西南民族大学生命科学与技术学院动物遗传育种学国家民委教育部共建重点实验室
- 作品数：37 被引量：139H指数：6
- 相关作者：王侠穆松胡丹刘建磊更多>>
- 相关机构：青海大学畜牧兽医科学院西南大学生物技术学院青海大学农牧学院更多>>
- 发文基金：国家科技支撑计划中央高校基本科研业务费专项资金四川省应用基础研究计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 麦洼牦牛SRY基因克隆及序列分析被引量：5
- 2013年
- SRY是Y染色体上具体决定生物雄性性别的基因片段,是多数哺乳动物性别决定基因之一。本试验采用克隆测序SRY基因并结合生物信息学对其序列进行分析,利用软件Codon W分析麦洼牦牛、普通牛、绵羊、山羊、猪、小鼠、鸡和人该基因编码区的密码子偏好性。克隆测序得到SRY基因序列含1个690bp的开放阅读框,共编码229个氨基酸;其编码区核苷酸序列与普通牛、绵羊、山羊、猪、小鼠、鸡、人相应序列间的一致性分别为99.9%、93.9%、91.2%、76.5%、43.3%、21.4%、69.1%。经聚类分析,麦洼牦牛首先与普通牛聚在一起,绵羊与山羊聚为一类,这两类相聚后再依次与猪、人、小鼠相聚,最后与鸡聚为一类,其结果与以往的生物学分类结果一致。该基因编码的蛋白质分子式为C1155H1827N351O348S11,相对分子质量为2655.0,理论等电点PI为9.55,亲水性平均数为-0.855。其密码子偏好性分析显示,T3s为0.2905、C3s为0.3240、A3s为0.3728、G3s为0.2963,第3位碱基中出现G和C占第3位碱基总量的48%,同义密码子数为61。上述数据表明麦洼牦牛SRY基因编码序列与普通牛、绵羊、山羊、猪、人具有较高的一致性,在物种进化过程中较为保守。该基因对含A的密码子有较高的偏爱性,尽量避开以G结尾的密码子,且其所编码的蛋白质为亲水性蛋白。
- 刘仲娜钟金城柴志欣马志杰曾贤彬宋乔乔
- 关键词：麦洼牦牛SRY基因聚类分析密码子偏好性
- 流感病毒基因的密码子偏好性及聚类分析被引量：3
- 2010年
- 流行性感冒病毒是一种造成人类及动物患流行性感冒的RNA病毒,它造成急性上呼吸道感染,并由空气迅速传播,在世界各地常有周期性的大流行.根据该病毒的基因组CDS序列,探讨了基因组序列密码子的使用模式和特性,并进行了病毒间的聚类分析.结果表明：流感病毒的G＋C含量均低于A＋U含量,偏向使用以A、U结尾的密码子的程度比使用以G、C结尾的较高,CUG、UCA、AGU、AGC、AGA、AGG、GUG、CCA、ACA、GGA、GCA、AUU、UGA、CAU、CAA、AAU、AAA、GAA等18个密码子为流感病毒共有的偏好性密码子,且以A结尾的居多,尤其偏爱AGA、GGA.聚类结果表明首先亚洲流感病毒H2N2和香港流感病毒H2N2聚为一类,亚洲流感病毒H1N1和俄罗斯流感病毒H1N1聚为一类,1997年和2003年~2004年发生的人禽流感聚为一类,说明它们的密码子使用的偏好性相似;而2009年爆发的甲型H1N1流感和任何一个流感的距离都比较远,说明甲型H1N1流感病毒是一种新型的病毒,不同于以往任何一种流感病毒.
- 徐利娟钟金城陈智华穆松
- 关键词：流感病毒密码子偏好性聚类分析
- 牦牛、普通牛及其杂种HSFY2、DAZAP2基因表达的研究
- 牦牛与普通牛的种问杂种犏牛雄性不育机理一直是畜牧研究者极为关注的研究热点之一.杂种雄性不育，种间杂交不能达到改良牦牛遗传本质和充分利用牦牛遗传资源的目的，限制了在生产中对杂种优势的利用，而雄性不育的最终表现是精子发生受阻...
- 钟金城王侠陈智华
- 关键词：雄性不育种间杂交遗传资源养牛技术
- 文献传递
- 牦牛OB基因的克隆及原核表达被引量：2
- 2011年
- 肥胖基因(obese gene,OB gene)表达产物瘦蛋白(leption)具有调节体重、影响动物生长和繁殖率等一系列生物学功能。通过牦牛脂肪组织总RNA的提取,利用RT-PCR克隆出牦牛OB基因的成熟肽cDNA,构建OB基因的原核表达载体OB-pET32a(+),在大肠杆菌表达系统使融合蛋白表达,通过SDS-PAGE检测所表达的融合蛋白。结果表明,克隆的OB基因成熟肽片段为456 bp包含EcoR I和BamH I两个酶切位点,与普通牛、瘤牛该基因的相似性达98.6%。原核表达产物为包涵体形态,大小为31 kD,符合预期结果,为OB基因的高效表达系统的构建奠定基础。
- 唐懿挺姬秋梅张成福柴志欣赵上娟白雪信金伟钟金城
- 关键词：牦牛OB基因克隆原核表达
- 乐至黑山羊FSHR第10外显子的SNP研究被引量：4
- 2010年
- 分别以高繁品系和快长品系的乐至黑山羊母羊为实验材料,以FSHR基因的第10外显子的1487~1717bp为目的片段进行SNP检测.采用PCR方法扩增目的片段,用PCR-SSCP法对扩增片段进行单核苷酸多态性分析.结果表明,乐至黑山羊FSHR基因第10外显子不存在SNP位点,该片段与乐至黑山羊高繁殖力性状无相关性.
- 黄磊字向东王永穆晓琨徐华伟马力付锡三林世武
- 关键词：乐至黑山羊FSHR单核苷酸多态性
- 野牦牛mtDNA Cytb基因全序列测定及系统进化关系被引量：12
- 2009年
- 为从分子水平探究牦牛的分类地位和遗传多样性,试验测定了野牦牛细胞色素b基因全序列,并以绵羊为外群,构建野牦牛、家牦牛、大额牛、普通牛、瘤牛、水牛、非洲野牛、欧洲野牛、美洲野牛、非洲水牛等牛亚科种间系统进化树。结果表明:野牦牛细胞色素b基因全序列长1 140bp,序列间共有13个SNP多态位点,核苷酸变异类型包括转换和颠换,无插入和缺失,表明野牦牛具有较丰富的遗传多样性。研究结果支持将牦牛划分为牛亚科中一个独立属(即牦牛属)的观点。
- 杨万远陈雪梅钟金城陈生梅郭承恩孟丽武甫德
- 关键词：野牦牛细胞色素B进化
- 牦牛分子育种研究进展被引量：5
- 2013年
- 系统阐述了开展牦牛分子育种的必要性、研究内容与特点,牦牛生长发育、繁殖、肉质、泌乳、抗病、毛色等性状的相关候选功能基因的研究进展,以及DNA分子多态性及其与生产性状的相关性,分析了牦牛分子育种研究和应用中存在的问题,提出了今后开展牦牛分子育种的思路。
- 宋乔乔柴志欣钟金城
- 关键词：牦牛分子育种分子遗传标记
- 巴州牦牛HSL基因外显子ⅠPCR-RFLP分析
- 为探究激素敏感脂肪酶(HSL)基因在巴州牦牛群体内的遗传多态性，开展其与肉质性状的关联分析，本研究采用PCR-RFLP方法对31头巴州牦牛HSL基因部分外显子I进行Smal酶切多态性分析，用SPSS 12.0软件统计基因...
- 马志杰钟金城徐惊涛魏雅萍窦全林卓娅
- 关键词：基因外显子激素敏感脂肪酶肉质性状基因频率
- 文献传递
- 西藏牦牛POU1F1基因的多态性及其与生长性状的相关性分析被引量：4
- 2016年
- 本研究利用DNA池和测序技术,结合PCR-RFLP方法,筛查了POU1F1基因第2外显子和第5内含子的SNP位点,分析了西藏申扎(SZ)、类乌奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(PL)4个牦牛类群(品种)共182个个体的POU1F1基因的多态性及其与体重、体高、体长等生长性状指标之间的相关性。结果表明:①POU1F1基因第2外显子高度保守,未发现任何突变,第5内含子中发现2个突变位点,分别为T727C(BglⅡ酶切)位点和T284C(StuⅠ酶切)位点。②申扎(SZ)、类鸟奇(LWQ)、斯布(SB)和帕里(PLl)4个群体中StuⅠ位点为中度多态性,其基因T/C频率分别为:0.61/0.39、0.54/0.46、0.54/0.46和0.62/0.38,BglⅡ位点为低度多态性;Hardy-Weinberg检验表明StuⅠ位点和BglⅡ位点均处于平衡状态(P>0.05)。③StuI位点在4个群体中表现CC、CT和TT 3种基因型,BglⅡ位点在4个群体中只表现CT和TT2种基因型。④帕里牦牛StuⅠ位点CC和CI基因型在生长性状上存在显著差异(P<0.05),其中CC基因型的体高和体长均高于CT基因型,而其他几个牦牛类群未发现类似现象。BglⅡ位点基因型与生长指标的相关性不显著。西藏牦牛POU1F1基因内含子5内T284C基因座表现的多态性可以作为改良其生长性状的一个遗传标记。
- 宋娜娜柴志欣胡丹向超钟金城
- 关键词：西藏牦牛POU1F1基因PCR-RFLP多态性生长性状
- 西藏牦牛的遗传多样性及其系统进化研究被引量：22
- 2011年
- 通过测定西藏11个牦牛类群的mtDNA D-loop区、cytb基因、COⅢ基因的核苷酸序列以及分析核基因组的RAPD多样性,研究了西藏牦牛的遗传多样性、类群间的亲缘关系和系统进化关系.结果表明:①西藏牦牛具有丰富的遗传多样性,且具有西藏东部地区的牦牛类群遗传多样性相对较高,而西部的牦牛类群遗传多样性相对较低的趋势,显示西藏东部地区可能是家牦牛的起源地之一.西藏牦牛的这些遗传多样性是西藏牦牛业持续发展和牦牛适应外界环境变化的物质基础,也是将来培育牦牛新品种或品系的重要基因资源,应加以妥善保护并进行合理开发利用.②西藏牦牛可分为两大类,有2个母系起源.③牦牛与美洲野牛的亲缘关系比与普通牛的近,作者认为将牦牛(家牦牛和野牦牛)划分为牛亚科中一个独立属——牦牛属(Poephagus)比将牦牛作为牛属中的一个亚属或一个种更合适.
- 钟金城柴志欣姬秋梅赵尚娟徐利娟唐懿挺张成福信金伟
- 关键词：西藏牦牛系统进化
