上海中医药大学中药学院数理教研室
- 作品数:8 被引量:33H指数:4
- 相关机构:天津医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系天津医科大学公共卫生学院上海中医药大学附属曙光医院肝病研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金上海市中医临床重点学科建设项目上海市教育委员会重点学科基金更多>>
- 相关领域:医药卫生文化科学更多>>
- 基于系统药理学方法的苓桂术甘汤治疗NAFLD的关键成分挖掘及协同机制分析被引量:3
- 2021年
- 目的:从系统药理学视角结合计算方法,深入解析中药复方苓桂术甘汤(LZD)中的主要有效活性成分对非酒精性脂肪性肝病(nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的分子作用机制及其协同性。方法:应用TCMSP数据库以及PubChem中检索出LZD的主要化学成分,使用ACD/Labs软件对LZD主要化学成分进行ADMET筛选;从GeneCards、OMIM、DisGeNET等数据库收集NAFLD相关的作用靶点,运用SEA、HitPick靶点预测系统依次检索各活性成分的潜在作用靶点,通过取两者交集获得LZD治疗NAFLD的潜在作用靶点集,同时,提出利用最小集合覆盖算法(SCP)优化出LZD治疗NAFLD的关键成分集;进一步利用STRING数据库获得LZD潜在作用靶点的PPI网络,通过基于网络距离的计算方法发现LZD关键成分之间的协同治疗作用;最后,利用DAVID平台进行GO功能注释和KEGG信号通路富集分析。结果:通过ADMET筛选、靶点预测与识别,筛选出LZD中主要活性成分116个及其作用的78个潜在NAFLD靶点;利用SCP算法优化出LZD中的22个关键成分;对基于STRING构建的PPI网络分析,发现2个核心子模块,同时利用网络扰动计算方法,发现LZD中22个关键成分中有14个成分之间存在协同治疗作用;KEGG通路富集分析,显示LZD主要通过25条相关信号通路,主要涉及:乙型肝炎(hepatitis B)、TNF、丙型肝炎(hepatitis C)、HIF-1等;最后,分子对接验证显示,LZD中的Quercetin、2-methoxyphenylacetone、cinnamic acid、methyl cinnamate、dimethyl phthalate、diethyl phthalate等有效成分与AKT1、CXCL8、JUN、MAPK8、TNF等5个重要靶点均具有较好的结合力。结论:本研究初步揭示了LZD的药效物质基础,探讨了LZD的药理作用机制,为LZD的临床应用以及实验研究提供了重要参考依据。
- 高珊珊侯立新仇勤孙继佳苟小军
- 关键词:苓桂术甘汤PPI网络分子对接
- 一种改进关联分析方法及其在药物分析试验设计中的应用
- 2012年
- 目的:试验设计是数理统计方法在药物分析学中应用比较成熟的领域,近几年来灰色关联分析方法被广泛应用于药物分析试验设计,但传统的灰色关联分析方法本身存在一定的缺陷,因此,提出一种新的改进关联分析方法来进行药物分析的试验设计。方法:通过分析和比较现有几种常用关联分析方法,构建一种既考虑因素序列关联度存在负值又兼顾序列差异性的综合算法。结果:通过实例分析,发现改进后的关联分析方法能够如实地反映药物分析数据中的客观事实。结论:本研究提出的改进关联分析方法能够为药物分析领域的试验设计提一种更为有效的数据分析方法,同时,也可以应用于社会、经济、工程、教育等其他各个领域。
- 孙继佳邵建华苏式兵
- 关键词:药物分析析因设计灰色关联分析
- 典型机器学习算法在脂肪肝分类预测研究中的实现与比较被引量:8
- 2019年
- 目的:实现和比较5种常见的机器学习算法在脂肪肝分类预测研究中的应用。方法:通过主成分分析对数据的体检指标进行降维,然后应用决策树、神经网络、支持向量机、贝叶斯网络和随机森林算法,分别构建脂肪肝分类预测模型,对1956例体检数据进行脂肪肝的分类预测。结果:决策树分类模型在脂肪肝分类预测上的准确率最高,达到70.14%,其次是支持向量机和神经网络模型,处于68%左右的水平。结论:本文所研究的典型算法在脂肪肝分类的预测上具有较为可靠分类预测能力,但决策树模型在应用小样本数据上表现出了优势;同时,还发现臀围(HIP)和甘油三酯(TG)可能与脂肪肝分类关联密切。
- 余秋燕赵莹孙继佳邵建华
- 关键词:脂肪肝主成分分析决策树支持向量机贝叶斯网络
- 基于群组专家知识集成的中医临床症候评价方法研究被引量:2
- 2018年
- 目的:提出一种基于群组专家知识的乙肝中医临床症候评价模型。方法:根据所收集到的883例慢性乙型病毒性肝炎临床资料为依据,建立乙肝中医症候专家评价表,通过专家打分,得到3种不同证型下的112种相关临床指标专家评价结果,利用聚类分析和相对熵集结模型建立评价模型。结果:通过模型计算,对与肝胆湿热证、肝郁脾虚证、肝肾阴虚证等3种证型密切相关的临床指标进行了系统分析,同时,建立了这3种基本证型的综合评价模型。结论:所提出乙肝中医临床评价方法能够符合中医临床评价要求,并且对其他疾病的中医临床研究具有一定的参考和借鉴。
- 孙继佳周明眉胡义扬苟小军苏式兵
- 关键词:乙型病毒性肝炎中医辨证群组决策聚类分析
- 基于粗糙集技术的乙肝中医临床症候关联规则挖掘研究被引量:7
- 2017年
- 目的:采用粗糙集技术与关联规则结合的数据挖掘方法对乙肝中医临床症候规律进行研究。方法:根据所收集到的883例乙肝患者中医临床资料,采用粗糙集方法建立中医证候决策信息表,提取与乙肝证型有密切关联的症状、体征,然后利用关联规则找出不同证型下的中医临床指标的相关性。结果:通过对临床数据的挖掘分析,发现口苦、舌苔薄和脉弦等对肝胆湿热证判定以及舌胖、舌荣等对肝郁脾虚证的诊断分析具有很高的参考价值。结论:提出的方法能够有效地揭示中医临床症状之间的内在规律,对于乙肝中医临床研究工作具有一定的参考价值,并且对其他疾病的中医临床研究具有一定的参考和借鉴意义。
- 孙继佳王鲲
- 关键词:中医辨证粗糙集关联规则
- 基于关联规则的老年人脂肪肝相关危险因素研究被引量:6
- 2022年
- 目的研究上海地区老年人健康体检数据,分析与老年人脂肪肝患病相关的因素以及多个因素间潜在的交互作用。方法选取2017年上海某社区60岁及以上老年人体检的临床健康数据作为研究对象,脂肪肝影响因素的筛选先采用LASSO回归进行降维和消除变量之间的多重共线性,再采用逐步回归法构建logistic回归模型。关联规则建模并提取与脂肪肝患病相关的规则。结果在所有6252例研究对象中,病例组3345例,该社区老年人脂肪肝患病率为53.50%,为高患病率。性别、BMI、高脂血症、白蛋白、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、平均红细胞体积、红细胞压积、尿素、平均血红蛋白含量、血小板、单核细胞数、血小板容积、肌酐、总胆固醇、葡萄糖含量、低密度脂蛋白、甘油三酯、尿酸为老年人患脂肪肝的独立影响因素。关联规则提示性别、BMI、高血压、低密度脂蛋白等变量关联在一起时,一定程度上增加脂肪肝发生的风险。结论分析与脂肪肝患病相关的因素以及多个因素间潜在的交互作用,能够为脂肪肝的早期预防与控制提供信息参考,从而更好地预防脂肪肝的发生。
- 常琴雪王肖萌王淳王柯云刘媛媛李长平孙继佳崔壮马骏
- 关键词:脂肪肝LOGISTIC回归关联规则
- 中医药院校高等数学课程中引入数学建模教学的研究与探讨
- 2018年
- 高等数学是中医药院校的一门公共基础课,而数学建模是连接高等数学所学理论知识与实际应用的桥梁。本研究从数学建模及其重要意义的角度出发,研究和探讨了中医药院校高等数学课程中引入数学建模教学的优势和必要性以及教学的目标、方法和内容;另外,对于数学建模中编程语言和软件应用,结合我校学生调查问卷所反馈的实际情况,建立了适合中医药院校的教学与实践的培养模式。
- 孙继佳赵莹林蓉叶红彭春花邵建华
- 关键词:高等数学中医药院校数学建模编程语言
- 基于信息熵的乙肝后肝硬化证素提取及病机分析被引量:8
- 2016年
- 目的:提取乙肝后肝硬化证候要素(证素)并分析其组成及分布规律,探讨肝硬化的病机特点。方法:收集294例病毒性乙型肝炎(乙肝)后肝硬化患者的四诊资料,采用基于信息熵的复杂系统划分方法(信息熵法)提取证候要素(证素),确定症状贡献度,并通过诊断阈值,分析乙肝后肝硬化证素组成及分布规律。结果:乙肝后肝硬化患者存在着脾虚、肾气虚、肝阴虚、痰湿、气滞、肝郁、湿热7个主要证素,并有1个至多个证素存在,其中脾虚、气滞、湿热出现频率较高。结论:信息熵法可以用于乙肝后肝硬化证候要素的提取。乙肝后肝硬化的病机复杂,其中脾虚、气滞、湿热可能是其主要的病机因素。
- 郭志忠魏滨孙继佳王文海苏式兵
- 关键词:证素辨证信息熵病机乙肝后肝硬化