南京医科大学基础医学院生物技术系 作品数:50 被引量:221 H指数:8 相关作者: 陈宽婷 张艳 潘梅 曹芳 王帅 更多>> 相关机构: 南京工业大学食品与轻工学院 南京大学医学院 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 江苏省自然科学基金 江苏省卫生厅医学科技发展基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 文化科学 轻工技术与工程 更多>>
应用基因芯片技术检测非综合征型耳聋基因突变 被引量:25 2010年 目的:应用遗传性耳聋基因芯片对散发性聋患者进行分子病因学检测,评估其在遗传性耳聋快速基因诊断中的可靠性。方法:门诊收集散发性聋患者10例,取外周血,提取基因组DNA,用遗传性耳聋基因芯片检测4个中国人中常见的耳聋相关基因中的9个热点突变,包括GJB2(35delG、176del16bp、235delC及299delAT)、GJB3(C538T)、SLC26A4(IVS7-2A>G、A2168G)和线粒体DNA 12S rRNA(A1555G、C1494T)。同时,PCR扩增GJB2、线粒体12S rRNA基因全序列,DNA测序,以验证基因芯片检测结果的准确性。结果:在10名耳聋患者中,基因芯片方法检出1例携带线粒体DNA 12S rRNA C1494T突变;2例GJB2基因235delC纯合突变;2例235delC杂合突变;SLC26A4基因和GJB3基因未检出突变。基因芯片的结果与测序结果完全一致。结论:遗传性耳聋基因芯片技术对中国人常见耳聋相关基因热点突变的检出率高,结果准确、可靠,具有快速、高通量、高准确性、低成本等特点,能够满足临床耳聋基因检测的要求,同时结合产前诊断技术能有效预防耳聋患儿的出生,因而具有广阔的临床应用前景。 张艳 卞颖华 许鹏飞 黄辰飞 曹新 邢光前 魏钦俊关键词:耳聋 GJB2基因 线粒体DNA 基因芯片 LBL结合PBL在医学院校细胞工程课程中的应用 被引量:2 2014年 细胞工程是一门理论与实践相结合的学科,已成为医学院校生物技术、生物科学等相关专业的必修课程。在医学院校细胞工程教学中,于传统LBL教学模式基础上引入PBL教学模式,为细胞工程课程教学探索出一条PBL与LBL相结合的教学模式道路,以期提高教学质量和医学生的综合素质。 张晓 曹新 冯振卿 丁贵鹏关键词:细胞工程 生物技术 常染色体显性遗传性听神经病DFNB59基因序列分析 被引量:3 2008年 目的:了解DFNB59基因是否与一个常染色体显性遗传性听神经病(AN)中国家系的发病相关。方法:以一个现存4代9人的AN家系为研究对象,用基因组DNA抽提试剂盒提取外周血DNA。对所有家系成员DNA进行DFNB59基因第2、第4外显子的PCR扩增,1例AN病患者进行DFNB59基因全部编码区的PCR扩增,扩增产物经纯化后直接测序,测序结果与标准序列对照进行突变位点鉴定。结果:所有研究对象的基因区域均扩增成功,序列分析在DFNB59基因第2、第4外显子上未检测到T54I和R183 W2个已知的突变,整个基因编码区也未发现新的致聋突变。结论:该家系成员DFNB59基因上未发现有意义的突变位点,提示新基因参与家系AN的发生。 徐帅 陈智斌 鲁雅洁 魏钦俊 曹新 邢光前 卜行宽关键词:听神经病 基因突变 常染色体显性遗传 靶向Notch信号通路与内耳发育相关microRNA的筛选及microRNA-384-5p的实验分析 被引量:6 2018年 目的筛选内耳中靶向调控Notch信号通路的关键microRNA,验证其对Notch信号通路的调控作用。方法构建Notch信号通路相关基因与microRNA相互作用网络,筛选核心基因并提取Core-Notch子网络,再通过拓扑学分析与GO分析筛选对Notch信号通路具有调控作用的关键microRNA,并在体内、外水平进行验证。结果以筛选的microRNA-384-5p(miR-384-5p)为研究对象,预测其对Notch信号通路具有较强调控作用。实验结果显示,miR.384-5p在小鼠脑与耳蜗组织中特异性表达;miR-384-5p-mimic转染HeLa细胞后,Notch1的表达水平显著下调;双荧光素酶报告基因检测进一步验证了miR-384-5p对Notch信号通路中Notch1和Dll4的负调控作用。结论基于构建的Core-Notch网络筛选内耳发育相关的microRNA,筛选出来的miR-384-5p分子可靶向调控Notch信号通路,可作为潜在的毛细胞修复的干预靶点。 陈智斌 浦懋懋 姚俊 曹新 程雷非综合征型耳聋GJB2基因和mtDNA 12SrRNA A1555G位点的突变分析 被引量:15 2008年 目的:分析南京聋校散发性耳聋患者GJB2基因突变率和线粒体DNA(mtDNA)12SrRNA A1555G基因突变率。方法:收集聋校学生135名和健康对照人群162名外周血样本,PCR扩增GJB2和mtDNA 12SrRNA基因,通过限制性内切酶酶切鉴定突变热点,对PCR产物直接测序进行突变确定。结果:对GJB2检测结果显示:散发性耳聋患者样本中发现9种碱基改变(V27I、E114G、I203T V37I、176-191del16、235delC、299-300delAT、T123N和504insGCAA),其中235delC为主要突变方式,携带率为27.41%,其中纯合突变18例,杂合突变19例;162例正常对照中发现了15种碱基改变,其中4种为常见多态。散发聋135例和正常对照162例共计297例样本中未发现有mtDNA 12SrRNA A1555G位点突变存在;结论:GJB2基因突变是引起散发性非综合征耳聋患者听力损失发生的重要原因,不同人种GJB2基因的突变热点存在差异,235delC是GJB2基因在中国人中的主要致病突变位点;GJB2基因在人群中存在较多类型的突变和较多形式的多态性;在散发性耳聋中mtDNA 12SrRNA A1555G位点的突变率明显低于全国平均水平。 鲁雅洁 程洪波 邢光前 曹新 戴大春 陈智斌 冀强 魏钦俊 卜行宽关键词:GJB2基因 基因突变 一个母系遗传非综合征型耳聋家系线粒体12SrRNAG709A位点的突变分析 被引量:2 2009年 目的通过对一个母系遗传非综合征型耳聋家系进行线粒体DNA(mitochondrialDNA,mtDNA)12SrRNA、tRNASer(UCN)以及核基因GJB2突变分析,研究mtDNA突变与遗传性耳聋的相关性。方法临床听力测试以明确诊断,收集非综合征型遗传性耳聋家系中18例母系成员和53名对照(包括6名父系亲属、7名配偶对照和40名当地无关对照)外周静脉血样本,采用聚合酶链反应和测序技术对mtDNA12SrRNA、浓NAser(UCN)和GJB2基因进行突变分析,并对发现的基因突变进行计算机辅助的二级结构模拟分析。结果测序结果表明,此家系线粒体DNA12SrRNA存在mtDNAG709A点突变,该突变未见报道;无tRNASer(UCN)基因突变;对GJB2突变分析发现4例具有299—300delAT。计算机分析显示12SrRNA的二级结构中第8、9茎环结构发生改变。结论家系中8例耳聋患者都具有线粒体12S水NAG709A位点的突变,该突变在正常人群中具有高度保守性,提示GT09A点突变与母系遗传家系成员的进行性耳聋具有相关性;10例具有G709A突变的母系遗传家系成员未出现耳聋的临床表现,提示G709A点突变可能在其他核修饰基因的协同作用下参与了听力损害的过程。 魏钦俊 鲁雅洁 张艳 陈智斌 邢光前 曹新关键词:母系遗传 线粒体DNA RRNA 常染色体显性遗传性听神经病家系候选致病基因突变筛查 被引量:3 2012年 目的:了解DIAPH3基因以及25个已克隆的常染色体显性遗传非综合征型聋(DFNA)基因的已知突变是否与一个中国听神经病家系的发病有关。方法:以一个现存3代9人的常染色体显性遗传性听神经病核心家系为研究对象,对所有家系成员进行DIAPH3基因5′端非翻译区(5′UTR)的PCR扩增,1例听神经病患者进行DIAPH3、GJB2和GJB3基因全部编码区以及对其余23个DFNA基因的50个外显子进行PCR扩增,扩增产物经纯化后直接测序,筛查致病突变。结果:该家系未发现DIAPH3基因5′UTR的已知突变c.-172G>A和新的致聋突变,对GJB2、GJB3基因全部编码区及其余23个DFNA基因已知突变位点的筛查也无阳性发现。结论:结合前期工作,对照该家系成员DIAPH3基因及已克隆的25个DFNA基因的筛查结果,进一步提示该家系听神经病的发生可能是由新基因所致。 卢新红 陈睿春 鲁雅洁 魏钦俊 陈智斌 曹新 邢光前关键词:听神经病 基因突变 常染色体显性遗传 中国汉族非综合征耳聋患者SLC26A5 IVS2-2A>G的突变 2009年 目的:探讨SLC26A5基因IVS2-2A>G突变与中国汉族非综合征型感音神经性聋的相关性。方法:收集南京市聋校非综合征型感音神经性聋患者120例及同地区听力正常人100例外周血样本,常规方法提取DNA,聚合酶链反应(PCR)扩增SLC26A5IVS2-2区域,对PCR产物直接测序进行突变性质的鉴定。结果:所有研究对象的基因区域均扩增成功,序列分析在120名散发聋患者及100例听力正常人中均未检测到SLC26A5基因IVS2-2位点任何形式的碱基变异。结论:SLC26A5IVS2-2A>G在中国汉族非综合征耳聋及听力正常人群中携带率较低或无突变,其与遗传聋的相关性需进一步研究评价。 刘丽君 魏钦俊 陈智斌 鲁雅洁 曹新 邢光前关键词:突变 遗传性听神经病一家系线粒体DNA全序列分析 被引量:2 2006年 目的通过对一个遗传性听神经病家系进行线粒体DNA全序列分析,为确定其遗传方式提供分子基础。方法选择一个4代11人的听神经病核心家系为研究对象,对现存9名成员及40例散发聋患者外周血DNA进行12 S rRNA(nt1095)聚合酶链反应(PCR)扩增,以及对一例患者进行线粒体DNA全序列PCR扩增。扩增产物通过基因测序进行突变检测和分析。结果所有研究对象的基因区域均扩增成功。9名家系成员及40例散发聋个体12 S rRNA(nt1095)突变检测均为阴性。对一例患者线粒体DNA全序列分析发现了一系列单核苷酸多态性位点,以及一个位于MT-CO1区的nt6251 T→C转换,后者为一同义突变。结论该家系成员不存在线粒体DNA 12 S rRNA T1095C突变,对线粒体DNA全序列分析也未发现有意义的突变位点。结合临床特征和家系谱患者传递规律,确定该家系遗传方式为常染色体显性遗传。 田慧琴 程洪波 邢光前 曹新 陈智斌 魏钦俊 卜行宽关键词:线粒体 一遗传性听神经病家系的听力学表型特征 被引量:2 2007年 目的:探讨一个遗传性听神经病家系的听力学特征。方法:对23名家系成员(直系亲属21人,配偶2人)进行病史采集、体格检查及系统的听力学检测,包括纯音测听、声导抗、听性脑干反应(auditory brainstem response,ABR)、耳蜗微音器电位(cochlear microphonics,CMs)及诱发性耳声发射(evoked otoacoustic emissions,EOAEs)。对其中2名患者进行纯音听力随访。结果:7名家系成员符合听神经病诊断。其中6人于9岁前发病,1 ̄2年内快速发展为重度聋;纯音测听为双耳对称的重度 ̄极重度感音神经性听力损失,高频下降型曲线;镫骨肌反射及ABR引不出,而CMs、EOAEs正常或基本正常。1例无听力障碍主诉,言语识别率正常;纯音测听显示双耳对称的轻度高频感音神经性听力损失,镫骨肌反射及ABR引出,EOAEs及CMs正常。2例患者纯音测听随访显示听力损失进行性加重。所有患者无耳聋外表现。结论:该听神经病家系的听力学表型特征是:非综合征型、双侧对称性、高频下降为主的感音神经性听力损失,患者可表现为早年发病并快速进展的重度 ̄极重度耳聋,或成年后发病并缓慢进展的轻度听力下降。 陈智斌 邢光前 曹新 田慧琴 李晓璐 魏钦俊 卜行宽关键词:听神经病 听力学 遗传性耳聋 家系