贵州大学农学院贵州省山地农业病虫害重点实验室
- 作品数:3 被引量:3H指数:1
- 相关机构:华中农业大学植物科技学院更多>>
- 发文基金:国家教育部博士点基金国家重点基础研究发展计划贵州省国际科技合作计划更多>>
- 相关领域:农业科学理学更多>>
- 拟环纹豹蛛响应温度胁迫SNP位点挖掘及其功能注释分析被引量:1
- 2019年
- 单核苷酸多态性(SNP)是基因组中普遍存在的遗传变异,是一种重要的遗传标记。为了解拟环纹豹蛛转录组中响应温度胁迫的SNP候选位点及SNP所在基因SNP-Unigenes的功能注释,主要采用SOAPsnp软件对拟环纹豹蛛在不同温度胁迫条件下的转录组测序结果进行SNP检测,并把SNP所在基因SNP-Unigenes比对到GO、COG、KEGG数据库,获得SNP-Unigenes的注释及参与的功能情况。结果表明:拟环纹豹蛛转录组SNP位点分布在7421条SNP-Unigenes上,共存在402910个SNP位点,SNP发生频率为1/301 bp;功能注释分类揭示拟环纹豹蛛在低温胁迫和高温胁迫条件下,SNP-Unigenes主要参与蛋白质转运、核糖体代谢、氧化磷酸化和氨基酸代谢功能,从而补偿热应力下蛋白质的损伤,加快拟环纹豹蛛对温度变化的适应。综上,筛选到拟环纹豹蛛响应温度胁迫相关的SNP位点或SNP-Unigenes,为将来深入研究拟环纹豹蛛响应温度胁迫的分子机制提供基础数据。
- 王祥银孙良玉刘靖肖榕
- 关键词:拟环纹豹蛛温度胁迫单核苷酸多态性
- 荧光偏振技术研究Bloom解旋酶催化核心与双链DNA的相互作用被引量:2
- 2013年
- Bloom综合症(BLM)解旋酶是RecQ家族DNA解旋酶中的一个重要成员,参与了DNA复制、修复、转录、重组以及端粒的维持等细胞代谢过程,在维持染色体的稳定性中具有重要的作用.BLM解旋酶的突变可导致Bloom综合症,患者遗传不稳定易患多种类型癌症.本研究运用荧光偏振技术研究BLM解旋酶催化核心(BLM642~1290)与双链DNA(dsDNA)的相互作用,分析其相关特征参数,了解BLM642~1290解旋酶与dsDNA的结合和解链特性.结果表明:BLM642~1290解旋酶与dsDNA的结合和解链与dsDNA 3′端的单链DNA(ssDNA)长度有关;解旋酶优先结合于dsDNA底物的ssDNA末端,且每分子解旋酶可结合9.6 nt的ssDNA;dsDNA 3′端ssDNA的长度为9.6 nt时,解旋酶的解链效率达到最大且不再随其长度而变化.另外,BLM642~1290解旋酶也能够结合和解链钝末端dsDNA,但其结合亲和力和解链效率低于有3′端ssDNA的dsDNA.推测BLM642~1290解旋酶在与dsDNA底物结合和解链时是单体形式,可能以尺蠖的形式解开dsDNA.这些结果可为进一步研究BLM解旋酶的功能特征提供理论基础.
- 骆衡许厚强陈祥刘朝前许庆贺李坤
- 关键词:DNA结合
- 灯光诱杀技术在我国的研究进展与发展趋势
- 灯光诱杀技术是一种利用昆虫的趋光性来进行害虫防治的技术,具有高效、绿色、不产生抗性等特点。本文介绍了灯光诱杀技术在我国的发展历史、研究与应用现状,以及昆虫趋光性的理论研究概况,分析了该技术目前存在的主要问题进行了分析,进...
- 张长禹王小平雷朝亮
- 关键词:灯光诱杀趋光性光胁迫昆虫
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