国家自然科学基金(61370131)
- 作品数：5 被引量：1H指数：1
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- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 利用局部关联算法研究抗生素对人类肠道微生物菌群的影响
- 2014年
- 人类肠道微生物与人体健康有着千丝万缕的联系,肠道微生物群的改变是人体健康及功能的标志物。利用局部关联(eLSA)算法研究抗生素对人体肠道微生物菌群之间关联的影响,结果表明:抗生素对肠道微生物的影响,不仅出现在全局的时间序列关联中,同时还出现在局部和带时间延迟的关联序列中;肠道微生物经历重复的抗生素扰动时,部分扰动反应关联消失或出现新的关联,说明抗生素的扰动可以改变肠道微生物菌群间原有的状态,这种改变甚至有可能是长期的;个体拥有的肠道微生物并不完全相同,不同的个体对应同样的抗生素扰动会有不同的个性化反应。
- 艾冬梅卢杨曾广平涂序彦
- 关键词：肠道微生物时间序列
- 基于混合泊松分布的新生突变识别算法被引量：1
- 2017年
- 对个体而言,不经父母遗传而后天获得的突变称为新生突变,绝大多数癌症都起自新生突变。构建快速精确的变异识别算法将有助于对癌症的研究。然而,针对前期新生突变识别算法准确率不高,且耗时多等问题,本文引入了基于变异位点的先验概率分布模型,运用基于混合泊松分布的期望最大化(EM)算法对新生突变识别算法进行改进与优化,研究了有亲缘关系的新生突变的识别,并在识别精度与运算速度方面与已有算法进行对比。结果表明,基于混合泊松分布的期望最大化算法在提高运算速度的同时降低了假阳性比率,具有良好的识别效果。
- 高迎心温佳威徐尔艾冬梅
- 关键词：人类基因组遗传疾病
- “软件人”理论及其应用技术的研究现状
- 2016年
- 随着系统科学.信息技术的不断发展,我们已经处于无所不在的网络环境和计算设备中,传统的分布式系统也随之迎来了对自主.协调.开放等新特性的亟需和挑战.北京科技大学涂序彦教授和曾广平教授在广义人工生命.拟人系统的基础上.于2002年提出了"软件人"(Soft-Man)的新概念和研究方向."软件人"(Soft-Man)是一种运行予计算机网络环境下虚拟机器人,正是在这种应用需求的背景下产生的,拟人化是当前分布式人工智能领域的一个研究热点.文章对当前"软件人"理论及其应用技术的研究现状进行了梳理,着重阐述了任务协调.知识通信.迁移机制,以及"软件人"服务组装等构造原理与关键技术,并探讨了面向移动式应用的分布式系统的未来研究方向.
- 曾广平张青川
- 关键词：智能通信
- 基于聚类算法的结构变异及其形成机制识别
- 2017年
- 在人类基因组上存在着涉及到不同序列长度的结构变异,这些结构变异对癌症的发生和发展产生了显著的影响。随着新一代测序技术的发展以及测序成本的降低使得在全基因组水平研究结构变异变得可能,基于聚类算法对千人基因组三个不同地区的样本以及CGHub数据库中结直肠癌样本进行了结构变异识别,并基于间断点处的序列同源性对结构变异的形成机制进行了分析;利用方差分析及非参数检验分析了结构变异和癌症的关系以及结构变异与地域之间的关系。最后,探讨了该领域未来的发展趋势。
- 王丽莉艾冬梅
- 关键词：全基因组测序聚类算法
