广西青年科学基金(0832068)
- 作品数：2 被引量：2H指数：1
- 相关作者：欧阳康吴健敏陈凤莲郭亚芬张启模更多>>
- 相关机构：广西兽医研究所广西大学更多>>
- 发文基金：家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金广西青年科学基金广西研究生教育创新计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 不同代次广西巴马小型猪内源性反转录病毒3′UTR克隆及结构和调控元件分析被引量：2
- 2011年
- 利用CDNA末端快速扩增技术(RACE)成功扩增了广西巴马小型猪近交系连续4代次及封闭群的猪内源性反转录病毒(PERV)3UTR,共获得8条序列(GenBank登录号分别为:GQ475493、GQ475494、GQ475495、GQ475496、GQ475497、GQ475498、GQ475499、GQ475500),分为638、749bp 2种不同的类型,都属于PERV-A亚型。以PERV-3UTR构建遗传进化树,PERV-A,B,C分群清晰,3UTR可作为PERV亚型区分的另一基因序列。对调控元件定位分析,推测具有749bp类型3UTR的PERV病毒转录水平更高。在所获得序列的209～227bp位置,发现了"CTTGAAACTT"10个碱基的1.9个重复。模拟RNA二级结构,广西巴马小型猪PERV-3UTR 2种类型无论从空间构型、自由能,还是茎环数量都存在明显的不同。这些结果为全面评价广西巴马小型猪来源的PERV病原安全性提供了参考。
- 欧阳康邓世杰吴健敏陈凤莲张启模郭亚芬
- 关键词：猪内源性反转录病毒广西巴马小型猪RACE
- 广西巴马小型猪内源性反转录B亚型病毒5′非编码区的序列扩增及分析被引量：1
- 2011年
- 应用SMART RACE方法快速扩增广西巴马小型猪内源性反转录病毒（PERV）5′非编码区,获得了一条长度为1 423 bp的PERV-5′UTR序列（GenBank登录号GU390231）,该序列与GenBank已发表的PERV-A、B、C各亚型同源性分别为92.4%~95.2%、91.8%~99.5%和86.5%~92.6%,遗传进化树分析,扩增序列为B亚型PERV-5′UTR。一级结构分析表明,该序列由U3、R、U5、PBS和LEADER 5个区域构成,与GenBank已发表的其他序列相比缺少344 bp。通过plantCARE数据库鉴定,GU390231序列得到28个有效的顺式作用元件,推测这些元件对PERV的转录起着或正或负的调控作用。本试验获得的PERV-B亚型5′UTR序列对进一步研究广西巴马小型猪PERV-B亚型病毒的转录调控机制奠定了基础。
- 欧阳康吴健敏陈凤莲马玲刘文娟白安斌郭亚芬
- 关键词：猪内源性反转录病毒广西巴马小型猪
