中山大学中山医学院蛋白质组学实验室
- 作品数：19 被引量：64H指数：4
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- 相关机构：中山大学附属第一医院东山院区华中科技大学同济医学院南方医科大学药学院临床药理学研究所更多>>
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- 骨肉瘤组织与良性骨肿瘤的比较蛋白质组学分析被引量：4
- 2009年
- 目的:分析骨肉瘤与骨良性肿瘤差异蛋白质质点,寻找影响骨肉瘤恶性生物学行为的分子指标。方法:固相pH梯度双向凝胶电泳分离5例骨肉瘤组织与5例良性骨肿瘤组织总蛋白。Deep purple荧光染色,Im-ageMaster 2DE软件分析,对差异蛋白质点采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱测定肽质指纹图谱并查询SWISS-PROT数据库。结果:获得重复性较好的双向电泳荧光染色图谱。图像分析检测骨肉瘤组织平均蛋白点数为1 386±101,良性骨肿瘤组织平均蛋白点数为1 270±202。初步鉴定出22个差异表达蛋白质点,其中15个在骨肉瘤中表达上调,以锌指蛋白133(zinc finger protein 133,Znf133)、laminB和T-复合多肽1(tailless complex poly-peptide 1,TCP-1)上调明显;7个在骨肉瘤中表达下调,其中蛋白激酶C抑制因子-1(protein kinase C inhibitor pro-tein 1,KCIP-1)表达缺失。结论:骨肉瘤组织与良性骨肿瘤的蛋白质表达存在明显差异,其中Znf133、laminB、TCP1、KCIP-1等可能在骨肉瘤的发生发展中发挥重要作用,有可能成为诊断骨肉瘤的分子标记物或治疗靶点。
- 梁琼李扬王连唐刘郁林罗灿桥梁惠珍黎明涛
- 关键词：骨肉瘤蛋白质组
- ATM失活诱导GADD45α依赖的小脑颗粒神经元凋亡
- 2023年
- 【目的】探究共济失调毛细血管扩张突变(ATM)激酶失活诱导神经元凋亡的具体分子机制。【方法】体外成熟7 d的小脑颗粒神经元(CGNs)分别用含25 mmol/L KCl(25 K)培养基、5 mmol/L KCl(5 K)培养基和含ATM特异性抑制剂(Ku55933,10μmol/L;Ku60019,15μmol/L)的25 K培养基后进行免疫印迹检测ATM、Caspase3、Cleaved Caspase-3的蛋白表达水平或培养8 h后进行Hoechst染色分析。在C6细胞和CGNs中转染ATM和GADD45α特异性siRNA,q-PCR和免疫印迹验证其干扰效率。体外成熟5 d的CGNs通过磷酸钙转染ATM特异性siRNA和pCMV-EGFP 48 h后进行Hoechst染色和凋亡分析。体外成熟7 d的CGNs用含ATM特异性抑制剂的25 K培养基培养8 h后进行全转录组测序、差异表达基因鉴定和通路富集分析。体外成熟5 d的CGNs通过磷酸钙转染GADD45α特异性siRNA和pCMV-EGFP 48 h,用含15μmol/L Ku6的25 K培养基处理8 h或5 K培养基处理8 h后进行Hoechst染色和凋亡分析。【结果】与25 K组相比,5 K处理组和ATM特异性抑制剂处理组的CGNs ATM蛋白表达降低、Cleaved Caspase-3蛋白表达增加、细胞核固缩率增加。C6细胞和CGNs中转染ATM和GADD45α特异性siRNA后有效降低ATM和GADD45α的mRNA和蛋白的表达。与对照相比,CGNs转染ATM特异性siRNA后,细胞核固缩率升高。在Ku55933处理组中鉴定出835个基因表达上调,848个基因表达下调;在Ku60019处理组中鉴定出454个基因表达上调,314个基因表达下调;274个基因在Ku5处理组和Ku6处理组中共同上调,179个基因在Ku5处理组和Ku6处理组中共同下调,其中ATM下游靶标GADD45α表达上调;通路富集结果显示TNF信号通路、NF-κB信号通路和凋亡信号通路等被显著富集。与对照相比,抑制剂处理组和5K组GADD45α的mRNA和蛋白表达均升高。与对照相比,转染GADD45α特异性siRNA后用含15μmol/L Ku60019的25 K培养基处理8 h或5 K培养基处理后的CGNs细胞核固缩率降低。【结论】ATM活性降低�
- 吴森斌伍健伟马莹赵凡一曹东芳梁建峰胡坤华袁忠民
- 关键词：神经元凋亡转录组测序
- 灵芝孢子促进大鼠受损伤脊髓运动神经元存活及其轴突再生相关蛋白质组学的初步研究被引量：18
- 2006年
- 目的:寻找与灵芝孢子促进受损伤脊髓运动神经元存活及其轴突再生相关的蛋白质。方法:SD大鼠随机分为正常对照组、模型组和灵芝孢子治疗组。模型组和灵芝孢子治疗组大鼠行脊神经腹根切断术。灵芝孢子治疗组大鼠胃饲灵芝孢子14 d。取各组大鼠脊髓灰质组织蛋白质,行双向电泳,采用基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱仪鉴定各组之间有明显差异表达的蛋白质。结果:各组之间共有6种蛋白质的表达存在差异,分别是塌陷反应介导蛋白2(collapsin response mediator protein 2,CRMP-2)、纤维型肌动蛋白加帽蛋白β(F-actin capping protein beta subunit,FCP-β)、异柠檬酸脱氢酶β(isocitrate dehydrogenase[NAD]subunit beta,IDH-β)、三磷酸腺苷酶(ATPase)、谷氨酸草酰乙酸氨基转移酶1(glutamate oxaloace-tate transaminase-1,GOT1)和丙酮酸激酶-M2(M2 pyruvate kinase,M2-PK)。灵芝孢子治疗组CRMP-2、IDH-β、ATPase和GOT1的表达高于模型组,而FCP-β和M2-PK的表达则低于模型组。结论:灵芝孢子可能通过上调或下调上述蛋白质的表达,参与促进大鼠受损伤脊髓运动神经元存活及其轴突再生作用。
- 张伟曾园山汪洋刘炜程进军陈穗君
- 关键词：灵芝孢子蛋白质组学神经元存活轴突再生
- 蛋白质组学检测β-原肌球蛋白在结肠癌组织中的表达被引量：5
- 2009年
- 目的:通过比较结肠腺癌与正常结肠黏膜的蛋白质组表达差异,寻找与结肠腺癌发生相关的蛋白质,筛选结肠癌诊断的分子标志物。方法:运用蛋白质组学技术,对8例结肠腺癌组织和8例正常结肠黏膜组织进行胶内差异双向电泳(2-D),选择差异表达超过2倍的蛋白质进行MALDI-TOF/TOF质谱分析和生物信息学分析,并对结肠癌组织中表达下调的蛋白β-原肌球蛋白(TMβ)进行Western blotting验证。结果:成功建立结肠腺癌和正常结肠黏膜的双向凝胶电泳图谱,结肠腺癌和正常黏膜组织凝胶电泳图谱中平均蛋白质斑点数分别为3289和3066,其中表达差异超过2倍的斑点共有31个,质谱分析和数据库检索共鉴定出18种蛋白质,包括cytoker-atin8、cytokeratin10、S100A6、TMβ、proteindisulfide isomerase等。从功能分析,这些差异蛋白与癌细胞的发生、增殖、分化、转移等相关;TMβ在结肠癌组织中的表达水平Western blotting结果与电泳结果一致。结论:蛋白质组学能有效地分离和鉴定结肠腺癌组织与正常结肠组织间的差异表达蛋白质,结肠癌组织中表达下降的TMβ,可能成为结肠癌诊断的分子标记物。
- 崔冀康玉博黄帅马晋平蔡世荣刘伟黄奕华
- 关键词：结肠肿瘤蛋白质组原肌球蛋白
- CD45在克罗恩病患者血清中的表达被引量：3
- 2009年
- 目的应用蛋白质组学方法在患者血清中寻找与克罗恩病相关的蛋白质。方法采取克罗恩病患者以及正常成人血清蛋白样本各4例,用不同的CyDye荧光染料标记后进行胶内差异双向凝胶电泳(2-DDIGE),并对获得的图谱进行分析及对差异蛋白质进行基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱鉴定。结果通过2-DDIGE分析,发现克罗恩病患者中存在29个表达异常蛋白质点,其中胶号为973的蛋白质点,在克罗恩病患者患者血清中比正常成人组表达升高2.55倍(P<0.05),该蛋白点经质谱鉴定为CD45。结论CD45在克罗恩病患者血清的高表达提示在克罗恩病的病程中免疫系统失衡可能起着一定作用。
- 康亮杨祖立王磊黄美近刘炜黎明涛汪建平
- 关键词：克罗恩病质谱CD45
- 克罗恩病患者与健康人血清蛋白质组学比较初步研究被引量：4
- 2008年
- 目的:应用蛋白质组学方法在患者血清中寻找与克罗恩病相关的蛋白质。方法:采取克罗恩病患者以及正常成人血清蛋白样本各4例,用不同的CyDye荧光染料标记后进行胶内差异双向凝胶电泳(2-D DIGE),并对获得的图谱进行分析及对差异蛋白质进行基质辅助激光解吸离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定和生物学信息分析。结果:通过2-D DIGE分析,发现了克罗恩病患者中存在29个表达异常蛋白质点,质谱分析和数据库检索共鉴定出22种蛋白质,包括SER/THR,CD45,APC等。结论:蛋白质组学能很好显示克罗恩病患者与正常人血清蛋白质表达差异,本研究鉴定的蛋白质可能为研究克罗恩病的生物学行为提供新的分子标记物。
- 康亮黄美近杨祖立王磊刘炜黎明涛汪建平
- 关键词：CROHN病蛋白质组
- 颅内动脉瘤患者血清蛋白组变化的研究被引量：6
- 2006年
- 【目的】寻找颅内动脉瘤患者血清中表达差异的蛋白。【方法】采集12例血清蛋白样本(颅内动脉瘤患者4例、脑挫裂伤患者4例及正常成人本4例)用不同的CyDye染料交叉标记后依次进行双向胶内差异凝胶电泳(2-DDIGE)、图像分析及基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)鉴定。【结果】发现胶号为1119的蛋白质点,在颅内动脉瘤患者血清中比正常成人组表达升高1.82倍(P<0.05),而在脑挫裂伤患者血清中与正常成人的表达差异没有统计学意义(P>0.05)。该蛋白点经质谱鉴定为结合珠蛋白。【结论】结合珠蛋白在颅内动脉瘤患者血清中表达升高,可能参与了颅内动脉瘤的形成及扩张。
- 朱永华刘炜石忠松刘少军李明昌黎明涛潘伟生黄正松
- 关键词：血清蛋白颅内动脉瘤结合珠蛋白
- 色霉素对多巴胺能神经元的保护作用被引量：1
- 2010年
- 目的研究色霉素对MPP+诱导凋亡的多巴胺能神经元的保护作用。方法体外培养的胎鼠腹侧中脑神经元,以MPP+引起多巴胺能神经元凋亡作为帕金森病的细胞模型,Hoechst 33258荧光核染色法检测神经元的凋亡情况,免疫细胞化学方法检测多巴胺能神经元内磷酸化Tau水平。结果10μmol·L-1 MPP+可以升高Tau磷酸化水平,诱导神经元发生典型的凋亡。而色霉素通过抑制Tau磷酸化,减少神经元凋亡,使TH-阳性细胞数目增加。结论色霉素可以通过抑制Tau磷酸化而对MPP+诱导凋亡的多巴胺能神经元发挥保护作用,色霉素可能用于临床防治帕金森病等神经退行性疾病。
- 王文雅黎明涛饶进军朱小南
- 关键词：色霉素MPP+多巴胺能神经元细胞培养TAU
- 克罗恩病患者的血清蛋白质组学研究被引量：3
- 2008年
- 目的寻找克罗恩病患者血清中的差异表达蛋白。方法采取克罗恩病患者以及正常成人血清蛋白样本各4例，用不同的CyDye染料交叉标记后依次进行双向胶内差异凝胶电泳（2－D DIGE）、图像分析及基质辅助激光解析离子化飞行时间质谱（MALDI－TOF－MS）鉴定。结果通过比较二者双向电泳图，发现了克罗恩病患者中存在多个表达异常蛋白质点．其中胶号为1058的蛋白质点，在克罗恩病患者血清中比正常成人组表达升高1．68倍（P〈0．05），该蛋白点经质谱鉴定为结合珠蛋白。结论结合珠蛋白在克罗恩病血清的高表达提示在克罗恩病的病程中免疫系统失衡可能起着一定作用。
- 康亮杨祖立刘炜张泷娟刘少军黄美近黎明涛汪建平
- 关键词：克罗恩病结合珠蛋白
- 应用蛋白质组学方法分析猪晶状体不同区域上皮细胞中蛋白质的表达差异被引量：4
- 2006年
- 应用蛋白质组学方法分析比较猪晶状体中央和周边上皮细胞的蛋白质表达差异。将32个正常猪晶状体前囊膜所附着于的上皮细胞分为中央和周边两部分,经二维凝胶电泳分离和凝胶考马斯亮兰染色,质谱(MALD I-TOF-MS)鉴定差异蛋白质斑点,并对鉴定的蛋白质进行分类。结果显示来自中央与周边区域的猪晶体上皮细胞的蛋白在二维凝胶上分别有801和886个蛋白质斑点,鉴定出差异表达蛋白84个。差异表达的蛋白质在功能上有一定趋向性,主要涉及代谢、细胞骨架、信号转导/细胞周期/转录因子等。
- 罗琳马璇张艳莉刘炜黎明涛吴开力
- 关键词：蛋白质组学二维电泳质谱晶状体上皮细胞
