索本次所测XJCLP、L infantum及L tropicaSSUrRNA基因序列 ,该GenBank内尚无同类 394bp的SSUrRNA基因序列。[结论 ]XJCLP、L infantum及L tropica的SSUrRNA基因 394bp序列一级结构 ,二级结构存在差异。
- 郑学礼胡孝素杨文天章涛敬保迁
- 关键词:皮肤利什曼病克隆病原体
- 我国新疆皮肤利什曼原虫种株基因特征分析
- <正> 自1983年以来,我国新疆克拉玛依地区陆续有皮肤利什曼病病例报道,病例数己有100多例,但其病原体虫种鉴定尚有待进一步确定。本课题组自1993年以来,采用PCR技术扩增该地区皮肤利什曼病患者皮肤病变组织中微量的利...
- 陈建平胡孝素郑学礼章涛田玉
- 文献传递
- 新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病病原体SSU rRNA基因及kDNA的PCR-SSCP分析被引量:5
- 1998年
- 应用PCR-SSCP银染技术,对皮肤利什曼病(CL)病人(P17)的病原体SSUrRNA基因及kDNA进行分析。将新疆克拉玛依地区皮肤利什曼病患者病变组织及有关利什曼原虫种株,L.infantum,L.tropica,L.donovaniXinjiang“771”株,分别抽提各标本的基因组DNA和kDNA后,再用相应的引物,R222和R333PCR扩增SSUrRNA基因(397bp片段)和13A、13B扩增kDNA微环(120bp片段)。PCR扩增的SSUrRNA基因(397bp片段)经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,银染显色后,CLP17病原体的ssDNA的迁移率与L.tropica者接近,而与L.infantum者亦相差较小。PCR扩增的CLP17病原体和L.infantum的kDNA微环(120bp)片段,经SSCP分析,CLP17病原体的Mc1和Mc2分别为0.8259、0.7222,L.infantum的MF1和MF2分别为0.9074、0.7962。MC与MF相比,二者相差较小;CLP17病原体和L.tropica的kDNA微环(120bp片段),经SSCP分析,CLP17病原体的MC1和MC2分别为?
- 郑学礼胡孝素陈建平章涛
- 关键词:皮肤利什曼病PCR-SSCPSSURRNA基因
- 新疆皮肤利什曼病病原体SSU rDNA多变区PCR扩增及克隆被引量:1
- 1998年
- 目的鉴定新疆皮肤利什曼病病原体。方法用利什曼原虫属特异引物R222和R333,从皮肤利什曼病患者皮肤病变组织、婴儿利什曼原虫和热带利什曼原虫基因组DNA中扩增出一特异SSUrDNA多变区片段,将其克隆到pGEM○R-TEasyVector上,并筛选和鉴定出重组质粒。结果以EcoRⅠ酶切、PCR扩增和Southern杂交证实获得的重组质粒包含SSUrDNA多变区片段。结论皮肤利什曼病病原体、婴儿利什曼原虫和热带利什曼原虫SSUrDNA多变区片段重组质粒的获得,为进一步序列分析比较提供实验材料。
- 章涛胡孝素敬保迁郑学礼郑学礼李凡
- 关键词:皮肤利什曼病SSURDNA分子克隆