国家自然科技资源平台项目(2005DKA21209)
- 作品数：13 被引量：127H指数：6
- 相关作者：邵宗泽杜宗军赖其良张志明卓跞更多>>
- 相关机构：国家海洋局第三海洋研究所厦门大学山东大学更多>>
- 发文基金：国家自然科技资源平台项目国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学环境科学与工程轻工技术与工程化学工程更多>>
- 西南印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的富集分离与多样性分析被引量：2
- 2008年
- 【目的】为了筛选深海砷抗性菌,了解印度洋中脊深海沉积物砷抗性菌的多样性情况。【方法】通过砷富集培养,筛选出砷抗性菌;通过变性梯度凝胶电泳(DGGE)分析与构建16S rDNA克隆文库法两种手段分析了富集物中砷抗性菌的多样性。利用兼并引物PCR,从抗性菌株中克隆与砷抗性相关的基因。【结果】共筛选到8株砷抗性菌,分别属于γ-proteobacteria的5个不同的属。其中,菌株AS-I1-3的抗性最高,可以在26×10-3mol/L三价砷存在的情况下生长,该菌株的16S rDNA序列与菌株Pseudoalteromonas tetraodoni IAM同源性最高(100%)。DGGE分析显示,该菌是富集物中的最优势菌,其次是盐单胞菌(Halomonas)和海杆菌(Marinobacter)。16S rDNA克隆文库分析结果进一步证明,与菌株AS-I1-3序列相同的克隆子占整个克隆文库的72.5%;而与菌株AS-I1-5(Halomonas meridiana,100%)和菌株Mn-I1-6(Marinobacter vinifirmus,99%)序相同的克隆子分别占10%和7.5%。然而,利用兼并引物PCR,仅能从2株非优势菌中克隆到了与砷抗性相关的基因,表明菌群中的优势抗性菌可能有其他的抗性机制。【结论】在深海环境中存在着多种砷抗性菌,其中Pseudoalteromonas属的菌株是该富集条件下的砷抗性优势菌。这些砷抗性菌在大洋环境砷元素的生物地球化学循环中的作用有待进一步研究。
- 陈双喜邵宗泽
- 关键词：深海沉积物生物多样性
- 印度洋表层海水石油降解菌的多样性分析被引量：9
- 2010年
- 【目的】为了研究印度洋石油降解菌多样性,并获得新的石油降解菌。【方法】本研究通过印度洋表层海水样品采集、以柴油与原油1：1混合物作为碳源,从中富集、分离筛选石油降解菌,并通过PCR-DGGE对13个站点富集菌群的菌群结构进行分析。【结果】通过形态观察、生理生化反应和16SrRNA分析,共得到共29个属的51株不同的细菌,它们主要是属于α亚群和γ亚群。其中,Alcanivorax属（占18%）,Novosphingobium属（占10%）和Marinobacter（占6%）Thalassospira（占6%）为主要的优势菌。通过生态多样性分析表明,Shannon-Winner指数（H）为4.57968,说明其具有较高的多样性;均匀度指数（E）为0.8664771,表示其分布比较均匀。单菌实验表明,49株具有石油降解能力其中,Sinomonas,Knoellia,Mesoflavibacter等属的细菌为首次发现有降解能力。DGGE分析表明Alcanivorax属的细菌是印度洋表层海水中的重要石油降解菌。【结论】本研究首次揭示了印度洋表层海水中石油降解菌的多样性,并获取了若干在海洋石油污染生物修复中具有应用前景的降解菌。
- 吴常亮王鑫邵宗泽
- 关键词：生物降解石油海洋细菌多样性DGGE
- 海洋细菌Bacillus sp.HN07的分离鉴定及所产碱性纤维素酶性质研究被引量：4
- 2009年
- 从渤海海域(121°30′00″E,40°25′00″N)海泥中筛选到一株产碱性纤维素酶的海洋细菌。通过形态观察、生理生化特性及16S rDNA序列分析,鉴定该菌株属于芽孢杆菌属(Bacillus),命名为Bacillus sp.HN07。研究表明:HN07最适生长温度30℃,适宜在pH7.0～8.0、含2.0%～3.0%NaCl的培养条件下生长和产酶,并且具有较好的遗传稳定性。酶学性质初步研究显示,HN07所产碱性纤维素酶最适反应温度为45℃,最适pH为8.0,在碱性条件下具有较好的稳定性,具有潜在的工业应用价值。
- 徐庆强王延明张志明卓跞殷丽莎郭琳杜宗军
- 关键词：碱性纤维素酶海洋细菌
- 不动杆菌生物乳化剂活性成分研究被引量：6
- 2008年
- 通过乳化活性分析、化学成分分析和相关基因的分析,对3株海洋来源的不动杆菌分离株和2种不动杆菌模式菌的生物乳化剂产生能力和活性成分进行了分析,结果表明,这些菌都能产生生物乳化剂.通过PCR检测,其中只有深海菌株wp02421编码与乳化剂Emulsan产生密切相关的酯酶基因.气质联用仪证明该菌所产的乳化剂含有脂肪酸组分,主要是正十六烷酸和正十八烷酸,表明菌株wp02421产生的乳化剂与Emulsan类似,糖脂是主要活性成分之一.此外,通过PCR检测,证明了5株不动杆菌全部编码外膜蛋白A基因(ompA).它们的氨基酸序列与Acinetobacter radioresistens KA53的乳化剂Alasan中的主要活性蛋白AlnA的同源性为71.26%～80.23%.以上结果表明,5株菌的生物乳化剂中都可能含有AlnA的乳化蛋白,而菌株wp02421同时还产类似Emulsan的糖脂.
- 李晴邵宗泽
- 关键词：不动杆菌酯酶外膜蛋白A
- 一株海洋锰氧化细菌对Mn(Ⅱ)的氧化去除研究被引量：5
- 2009年
- 锰氧化微生物能够将可溶的Mn2+氧化为不溶的锰氧化物沉淀,因此在生物除锰上具有重要应用价值。以1株分离自太平洋深海的锰氧化细菌Brachybacterium sp.Mn32为试验对象,研究了其最佳生长pH值和NaCl质量体积分数,Mn2+抗性以及对Mn2+的氧化去除能力等。结果表明,Mn32在pH值7.0时生长最快(pH值4～10下生长),最佳生长NaCl质量体积分数为4.5%(0～15%下生长)。Mn2+对Mn32的最小抑菌浓度为55 mmol·L-1,在2 d之内Mn32对0.2 mmol·L-1 Mn2+的去除率达到99%以上。电镜扫描观察表明,所得到的锰氧化物存在于Mn32细胞的间隙和表面。
- 王文明邵宗泽王革娇
- 关键词：电镜扫描
- 两株不动杆菌属细菌的鉴定和耐药特性被引量：2
- 2009年
- 采用常规方法对从海洋环境中分离到的两株多重耐药性细菌——JS12和D7012进行分离培养,以16S rDNA序列、形态学特征、培养特征和生理生化特征进行分类鉴定;用39种抗生素药物进行药敏试验,并使用碱变性法提取质粒DNA。结果JS12被鉴定为Acinetobacter johnsonii;D7012被鉴定为Acinetobacter sp.,在进化树中与Acinetobacter baumannii亲缘关系最近,但16S rDNA序列同源性未达到种的水平。39种抗生素中,JS12耐药16种,D7012耐药29种;它们都含有质粒DNA,大小约为5kb。来自海洋环境的非临床多重耐药株警示了滥用抗生素的严重后果,同时可以作为模型,提供耐药基因定位及耐药机制多样性的新视野。
- 张婉熠魏桂华夏鸿杰杜宗军
- 关键词：海洋环境不动杆菌属多重耐药性质粒
- 南海南沙海域沉积物中可培养微生物及其多样性分析被引量：32
- 2008年
- 【目的】为了从南沙海域中分离获得微生物菌种资源,【方法】本文通过沉积物采样、可培养菌分离及16S rRNA鉴定,【结果】从22个站点的沉积物样品中获得349株细菌,分属于87个种。发现产芽孢细菌分布最广,并在10个站点的分离株中占多数;它们是Bacillus,Halobacillus,Brevibacillus,Paenibacillus,Pontibacillus和Thalassobacillus。其中芽孢杆菌(Bacillus)无论在数量上还是种类上都最多,分别属于34种,其中有8个可能的新种。此外,γ-Proteobacteria是分离率较高的另一亚群;其中,假单胞菌(Pseudomonas),海杆菌(Marinobacter),食烷菌(Alcanivorax)属的细菌最多。统计还发现,在深度750～2000 m之间,低GC含量的细菌最丰富,而深度2000 m以下,分离株则全部为γ-Proteobacteria。【结论】南沙沉积物可培养微生物中产芽孢细菌及γ-Proteobacteria比较丰富;其中,产芽孢细菌的多样性最高,具有进一步研究开发价值。
- 孙风芹汪保江李光玉刘秀片杜雅萍赖其良邵宗泽
- 关键词：海洋细菌生物资源芽孢杆菌
- 产碱性纤维素酶海洋细菌的筛选、鉴定及酶学性质研究被引量：22
- 2009年
- 用CMC平板筛选方法，从青岛近海海域海水中分离出一株产碱性纤维素酶的海洋菌株QM11，经16S rDNA鉴定，该菌株为Cytophaga fucicola。对该菌的生物学特性研究表明，其最适生长温度为27℃，生长温度范围为4-48℃，为耐冷菌；在pH7．0～8．0、含3．0％NaCl的培养基条件下，最适宜菌株生长和产酶；QM11所产碱性纤维素酶最适反应温度为40℃，最适反应pH为9．0，在碱性条件下具有较高的酶活性和较好的稳定性。Mn^2＋、Fe^3＋对酶反应具有促进作用，Cu^2＋、Pb^2＋对酶反应具有抑制作用。
- 徐庆强张志明王延明卓跞殷丽莎杜宗军
- 关键词：碱性纤维素酶海洋细菌耐冷菌
- 海洋烷烃降解菌Alcanivorax sp．A-11-3的分离鉴定及其降解酶基因研究被引量：14
- 2008年
- 从马六岬海峡的表层海水中分离到一株石油降解菌A-1l-3．经16SrDNA Blast结果表明其与Alcanivorax borkumensisSK2具有最高相似性为96％，该菌可能是食烷菌属的一个新种．该菌具有很强的石油降解能力．结果表明，A—11—3对烷烃的降解范围较宽，能以C8～C36的烷烃为唯一碳源和能源生长；在7d内该菌对柴油的降解率达到49．5％．此外，还从菌株中克隆到了大小为426bp的烷烃羟化酶基因alkB片段和843bp的P450烷烃羟化酶基因的部分序列．序列分析表明，alkB片段编码的氨基酸序列与4．60rkumensis SK2^T的AlkB1和AlkB2的同源性分别为57．75％和40．14％；该菌的P450与SK2菌株的P450具有最高同源性，为87％．研究结果对于海洋石油降解微生物生态研究及石油污染生物修复技术开发有参考价值．
- 吴业辉邵宗泽
- 关键词：石油降解菌
- 厦门近海海水中多环芳烃降解菌的原位富集与降解菌多样性被引量：3
- 2010年
- 【目的】为了分析厦门近海原位海水中多环芳烃降解菌的多样性。【方法】将涂有菲的聚氯乙烯(PVC)板悬挂在厦门国际邮轮码头的海水中,进行菲降解菌的原位富集。利用变性梯度凝胶电泳(Denaturinggradient gel electrophoresis,DGGE)和16S rRNA基因文库两种方法分析了在PVC板表面富集微生物的菌群结构。之后,在实验室模拟原位条件下,对PVC板表面富集的菲降解菌群进行进一步富集、分离和初步鉴定。【结果】PVC板在海水中浸没6 d后,16S rRNA基因文库分析表明,在涂菲的PVC板表面富集的菌群中解环菌属(Cycloclasticus)对应的克隆子占文库总克隆子的50%;在未涂菲的PVC板表面吸附的菌群中红杆菌科(Rhodobacteraceae)为优势菌,其对应的克隆子占文库总克隆子的47%;而解环菌属的克隆子只占文库总克隆子的2%。DGGE的分析结果也证明解环菌是菲原位富集降解菌群中的优势菌。实验室进一步富集后,从该菌群中分离鉴定出14株细菌,其中一株新鞘氨醇杆菌B14(Novosphingobium sp.B14)具有菲降解能力。但是,解环菌未能获得纯培养。【结论】菲原位富集发现,厦门近海水体中解环菌是多环芳烃的主要降解菌。
- 陈亮董纯明何进邵宗泽
- 关键词：多环芳烃生物降解
