清华大学生命科学学院结构生物学中心
- 作品数：31 被引量：92H指数：6
- 相关作者：刘一苇李雪梅孙蕾金英花常咏更多>>
- 相关机构：北京大学人民医院中国科学院微生物研究所军事医学科学院野战输血研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划引进国际先进农业科技计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生农业科学理学更多>>
- 结构蛋白质组学(结构基因组学):本世纪的重大科学工程被引量：1
- 2001年
- 大规模的全基因组测序计划正产生越来越多的序列信息,而理解这些信息的关键是理解基因产物——蛋白质的功能。在后基因组时代,蛋白质的三维结构解析是揭示生命密码的重要部分。随着技术进步和大量来自公共机构和私人企业的资金投入,结构蛋白质组学研究开始启动,它的目标是采用工业化生产的方式在基因组规模去大量测定蛋白质的结构。这将会改变结构生物学家的研究方式。蛋白质结构测定的流程,从cDNA的克隆到数据收集,大部分将实现自动化。结构蛋白质组学是实验和理论计算相结合的多学科交叉的领域。目前,结构蛋白质组学仍然面临着许多技术上的挑战,这些挑战也带来了很多机遇。结构蛋白质组学产生的大量结构信息将是一笔巨大的财富,它将给制药行业带来重大变化。近年来,基于蛋白结构的合理药物设计在制药行业非常流行。同时,它也必将给生物学领域带来一场革命。
- 曾庆红饶子和
- 关键词：结构基因组学
- 关于小分子热休克蛋白Hsp16.3各功能区作用的初步研究被引量：3
- 2003年
- 小分子热休克蛋白Hsp16.3是一种存在于结核杆菌中的重要抗原,具有小分子热休克蛋白家族成员典型的3个功能区:N端疏水区,α-crystallin域和C端较短的非保守区.为了进一步研究其各功能区的作用,我们定义了Hsp16.3的3个功能区并在大肠杆菌中分别克隆、表达和纯化了N端区或C端区缺失的两个Hsp16.3残体蛋白.远紫外和近紫外圆二色谱分析结果显示,残体蛋白表现出与野生型蛋白相似的二级和三级结构.在九聚体野生型蛋白进行亚基重组装时,C端缺失的Hsp16.3残体蛋白能与野生型蛋白发生相互作用,形成异源寡聚体.在对野生型蛋白进行胰酶消化时,Hsp16.3的α-crystallin域对胰酶的消化具有抵抗能力.所有这些结果显示:在Hsp16.3的3个功能区中,α-crystallin域是一个相对独立和稳定的结构单元,它对该蛋白各级结构的维持十分重要.
- 常咏李雪梅饶子和
- 关键词：小分子热休克蛋白HSP16.3功能区
- 嗜热古菌Aeropyrum.pernixK1酰基氨基酸释放酶(AARE)的初步晶体学研究
- 酰基氨基酸释放酶(AARE),也叫酰基化肽水解酶[EC3.4.19.1],催化N酰基化肽的水解,生成N酰基氨基酸,是N端酰基化蛋白去酰基系列反应中的关键酶。同源搜索
- 王刚刚高仁钧丁怡杨海涛曹书桂冯雁饶子和
- 文献传递
- 鹅细小病毒和番鸭细小病毒核酸疫苗重组质粒的构建及表达被引量：12
- 2002年
- 将鹅细小病毒(GPV)和番鸭细小病毒(MPV)主要结构蛋白(VP2-VP3)基因克隆到核酸疫苗质粒pIRES1neo载体上,构建了核酸疫苗重组质粒pIGVP1和pIMVP,通过脂质体转染法分别将重组质粒转染到鹅胚成纤维细胞和番鸭胚成纤维细胞中,核酸疫苗重组质粒pIGVP1和pIMVP分别转染鹅胚成纤维细胞和番鸭成纤维细胞中,于转染后72h收取细胞,细胞裂解液裂解后,经Westernblot检测其表达产物可出现特异性反应带,证明表达产物具有很好的反应原性。
- 李雪梅章金刚向华陈晓月金宁一费恩阁
- 关键词：鹅细小病毒番鸭细小病毒核酸疫苗重组质粒
- IRF6调控IFN-β的功能验证与结构研究被引量：2
- 2021年
- 利用X射线衍射晶体学方法解析IRF6蛋白的三维结构,同时验证IRF6对干扰素-β的转录调控作用,为IRF6蛋白的结构生物学研究提供基础。研究利用高通量基因克隆、蛋白表达与纯化获得大量的IRF6 N端蛋白结构域可溶性表达。凝胶迁移试验(EMSA)结果显示,IRF6 N端结构域可与干扰素-β启动子核酸片段形成蛋白-核酸复合体,具有明确的相互作用。将孵育后的蛋白-核酸复合体进行悬滴气相扩散法晶体筛选与优化后获得了X射线衍射分辨率达2.68的晶体,为进一步揭示IRF6蛋白三维结构提供了帮助。验证了IRF6具有结合干扰素-β启动子元件特定片段的N端结构域,可调控干扰素-β的转录与表达,并通过IRF6 N端结构域与干扰素-β启动子核酸片段共同孵育后获得高分辨率蛋白晶体,以解析IRF6蛋白三维结构。研究结果对IRF6相关疾病机制研究及干扰素相关免疫通路的调控机制有重要意义。
- 魏迪洋闫利明李巍然贾绮林
- 关键词：干扰素-Β蛋白纯化
- SRY基因及其性别决定被引量：9
- 2001年
- 对近十年来关于脊椎动物尤其是哺乳动物的SRY基因及其性别决定机制的研究进展作了简要的综述。扼要阐述了哺乳动物的SRY基因的结构、转录、表达及其在性别决定中的作用模式及相关的基因家族。
- 郭亚平贺艳萍张红梅马恩波
- 关键词：SRY基因性染色体性别决定SOX基因
- 人类白细胞抗原-DRβ1特异性低T细胞反应性肽对T细胞激活的抑制作用被引量：2
- 2003年
- 目的 研究人类白细胞抗原 (HLA) DRβ1特异性Ⅱ型胶原 (CII)多肽的T细胞受体(TCR)结合表位改变对T细胞激活的影响。探讨通过抑制T细胞对抗原肽的识别治疗类风湿关节炎的新途径。方法 利用AutoDock3 0系统设计非T细胞结合肽 ;以激光共焦显微镜及流式细胞仪观察荧光标记的CⅡ 2 6 3 2 72修饰肽的细胞内转运及其在细胞膜上的表达 ;应用HLA DR1转基因抗原呈递细胞和特异性T细胞的激活体系 ,研究替换TCR识别氨基酸的CII修饰肽在T细胞激活中的作用。结果 计算机模拟显示CII第 2 6 3位苯丙氨酸 (F)、2 6 6位谷氨酸 (E)是与HLA DR1结合的关键位点 ,而 2 6 7位谷氨酰胺 (Q)、2 6 9位脯氨酸 (P)和 2 70位赖氨酸 (K)是T细胞识别的主要功能氨基酸。用甘氨酸 (G)、和 /或丙氨酸 (A)替换上述位点可去除功能性侧链。CⅡ修饰肽可被HLA DR1转基因抗原呈递细胞摄取并与膜表面的HLA DR1分子结合。CⅡ 2 6 3 2 72原型肽可激活T细胞 ,而用A或G单一替换 2 6 7、2 6 8、2 6 9、2 70位氨基酸或连续替换 2 6 8 2 70位氨基酸的修饰肽对T细胞的激活能力明显降低 (P <0 0 1)。低反应性修饰肽 2 70A、sub2 6 8 2 70对CⅡ诱导的T细胞激活有显著抑制作用。结论 通过替换CII中TCR特异性氨基酸可减弱或消除其对T细胞的结合能力及激?
- 周强程永静栗占国周卫红吕厚山
- 关键词：T细胞激活类风湿关节炎
- Rad5解旋酶在DNA损伤耐受途径中的多能性解析
- 许鑫周翠燕林爱洋陈柱成萧伟
- 后基因组时代与生物大分子三维结构
- 生物大分子的三维结构与功能研究在了解生命活动的规律,揭示生命现象的本质方面做出了重要贡献。迄今,在生物大分子晶体结构研究领域已有11位科学家获得诺贝尔奖。生物大分子及其复合物、组装体的完整、精确三维结构的测定,是进行结构...
- 饶子和
- 关键词：结构生物学后基因组时代
- P450cam突变体蛋白表达、纯化与结晶的改进及其四突变体(F87L/Y96F/L244A/V247A)晶体结构被引量：2
- 2004年
- 在P4 5 0cam突变体蛋白纯化过程中使用 2 80nm/ 392nm双波长比值检测蛋白质纯度 ,采用 β 巯基乙醇对蛋白质进行还原性保护 ,有效地缩短了纯化进程 ,纯化效率相应提高 .以PEG 80 0 0为沉淀剂经悬滴汽相扩散法筛选得到适合衍射的P4 5 0cam四突变体 (F87L/Y96F/L2 4 4A/V2 4 7A)晶体 ,在Mar Research面探测器系统上收集了0 2 2nm分辨率的X射线衍射数据 .采用同晶差值傅立叶法解析结构 ,最后的晶体学R因子和Rfree分别为 0 197和 0 2 4 7,键长偏差为 0 0 0 177nm ,键角偏差为 1 96°.结构测定显示P4 5 0cam四突变体 (F87L/Y96F/L2 4 4A/V2 4 7A)和P4 5 0cam野生型的整体构象无重大变化 ,突变后活性口袋变大而疏水性增加 ,这与突变设计预期目标一致 .
- 刘斌斌孙蕾徐峰娄智勇庞海L.L.WONG刘一苇
- 关键词：纯化晶体结构
