辽宁省自然科学基金(20062189)
- 作品数：13 被引量：43H指数：4
- 相关作者：齐小辉闫建芳刘秋程浩于基成更多>>
- 相关机构：大连民族学院沈阳农业大学辽宁省微生物科学研究院更多>>
- 发文基金：辽宁省自然科学基金国家自然科学基金辽宁省教育厅科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学化学工程理学更多>>
- 6种链霉菌基因组DNA提取方法比较被引量：15
- 2008年
- 采用优化SDS、SDS、优化CTAB、CTAB、液氮研磨、微波法分别提取委内瑞拉链霉菌基因组DNA,比较6种方法的差异,选出最佳提取方法分别提取S.fradiae,S.venezuelae,S.ambofa-ciens,S.glaucescens,S.coelicolor基因组DNA,并利用16S rDNA的通用引物扩增相应的目的基因。结果表明:6种方法制备的基因组DNA以优化SDS法和微波法为上选,后者的纯度高但量很少。优化SDS法是6种提取方法中最可靠的DNA提取方法,DNA量大,纯度高,可靠,可作为PCR反应的模板进行16S rDNA基因有效扩增。
- 刘炳辉曹远银闫建芳齐小辉程浩刘秋
- 关键词：放线菌基因组DNA提取PCRRDNA
- 番茄叶霉病拮抗放线菌菌株A-10的鉴定被引量：1
- 2009年
- 对分离自东北蔬菜保护地土壤的1株番茄叶霉病拮抗放线菌菌株A-10进行了形态学、培养特征及生理生化分析。鉴定结果表明:放线菌A-10除在ISP4培养基上不生长之外,在大多数培养基上生长良好,基内菌丝无横隔,不断裂,气生菌丝体形成孢子链,孢子丝呈波曲、直形或形成单环。上述特征与纤维素链霉菌(Streptomyces cellulosae)高度相似。聚类分析结果表明,二者的16S rDNA序列的相似性达到了99%。因此,可将链霉菌A-10定名为纤维素链霉菌A-10(Streptomyces cellulosaeA-10)。
- 程浩齐小辉闫建芳于基成刘秋刘志恒
- 关键词：链霉菌生物学特性RDNA序列番茄叶霉病
- 利用KS基因筛选Ⅱ型聚酮类化合物产生菌的方法研究
- 2010年
- 根据酮基合酶编码基因（ketoacyl synthase，KS）的同源性设计简并引物，并利用PCR技术快速筛选携带聚酮类化合物编码基因的放线菌菌株．试验筛选了33株放线菌菌株，检测获得PKSⅡ型阳性菌株16株．克隆并测序获得16条KS基因序列，进行BLAST同源性比对，与GenBank中已知的KS基因序列的相似度在89％～99％之间．提交GenBank，获得的各菌株KS基因登录号为FJ620885～FJ620889，FJ620892，FJ878801～FJ878810．抑菌实验表明，携带KS基因的16株放线菌中，13株具有抑制真菌活性，2株具有抑制革兰氏阳性细菌活性．系统进化树分析表明16株放线菌可以分为7个类群，其中，具有产生新獭聚酮类化合物潜力的菌株8株，说明筛选出的KS基因具有一定的多样性．结果表明，利用PCR技术可以快速有效筛选Ⅱ型KS基因，为生物资源的开发利用莫定基础．
- 姜华李晶闫建芳胡英畅齐小辉刘秋
- 关键词：放线菌抑菌活性
- 瓜类枯萎病拮抗放线菌H628的鉴定被引量：6
- 2008年
- 对分离自东北地区针叶林土壤中的一株拮抗放线菌菌株H628进行了形态学、培养特征及生理生化分析,鉴定结果表明:放线菌H628在大多数培养基上生长良好,基内菌丝无横隔,不断裂,气生菌丝粉红色,生长茂盛,孢子丝呈松敞螺旋或直形。上述特征与弗氏链霉菌(Streptomyces fradiae)高度一致。聚类分析表明,二者的16S rDNA序列的同源性达到了99%。因此,可将放线菌H628定名为弗氏链霉菌H628(S.fradiae H628)
- 刘秋齐小辉闫建芳程浩于基成
- 关键词：链霉菌生物学特性RDNA序列
- 瓜类枯萎病拮抗放线菌T8-41的鉴定
- 2008年
- [目的]为阐明1株拮抗放线菌菌株的分类地位提供依据。[方法]以从东北地区蔬菜保护地土壤中分离的1株拮抗放线菌菌株T8-41为试材,分析其形态和培养特征、细胞壁成分和生理生化特性。经PCR扩增后,对其与相关菌株的16S rDNA进行同源性分析和聚类分析。[结果]拮抗菌株T8-41属于典型的链霉菌属菌丝形态。其细胞壁中含有L-DAP和甘氨酸,细胞壁类型为I型。该菌可利用D-木糖、L-鼠李糖、D-果糖、蔗糖、棉子糖、葡萄糖、D-甘露醇和肌醇,但不利用乳糖。可以初步鉴定为绿产色链霉菌。T8-41菌株的16SrDNA全长为1 465 bp,与绿产色链霉菌相似性达99%。[结论]链霉菌T8-41属于青色类群的绿产色链霉菌,可将其定名为绿产色链霉菌T8-41(S.viridochromogenes T8-41)。
- 刘秋闫建芳齐小辉于基成张磊
- 关键词：链霉菌16SRDNA序列
- 聚酮类化合物生物合成基因簇与药物筛选被引量：11
- 2008年
- 由微生物和植物产生的聚酮类化合物的数量极其庞大,是一大类结构多样化和生物活性多样性的天然产物,已经成为新药的重要来源。介绍了3种类型聚酮类化合物生物合成基因簇的特点,即以模块形式存在的Ⅰ型聚酮合酶,包含一套可重复使用结构域的Ⅱ型聚酮合酶以及不需要ACP参与,以植物中的查耳酮合酶为代表的Ⅲ型聚酮合酶。同时,还介绍了基于3种类型聚酮类化合物生物合成基因的特点,利用分子生物学方法构建筛选探针,进行当前药物基因筛选的进展。
- 刘炳辉曹远银闫建芳齐小辉程浩黄盼盼刘秋
- 关键词：聚酮合酶基因簇药物筛选
- 利用降落PCR扩增KS基因
- 2008年
- 通过优化SDS法提取链霉菌(Streptomyces spiramyceticus)和2株由生物技术与资源利用国家民委——教育部重点实验室分离获得的放线菌D8和D18基因组DNA,同时应用降落PCR和普通PCR扩增酮基合酶基因(ketosynthase,KS)。结果表明,扩增出的特异性条带与目的基因片段长度一致,降落PCR法较普通PCR法扩增KS基因特异性更高。使用普通Taq酶,降落PCR程序能明显提高PCR的特异性,它可用于扩增普通PCR难以扩增的基因片段,或在假阳性难以去除的情况下提高PCR的特异性。
- 刘炳辉曹远银程浩闫建芳齐小辉刘秋
- 关键词：降落PCR退火温度
- 放线菌MY02发酵液活性组分的HPLC分离方法研究被引量：2
- 2009年
- 放线菌MY02的发酵提取物对黄瓜枯萎病有显著的抑菌活性,由紫外光谱分析结果初步判断其为四烯大环内酯类化合物。采用高效液相色谱法(HPLC)分离其活性组分,通过分析参数的优化,确定了最佳色谱分离条件:Sinochrom ODS-BP柱(300×4.6 mm i.d.,5μm),流动相为V(甲醇)∶V(水)=80∶20等度洗脱,流速0.4 mL/min,20℃,检测波长304 nm。方法可满足对MY02发酵液活性组分的分离要求。
- 齐小辉闫建芳黄盼盼于基成刘秋
- 关键词：活性组分HPLC
- 抗真菌抗生素SN06对小白鼠毒性实验被引量：3
- 2009年
- 新型农用抗生素SN06是由龟裂链霉菌菌株MY02(Streptomyces rimosus)产生的一种多烯大环内酯类抗生素。该抗生素对多种植物真菌病害都有较好的防治效果。以昆明种小白鼠作为实验对象,以静脉注射、精子致畸、皮肤刺激性3种实验对农用抗生素SN06的急性毒性进行分析。抗生素SN06对小白鼠静脉注射LD50值为199.53μg/kg。精子致畸实验结果表明抗生素SN06无致畸作用。皮肤毒理实验表明小白鼠对抗生素SN06无不良中毒反应。
- 刘秋闫建芳胡树仁齐小辉程浩于基成
- 关键词：毒性静脉注射皮肤毒性
- 放线菌gan-1的分类鉴定
- 2009年
- 对具有拮抗活性的放线菌gan-1的形态、生理生化特性、细胞壁化学组分以及16SrDNA序列进行了研究分析。结果表明,放线菌gan-1的菌落特征及生理生化特性与弗氏链霉菌(Streptomyces fradiae)高度一致,二者的16SrDNA序列的相似性达到了99%。因此,可将菌株gan-1定名为弗氏链霉菌gan-1(Streptomyces fradiae gan-1)。
- 闫建芳齐小辉刘秋程浩
- 关键词：RDNA
