中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目(2008JBYWF-22)
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 相关作者：曾令兵徐进范玉顶肖艺周勇更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院淡水渔业研究中心中国水产科学研究院长江水产研究所华中农业大学更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目国家现代农业产业技术体系建设项目“十一五”国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 长江草鱼多态微卫星位点的分离及后备亲鱼的遗传多样性分析被引量：4
- 2010年
- 本研究采用磁珠富集法分离了10对具有多态性的草鱼(Ctenopharyngodon idellus)微卫星位点,并对140条长江野生草鱼组成的后备亲鱼群体的遗传结构进行了分析。结果显示:本试验得到的草鱼微卫星序列主要是以2个碱基为重复单位、重复次数在5～22之间的多重复单元,重复次数在10次以上的微卫星序列较易得到多态性;77个微卫星座位中,完美型、非完美型和混合型微卫星标记所占的比例分别为87.01%、2.60%和10.39%;群体遗传分析显示,10个多态性微卫星座位中,除了GC39座位外,其它座位都符合哈迪-温伯格平衡,适用于草鱼群体的遗传结构分析;每个座位检测到3～8个等位基因,平均有效等位基因数为3.9302,多态信息含量在0.4129～0.8107之间变动,平均为0.6678,除了GC78座位为中度多态外,其他9个座位均为高度多态。基因分化系数、Shannon指数、平均观测杂合度和平均期望杂合度的平均值分别为0.3457、1.4262、0.9511和0.7193,表明该群体的遗传多样性比较丰富。
- 范玉顶张燕汪登强孟彦徐进曾令兵
- 关键词：微卫星
- 草鱼天然抗性相关巨噬蛋白基因全长cDNA的克隆与表达分析被引量：4
- 2011年
- 天然抗性相关巨噬蛋白(Nramp)家族是一类抑制胞内寄生菌侵染的天然免疫相关蛋白。本研究克隆了草鱼(Ctenopharyngodon idellus)Nramp基因并进行了表达分析。该基因cDNA序列全长为3 158 bp,编码1个含544个氨基酸的蛋白。该蛋白含有Nramp家族的特征序列:包含12个跨膜区(TM)、1个由20个氨基酸残基组成的胞质内转运结构域(CTM)。草鱼Nramp同其他16个物种的Nramp氨基酸序列同源性在62.5%～90.2%之间。草鱼Nramp基因cDNA的独特结构是其3′末端非翻译区(UTR)和5′UTR各有1个脊椎动物Nramp2中的铁反应控制蛋白结合位点(IRE)。系统进化分析表明,草鱼Nramp和所有鱼类Nramp聚为一簇,与哺乳类Nramp2的亲缘关系较近。Nramp基因在草鱼头肾和脾脏中的表达量最高,在肌肉和皮肤中的表达量最低,在草鱼呼肠孤病毒(GCRV)感染的草鱼肾脏细胞系(CIK)中的表达量明显升高。
- 范玉顶徐进罗晓松周勇肖艺曾令兵
- 关键词：草鱼CDNARACE
