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国家自然科学基金(30730080)

作品数:4 被引量:7H指数:2
相关作者:胡志斌陈佳萍沈洪兵苗瑞芬田甜更多>>
相关机构:南京医科大学更多>>
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相关领域:医药卫生生物学农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学
  • 2篇医药卫生
  • 1篇农业科学

主题

  • 3篇单核
  • 3篇单核苷酸
  • 3篇单核苷酸多态
  • 3篇单核苷酸多态...
  • 3篇多态
  • 3篇多态性
  • 3篇核苷
  • 3篇核苷酸
  • 2篇转录
  • 1篇转录调控
  • 1篇微小RNA
  • 1篇基因
  • 1篇肺癌
  • 1篇肺癌组织
  • 1篇癌组织
  • 1篇靶基因
  • 1篇PLASMA
  • 1篇PROGNO...
  • 1篇B/C
  • 1篇LEVELS

机构

  • 3篇南京医科大学

作者

  • 3篇沈洪兵
  • 3篇陈佳萍
  • 3篇胡志斌
  • 1篇靳光付
  • 1篇周小毅
  • 1篇秦真真
  • 1篇马红霞
  • 1篇刘瑶
  • 1篇田甜
  • 1篇苗瑞芬
  • 1篇曹松玉

传媒

  • 1篇中华肿瘤杂志
  • 1篇肿瘤学杂志
  • 1篇南京医科大学...
  • 1篇Chines...

年份

  • 2篇2012
  • 1篇2011
  • 1篇2009
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
肺癌组织中miR-30c侧翼区的单核苷酸多态性对其成熟进程的影响被引量:3
2012年
目的研究不同细胞和肺癌组织中miR-30c侧翼区单核苷酸多态性rs928508(A/G)对初级miR.30c(pri—miR-30c)、前体miR-30c(pre—miR-30c)、成熟miR-30c的表达水平以及miR-30e成熟进程的影响。方法构建含有不同基因型miR-30c侧翼区的报告基因表达载体pG13-promoter—miR-30e—A和pGL3-promoter—miR-30c—G,分别与内参质粒pRL—SV40共转染于人肺癌A549细胞、人胚肾293A细胞和中国仓鼠卵巢细胞(CHO细胞)后,进行荧光素酶活性分析。采用Taqman基因分型技术对50例肺癌组织进行基因分型,以实时定量PCR法检测不同基因型组织标本中pri—miR-30c、pre—miR-30c、成熟miR-30c以及miR-30c宿主基因核转录因子Y(NFYC)的转录水平。结果在A549、293A和CHO细胞中,pG13-promoter—miR-30c—A组荧光素酶的活性与pGL3-promoter—miR-30c—G组比较,差异均无统计学意义(均P〉0.05)。荩因分型的结果昆示,50例肺癌组织中,AA基因型17例,AG基因型21例,GG基因型12例。在rs928508AG/GG基因型肺癌组织中,pre—miR-30c和成熟miR-30c的相对表达水平分别为1.306±0.878和0.384±0.227,均显著低于rs928508AA基因型组织的表达水平(分别为2.103±1.173和0.588±0.307,P=0.009和P=0.011)。而pri-miR-30c和NFYC基凶在各基因型肺癌组织中的相对表达量差异均无统计学意义(P=0.335和P=0.393)。结论在肺癌组织中,miR-30c侧翼Ⅸ的单核苷酸多态性rs928508(A/G)可以影响pri-miR-30c→pre-miR-30c→成熟miR-30c的转化进程,但不能影响pri—miR-30c合成的转录进程。
陈佳萍刘瑶胡志斌沈洪兵
关键词:单核苷酸多态性转录
Plasma Vitamin D Levels And Vitamin D Receptor Polymorphisms Are Associated with Survival of Non-small Cell Lung Cancer被引量:1
2011年
Objective:Vitamin D and its receptor(VDR) involve in multiple cellular processes and play an important role in the initiation and progression of malignancy.Thus we hypothesized that plasma vitamin D levels and single nucleotide polymorphisms(SNPs) in VDR may be of prognostic significance in non-small cell lung cancer(NSCLC).Methods:We examined plasma 25-hydroxyvitamin D [25(OH)D] levels in 87 patients diagnosed with NSCLC using enzyme-linked immunosorbent assay(ELISA) and genotyped seven potentially functional SNPs in VDR in 568 NSCLC patients on Illumina Golden Gate platform.Results:Patients with higher plasma 25(OH)D levels had worse survival than patients with lower ones(P for trend = 0.048).The SNPs of rs1544410 and rs739837 were independently associated with NSCLC survival(adjusted HR = 1.61,95% CIs = 1.06-2.45 for rs739837 AA vs AC/CC and adjusted HR = 1.51,95% CIs = 1.06-2.16 for rs1544410 AG/AA vs GG).A joint effect was observed between rs1544410 and rs739837 and the risk of death elevated as the number of unfavourable genotypes patients carried increased(P for trend = 0.003).There were no significant associations between VDR polymorphisms and plasma 25(OH)D levels.Conclusion:Our findings indicate that plasma 25(OH)D levels and genetic variants of VDR may serve as prognostic markers for NSCLC in this Chinese population.
Yao LiuWei ChenZhi-bin HuLin XuYong-qian ShuShi-yang PanJun-cheng DaiGuang-fu JinHong-xia MaHong-bing shen
关键词:PROGNOSIS
miR-196a2成熟区单核苷酸多态性对靶基因LSP1表达的影响被引量:3
2009年
目的:研究miR-196a2成熟区单核苷酸多态性rs11614913(T/C)对预测靶基因LSP1表达的影响。方法:构建含有不同基因型miR-196a2的真核表达载体pCDNA3.1-miR196a2-C和pCDNA3.1-miR196a2-T;同时利用化学合成含有不同基因型的成熟miR-196a2探针miR-196a2-C和miR-196a2-U。将靶基因LSP1的3’UTR序列克隆至pMIR-REPORTTM Luciferase载体中而获得LSP1报告基因载体pMIR-LSP1。采用所构建的miR-196a2真核表达载体以及化学合成的成熟miR-196a2探针分别与靶基因LSP1报告基因载体组建两套转染体系,分别共转染于HEK293、A549和CHO三种细胞后进行荧光素酶活性分析。结果:miR-196a2真核表达载体与靶基因LSP1报告基因表达载体共转染于HEK293、A549和CHO三种细胞后进行荧光素酶活性分析,pCDNA3.1-miR196a2-C等位基因荧光素酶相对活性与pCDNA3.1-miR196a2-T等位基因相比均有显著降低(P<0.05);含不同基因型的化学合成的成熟miR-196a2探针与靶基因LSP1报告质粒共转染HEK293、A549和CHO三种细胞,miR-196a2-C等位基因荧光素酶活性与miR196a2-T等位基因相比也有显著降低(P<0.05)。结论:荧光素酶活性强弱间接反映了miR-196a2与靶基因LSP1结合能力的大小,当miR-196a2成熟区rs11614913位点为C时,miR-196a2可能更为有效地与预测靶基因LSP1结合,从而在转录后水平调控靶基因表达。
陈佳萍胡志斌田甜周小毅苗瑞芬靳光付马红霞沈洪兵
关键词:单核苷酸多态性
miR-34b/c启动子区单核苷酸多态性对其转录调控的影响
2012年
[目的]研究miR-34b/c启动子区单核苷酸多态rs4938723(T/C)对其转录调控的影响。[方法]构建含有不同基因型miR-34b/c启动子区的报告基因表达载体pGL3-basic-miR34b/c-T和pGL3-basic-miR34b/c-C,分别与内参质粒SV40共转染于Hela、A549和CHO三种细胞后进行荧光素酶活性分析。[结果]pGL3-basic-miR34b/c-C等位基因组荧光素酶相对活性与pGL3-promoter-miR30C-T组等位基因相比,均有显著升高(P<0.01)。[结论]荧光素酶活性强弱间接反映了miRNA启动子区遗传变异对转录活性的影响,当miR-34b/c启动子区rs4938723位点为C时,可以更为有效地增加miR-34b/c的转录产物,从而在转录水平上调控miRNA的表达。
陈佳萍秦真真曹松玉胡志斌沈洪兵
关键词:单核苷酸多态性
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