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艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项(2011ZXl0004-001)
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
相关作者:
段希洁
耿合员
杨扬
陆柔剑
谭文杰
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相关机构:
中国疾病预防控制中心
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2012
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2012年发现的新冠状病毒分子检测方法的建立与探针优化
被引量:3
2012年
目的建立2012年确定的新冠状病毒的分子检测方法,并筛选优化引物与探针。方法依据最先发表的208bp长的新冠状病毒1b片段核酸序列,比对分析后设计合成常规RT—PCR引物1对及荧光定量RT—PCR引物1对与TaqMan探针2条(TZl,TZ2),同时合成锁核酸修饰的TaqMan探针2条(LNA-TZl,LNA-TZ2)。建立检测新冠状病毒感染的常规RT—PCR方法与4种荧光定量RT—PCR,分析比较其灵敏度与特异性,同时参照欧洲发表的2种荧光定量RT—PCR引物与探针对(upE,ORFlb)建立相应方法,以合成的阳性模板比较6对荧光定量RT—PCR引物与探针的检出灵敏度。结果所合成的常规RT—PCR与荧光定量RT—PCR引物与探针皆有较好特异性,不能扩增其他人冠状病毒模板及常见呼吸道病毒模板,检出下限达50~500拷贝/反应。锁核酸修饰TaqMan探针可改善荧光定量PCR检测方法的反应性能,经锁核酸修饰的TaqMan探针与常规TaqMan探针相比,检出率提高10倍左右,其中LNA—TZl与upE探针对具最佳反应性能。结论本研究所建立的常规RT—PCR与荧光定量RT—PCR可用于新冠状病毒的分子检测,并推荐使用LNA—TZl与upE探针对。本研究为新冠状病毒分子检测方法应用与改进奠定了基础。
周为民
陆柔剑
耿合员
李辉
段希洁
杨扬
谭文杰
关键词:
冠状病毒属
分子诊断技术
核酸类
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