王明会
- 作品数:32 被引量:59H指数:5
- 供职机构:中国科学技术大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家教育部博士点基金中国科学院知识创新工程重要方向项目更多>>
- 相关领域:生物学自动化与计算机技术医药卫生更多>>
- 基于多示例对比学习和Transformer技术的CT影像分类方法
- 本发明公开了一种基于多示例对比学习和Transformer技术的CT影像分类方法,包括:获取肺部CT影像数据并进行预处理;2采用示例增强对比学习方法训练特征提取器,以提取有判别力的示例特征;3将训练好的特征提取器用于示例...
- 李骜余海跃李磊高峰王明会
- 中国在翻译后修饰的生物信息学研究领域的进展与前瞻被引量:5
- 2015年
- 翻译后修饰在调控蛋白质构象变化、活性以及功能方面具有重要作用,并参与了几乎所有细胞通路和过程。蛋白质翻译后修饰的鉴定是阐明细胞内分子机理的基础。相对于劳动密集的、耗费时间的实验工作,利用各种生物信息学方法开展翻译后修饰预测,能够提供准确、简便和快速的研究方案,并产生有价值的信息为进一步实验研究提供参考。文章主要综述了中国生物信息学者在翻译后修饰生物信息学领域所取得的研究进展,包括修饰底物与位点预测的计算方法学设计与完善、在线或本地化工具的设计与维护、修饰相关数据库及数据资源的构建及基于修饰蛋白质组学数据的生物信息学分析。通过比较国内外的同类研究,发现优势和不足,并对未来的研究作出前瞻。
- 刘泽先蔡煜东郭雪江李骜李婷婷邱建丁任间施绍萍宋江宁王明会谢鹭薛宇张子丁赵兴明
- 关键词:翻译后修饰共价修饰磷酸化
- 一种基于多视图CT影像的基因突变无创检测方法
- 本发明公开了一种基于多视图CT影像的基因突变无创检测方法,包括:1CT数据的获取以及预处理;2构建由联合表征学习模块、双对抗表征学习模块以及检测模块组成的基因突变状态检测模型;3联合表征学习模块对CT图像样本进行共享信息...
- 王明会李傲然高子玉杜宏伟李骜
- 联合全局正则化与局部对抗学习的病理图像细胞核检测方法
- 本发明公开了一种联合全局正则化与局部对抗学习的病理图像细胞核检测方法,包括:1获取细胞核检测数据并进行预处理;2构建细胞核检测网络及局部病理图像的鉴别器网络构成的检测模型;3联合有监督细胞核检测和局部对抗学习对有标签病理...
- 李骜苏蕾王明会
- 针对医学图像的细胞核自动检测方法
- 本发明公开了一种基于深度神经网络的医学图像细胞核自动检测方法,该方法在编码器‑解码器的网络结构基础上,设计了连接支路用于代替跳跃连接;连接支路中的多尺度特征提取器,能够有效利用不同层级特征图中的细胞核多尺度空间位置信息,...
- 王明会胡渝李骜
- 文献传递
- 基于支持向量回归方法的蛋白残基可溶性预测被引量:1
- 2007年
- 介绍了一种从蛋白质序列预测残基相对可溶性的新方法。该方法基于支持向量回归,并将序列局部信息作为输入。不同于先前的大部分预测方法仅对特定的蛋白残基相对可溶性进行状态分类,该方法预测了相对可溶性的连续值,从而比状态分类保留了蛋白质三维结构的更多信息。本研究对RS-126,Manesh-215和CB-513三个数据集进行了测试,通过比较不同的参数及窗宽模型来获得最佳结果,采用平均绝对误差、相关系数等参数来衡量预测效果,同时与多层反馈神经网络方法(RVP-Net)的实验结果比较,在3-fold情况下三个数据集预测结果的平均绝对误差均有降低,相关系数均有提高。另外,该算法采用了多序列比对作为输入,效果比单序列有所提高。采用该方法,对CB-513数据集平均绝对误差可以达到16.8%、相关系数为0.562,而用RVP-Net方法分别为18.8%和0.480。这些结论表明支持向量回归方法是蛋白质序列分析的一种有效工具。
- 许文龙李骜王明会江朝晖冯焕清
- 关键词:支持向量机蛋白质结构预测生物信息学
- 基于多模态特征解耦技术的机器人抓取稳定性检测方法
- 本发明公开了一种基于多模态特征解耦技术的机器人抓取稳定性检测方法,包括:1.获取视觉和触觉数据;2.对视觉和触觉数据进行预处理;3.设计并构建机器人抓取稳定性检测深度神经网络;4.构造总体损失函数,使用迭代优化的方式进行...
- 李骜方涛刘伟王明会
- 基于改进多尺度ASM和非刚性配准的4D-CT左心室分割被引量:4
- 2013年
- 64排及以上多层螺旋CT(MSCT)能提供含有时间信息的四维CT成像数据,可用于动态心、肺等功能的分析.为此提出了基于改进的多尺度ASM和非刚性配准的分割方法,从心脏MSCT四维数据集中提取左心室腔和心肌.该方法根据MSCT层片间的特点,采用改进的特征点标记方法对收缩末期的左心室进行形状建模,在基于改进的模型定位和搜索算法基础上,运用多尺度ASM算法实现三维数据集上的分割.通过互信息量的Demons非刚性配准方法,利用膨胀末期的分割结果实现对其余心相上的左心室配准分割.在256排MSCT四维心脏数据集上的实验表明,该方法对血腔的分割结果和手工分割结果的平均相似度在95%以上,心肌的平均相似度在88%以上.
- 王兴家王明会李骜闵捷董利娜冯焕清
- 关键词:左心室4D-CTASM心肌非刚性配准
- 基于SNP数据检测染色体拷贝数结果可信度分析
- 2014年
- 利用SNP数据检测肿瘤细胞染色体拷贝数变异是癌症相关研究的一个热点,目前已有多种方法可以通过分析SNP array数据检测染色体拷贝数。然而在某些情况下,这些检测方法检测结果与真实拷贝数具有一定错误率。目前并没有方法研究预测结果发生错误的规律。本文分别分析了GPHMM,ASCAT两种检测方法结果信息熵与检测正确率的关系,发现检测正确率与信息熵存在很强的相关性。通过对比不同肿瘤细胞比例下信息熵与正确率关系,本文发现随着肿瘤细胞比例的增大,检测结果信息熵平均值增大,方差减小;同时平均检测正确率也越来越大,方差显著减小。这些结果显示信息熵的大小可以反映出检测结果正确率的高低。最后,本文以高肿瘤细胞比例下拷贝数检测结果为例,研究了在变异类型单一,信息熵小的情况下,染色体倍性检测的正确率。结果表明信息熵可以作为衡量检测结果可信度的指标:即信息熵越高,检测结果越可信。
- 刘小成刘元宁夏红王明会李骜
- 关键词:SNPARRAY信息熵拷贝数变异
- 基于支持向量机方法的蛋白质氨基酸残基可溶性预测被引量:5
- 2005年
- 按照蛋白质序列中残基的相对可溶性,将其分为两类(表面/内部)和三类(表面/中间/内部)进行预测。选择不同窗宽和参数对数据进行训练和预测,以确保得到最好的分类效果,并同其他已有方法进行比较。对同一数据集不同分类阈值的预测结果显示,支持向量机方法对蛋白质可溶性的整体预测效果优于神经网络和信息论的方法。其中,对两类数据的最优分类结果达到79.0%,对三类数据的最优分类结果达到67.5%,表明支持向量机是蛋白质残基可溶性预测的一种有效方法。
- 王娴李骜王明会冯焕清
- 关键词:支持向量机氨基酸残基可溶性