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博士科研启动基金(2012BS15)
作品数:
2
被引量:37
H指数:2
相关作者:
许瑞瑞
曹慧
束怀瑞
张世忠
刘春香
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相关机构:
潍坊学院
山东农业大学
鲁东大学
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发文基金:
山东省自然科学基金
博士科研启动基金
国家苹果产业技术体系建设专项
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相关领域:
农业科学
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文献类型
2篇
中文期刊文章
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农业科学
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生物信息
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生物信息学
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苹果
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WRKY
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WRKY转录...
机构
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鲁东大学
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山东农业大学
作者
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曹慧
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许瑞瑞
1篇
张世忠
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宿红艳
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刘春香
1篇
束怀瑞
传媒
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园艺学报
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1篇
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苹果WRKY转录因子家族基因生物信息学分析
被引量:35
2012年
利用生物信息学方法对苹果MdWRKY转录因子家族成员、基因分类、染色体定位、系统进化关系和结构域序列保守性进行了预测,并分析基因在果实成熟期和砧穗互作中的表达差异。苹果MdWRKY家族包含116个基因,分为GroupⅠ、GroupⅡ和GroupⅢ,其中GroupⅡ又可细分为GroupⅡa、GroupⅡb、GroupⅡc、GroupⅡd和GroupⅡe亚类;苹果的17条染色体均有WRKY转录因子分布,其中第1条染色体上的分布最多,有12个WRKY基因分布。MdWRKY编码的蛋白在118~965个氨基酸范围内,等电点位于4.81~10.16之间。Microarray分析发现,在苹果果实成熟时期和砧木接穗互作过程中,多数MdWRKY基因的表达都有不同程度的变化。
许瑞瑞
张世忠
曹慧
束怀瑞
关键词:
苹果
WRKY
转录因子
生物信息学
苹果锚蛋白基因ANK家族生物信息学鉴定分析
被引量:2
2013年
利用生物信息学方法对苹果ANK基因家族成员及分类鉴定,同时对其染色体定位、系统进化关系及芯片表达特性进行了分析。苹果MdANK家族包含351个基因,根据蛋白结构域差异分为16个类别,ANK.M类型最为庞大,有143个ANK蛋白;苹果的17条染色体均有ANK家族基因分布,其中第2条染色体上分布最多,有36个ANK基因。MdANK编码的蛋白在72—2429个氨基酸范围内,等电点在4.30~11.13之间。芯片分析发现,在苹果果实成熟时期及砧木接穗互作过程中,多数MdANK基因的表达都有不同程度变化。
许瑞瑞
张世忠
宿红艳
刘春香
曹慧
束怀瑞
关键词:
苹果
基因家族
生物信息学
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