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MicroRNA与神经胶质瘤被引量：2: 2009年; microRNAs（miRNAs）是一类内源性约20~25nt的非编码RNA,在多种生命过程中扮演着重要的角色.神经胶质瘤起源于神经胶质细胞,又称胶质瘤,是成人最常见的原发性颅内肿瘤,其患者预后极差.近年来研究表明miRNAs表达失控与神经胶质瘤发生发展密切相关.本文就miRNAs在神经胶质瘤中作用的研究进展等方面进行了总结.; 严骁李隽黎孟枫; 关键词：MIRNA 肿瘤神经胶质瘤

MicroRNA与肿瘤血管生成被引量：2: 2009年; microRNA(miRNA)是近年来发现的一类长度约为22个核苷酸的非编码小分子RNA.它主要通过与靶标基因3′UTR的完全或不完全配对,降解靶标基因mRNA或抑制其翻译,从而参与多种生命活动.血管生成在肿瘤的发生、发展过程中起着重要的作用.实验证据表明,miRNAs可通过调控其靶标基因参与的信号通路,影响肿瘤血管的生成.本文主要介绍近年来miRNAs与血管生成相关性研究的进展.; 方坚鸿熊玉娟庄诗美; 关键词：MIRNA 内皮细胞肿瘤血管生成

tRNA在基因表达中的调控作用被引量：4: 2009年; 转移核糖核酸(transfer RNA,tRNA)是遗传信息传递过程中的"适配器"分子,它们能够把mRNA所携带的遗传信息准确地翻译成蛋白质的氨基酸序列.然而,近年来的研究表明,tRNA在基因表达过程中还具有重要的调控作用.当生物面临外界某些营养压力胁迫时,空载tRNA可作为效应分子影响细胞整体基因表达水平,从而使机体应对不利的环境.在酵母和某些哺乳动物细胞中,tRNA可以从细胞质逆行回细胞核.这种逆行一方面可以使细胞核的监控系统连续地监控tRNA的完整性,另一方面,在营养缺乏时,逆行回细胞核的tRNA可以有效地降低蛋白质的合成水平.最新研究表明,tRNA并不是绝对稳定的RNA分子.在某些生理或逆境胁迫下,tRNA在其反密码环或反密码环左臂处被内切酶特异性切割成不同长度的片段.这些切割并不是无意义的随机降解现象,而有可能产生一类新的信号分子,如tRNA半分子或sitRNA,它们与生物应激反应中细胞整体代谢的基因表达调控有着密切的关系.关于tRNA调控功能的研究是一个新的前沿领域,它将揭示tRNA结构与功能的多样性及其在遗传信息表达过程中的重要作用.; 李岩周惠; 关键词：TRNA 基因表达应激

果蝇3个新的小分子非编码RNA的鉴定被引量：5: 2006年; 通过比较基因组和分子生物学方法分析了果蝇属中5种果蝇全基因组内含子区域的保守序列，获得了3个新的非编码RNA基因．其中一个为具有典型的box C／D家族保守元件及结构特征的核仁小分子RNA基因，其功能序列可介导28S rRNA的C2673位点的核糖甲基化修饰．另外两个为miRNA基因，其转录序列可形成典型的miRNA前体茎环结构：在果蝇发育的4个时期均可表达产生长度为23个核苷酸的成熟RNA分子．结果还表明，在长度为100—500bp区间的黑腹果蝇基因内含子中存在396个多物种保守序列（MCIS），这些序列除编码小分子RNA外，还可能与影响基因转录或转录后加工的顺式元件有关．; 贺华良周惠肖振东曾献芬陈俊宇郑涛屈良鹄; 关键词：果蝇 BOX SNORNA MIRNA 内含子

Identification and evolution-ary implication of four novel box H/ACA snoRNAs from Giardia lamblia被引量：1: 2006年; From a specialized cDNA library, four novel box H/ACA snoRNAs, named GLsR22, GLsR23, GLsR24 and GLsR25, were identified from the primitive eukaryote, Giardia lamblia. Bioinformat- ics analyses indicated that all of them can be poten- tially folded into double hairpins, the typical secon- dary structures of box H/ACA snoRNAs. GLsR24 and GLsR25 are predicted to guide the site-specific pseudouridylation at U1753 and U2396 on 23S rRNA, respectively, while GLsR22 and GLsR23 belong to the family of “orphan” snoRNAs. All of the four novel snoRNAs are encoded by single copy genes and located in small intergenic regions. Interestingly, compared with the counterparts previously reported in Archaea and other unicellular protozoan, the box H/ACA snoRNAs identified from G. lamblia have unique structural features, implying that snoRNAs evolved from prokaryotes to eukaryotes in different ways.; LUO Jun ZHOU Hui CHEN Chongjian LI Yan CHEN Yueqin QU Lianghu; 关键词：贾第虫核糖核酸

Identification of three novel noncoding RNAs from Drosophila melanogaster被引量：2: 2006年; 三新奇小非编码的 RNA 从 D 的保存 intronicregions 被识别。由使用比较基因组学方法和分子的生物学途径的 melanogaster。Oneis 以一个 combinated 方法的新奇 snoRNA，它 snoRNAfamily 显示典型地代表 C/D 盒子的结构的特征并且为在 C2673 指导 D.melanogaster 28S rRNA 的 2''-O-methylation 拥有一个 10-nt-long rRNA 反感觉元素。另外的二是预言先锋采用已知的 miRNA 的 astem 环结构特征的 miRNAs。二 miRNAs 基因看起来有无所不在的表示侧面， ~ 23-nt RNA 抄本由北弄污检测了。我们的学习 revealed396 多种类 intronic 保存了与长度 from100 在 introns 嵌套到 500 bp 的序列(MCIS ) 。除了编码的小 RNA， MCIS 可能作为涉及基因抄写或 post-transcriptional 处理的 c/s-acting 元素工作。; HE Hualiang ZHOU Hui XIAO Zhendong ZENG Xianfen CHEN Junyu ZHENG Tao QU Lianghu; 关键词：果蝇 MIRNA 分子生物学

Mir-200b抑制膀胱癌细胞T24的迁移被引量：1: 2010年; 目的在膀胱癌细胞系中过表达mir-200b,观察其对T24细胞迁移能力的影响,并检测WASF-3表达水平的改变。方法将mir-200b mimic,WASF-3 siRNA及阴性对照分别转染T24细胞,通过qPCR及Western印迹实验检测WASF-3表达水平的改变;利用Transwell实验检测转染后T24细胞迁移能力的改变。结果转染mir-200b及WASF-3 siRNA后WASF-3在mRNA及蛋白水平上均有明显下降,同时细胞迁移能力亦有明显下降。结论mir-200b能够通过改变WASF-3的表达水平抑制膀胱癌细胞系T24的迁移能力,为进一步探索miRNA在膀胱癌发生发展过程中的作用提供了研究基础。; 夏伟宋涛李洁陈留存李少华丁红梅王芳邵宁生; 关键词：微小RNA 膀胱肿瘤 T24

小鼠sidt2基因的可变剪接验证: 2008年; 目的:验证小鼠基因sidt2中sidt2(l)和sidt2(s)为同一基因经可变剪接所得的结果。方法:对小鼠sidt2基因进行生物信息学分析及基因组PCR,确定其基因组定位情况;通过提取总RNA、RT-PCR,了解sidt2在小鼠多种组织中的表达情况;构建可变剪接报告载体,转染小鼠肝癌细胞Hepa1-6,并提取细胞总RNA、RT-PCR,检测其在细胞中的剪接行为,验证该基因存在可变剪接。结果及结论:证实小鼠sidt2存在可变剪接,其两条序列sidt2(l)和sidt2(s)为可变剪接的产物。; 刘舒云李洁陈留存曹国军李少华赵强丁红梅高亚萍刘农乐王芳杨光邵宁生; 关键词：可变剪接组织表达谱

非编码RNA与哺乳动物基因组印记的起源被引量：5: 2009年; 基因组印记是由亲本来源不同而导致等位基因表达差异的一种遗传现象,主要发生在胎盘哺乳动物(真哺乳类)和显花植物中.大部分印记基因都分布在印记基因簇内,其中包含大量的非编码RNA基因.印记基因的表达受印记控制区(ICRs)的顺式调控.基因组印记产生的原因及过程是现代遗传学研究的一个热点问题,分析印记同源区从非印记物种到印记物种的过渡,为解决这一问题提供了重要启示.最近,原始哺乳动物(有袋类和单孔类)模式物种全基因组测序的完成,极大地促进了印记同源区的比较分析研究.本文对这些研究进行了回顾和分析,发现非编码RNA与哺乳动物基因组印记获得关系密切.主要依据为:(1)伴随着基因组印记的获得,印记区有大量的非编码RNA新基因出现;(2)与基因组印记相关的一些保守非编码RNA的表达发生了显著变化.此外,对15种脊椎动物中印记snoRNA基因系统分析的结果表明:印记snoRNA起源于真哺乳类与有袋类动物分化之后,并且在真哺乳类辐射进化之前发生了迅速的扩张,主要的基因家族在这一时期已经形成.这些结果进一步证明了非编码RNA与基因组印记获得的密切联系.非编码RNA可能主要通过调控印记表达和诱导染色体表观遗传修饰两种机制,参与哺乳动物基因组印记的获得.; 张意军屈良鹄; 关键词：基因组印记哺乳动物非编码RNA

计算RNA组学:非编码RNA结构识别与功能预测被引量：5: 2010年; 真核生物基因组中包含大量非编码RNA基因,计算RNA组学采用信息科学等多学科方法解析ncRNA的结构与功能.本文就ncRNA数据存储与管理、ncRNA基因识别与鉴定、ncRNA靶标识别与功能预测等问题,对目前计算RNA组学的主要研究方法和内容进行了评述.; 郑凌伶屈良鹄; 关键词：非编码RNA 转录组

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