内蒙古自治区自然科学基金(200508010102) 作品数:13 被引量:23 H指数:4 相关作者: 蔡禄 赵秀娟 王晶妍 赵宏宇 崔向军 更多>> 相关机构: 内蒙古科技大学 更多>> 发文基金: 内蒙古自治区自然科学基金 国家自然科学基金 教育部留学回国人员科研启动基金 更多>> 相关领域: 生物学 医药卫生 农业科学 更多>>
应用正交实验法优化DNA重复序列的PCR扩增体系 被引量:9 2008年 采用L9(34)正交实验法,对与人神经系统疾病相关的DNA重复序列PCR扩增体系中的模板DNA浓度、Taq酶浓度、引物浓度、dNTP浓度4种影响因素进行了优化筛选,发现引物浓度对扩增结果影响的显著性最大.在此基础上进行了引物浓度单因素实验,得到最优DNA重复序列PCR扩增体系在25μL反应体系中各组分的最适浓度分别为:模板3 ng/μL、Taq酶0.75 U、dNTP0.25 mmol/L、引物0.3μmol/L.通过优化前后反应体系的对比,扩增目的产物的量均有较大程度的提高.该优化体系的建立为进一步研究与人遗传病相关的DNA重复序列的结构特性及阐明该类遗传疾病的分子机理奠定了基础. 赵宏宇 蔡禄 赵秀娟 王晶妍关键词:PCR 正交实验 蛋白质-DNA复合物晶体结构数据的高斯分布检验 2007年 在最新NDB数据库中蛋白质-DNA复合物晶体结构数据的基础上,应用x2检验的方法对DNA动力学结构关键参数的数据分布进行检验,结果表明,各参数分布均是非高斯分布.数据分布曲线的偏斜度和峭度表明x2检验的结果是正确的. 崔向军 蔡禄关键词:结构参数 高斯分布 X^2检验 基于蛋白质-DNA复合物晶体结构的DNA结构动力学特性研究 被引量:6 2006年 依据最新NDB数据库中蛋白质-DNA复合物晶体结构数据,考虑DNA结构的序列依赖特性,对10个二联体和36个约化的四联体计算了DNA动力学结构模型中的关键参数——力常数矩阵,矩阵中的非对角项反映了结构参数间的关联。利用改进的DNA结构动力学模型,可以方便地计算给定序列的结构动力学特性。 毛爱华 陈斯云 蔡禄关键词:晶体结构 力常数 DNA 与人遗传病相关(GCCT)_n·(CAGG)_n重复序列的分子克隆 被引量:5 2006年 克隆与人遗传病相关的(GCCT)n.(CAGG)n重复序列.通过化学合成重复序列及两侧接头序列,两侧接头有EcoRⅠ,BamHⅠ和PleⅠ酶切位点,EcoRⅠ,BamHⅠ位点用于将重复序列插入pUC18制成的载体,PleⅠ酶切位点可方便地将重复序列从重组质粒中取出.为进一步研究和人遗传病相关的重复序列的结构特性及该类遗传疾病的分子机理奠定基础. 蔡禄 王晶妍 赵秀娟关键词:分子克隆 丝裂霉素C对含重复序列质粒的大肠杆菌致死率的模型化 2011年 目的探索丝裂霉素C对含重复序列质粒的大肠杆菌致死作用的规律。方法采用均匀设计试验方法设计丝裂霉素C的处理时间和药物浓度,统计存活菌数,计算菌体致死率。结果得到了丝裂霉素C的浓度和作用时间与菌体致死率间的线性回归方程,建立丝裂霉素C作用的响应面。结论丝裂霉素C的浓度和作用时间与菌体致死率呈线性正相关。 赵宏宇 蔡禄 赵秀娟 王晶妍关键词:丝裂霉素C 均匀设计 大肠杆菌 致死率 与人遗传病相关的三核苷酸(GAA)_n·(CTT)_n重复序列的分子克隆 2008年 为了获得长片段(GAA)_n·(CTT)_n重复序列进而对其结构特性和致病机理研究,通过化学合成重复序列及两侧接头,两侧接头有Eco R I,Bam H I和Ple I酶切位点,Eco R I,Bam H I位点用于将重复序列插入pUC19制成的载体,Ple I酶切位点可方便地将重复序列从重组质粒中取出.为核苷酸重复序列的动力学结构和探讨与遗传病相关的重复序列结构特性及该类遗传疾病的分子机理奠定了基础. 姜志艳 蔡禄 赵秀娟关键词:GAA 分子克隆 三种快速制备含重复序列质粒PCR模板的方法 被引量:2 2010年 为了探索含重复序列质粒PCR模板的快速简易制备方法,分别利用高速离心法、TE煮沸法和TE/SDS煮沸法处理过夜培养的含重组质粒大肠杆菌菌体,制备模板后进行PCR扩增发现,均能得到比较清晰的目的条带,可以用于含重复序列质粒的初步鉴定。相比较而言,高速离心5 min、TE煮沸3 min、TE/SDS煮沸2.5 min制备的样品PCR扩增后效果较好。这3种方法快速、简便、费用低、无污染,简化了PCR模板制备的过程,为重组质粒大量筛选鉴定的研究奠定了基础。 赵宏宇 蔡禄 赵秀娟 王晶妍 李晶关键词:高速离心法 PCR模板 化学药物对与人遗传病相关的DNA重复序列不稳定性的影响 被引量:2 2010年 DNA重复序列异常扩增或删除会引起多种人类遗传疾病,目前其不稳定性机制还不清楚。为了探索化学药物对重复序列的作用,采用甲基磺酸乙酯和丝裂霉素C连续多次处理含重复序列质粒的菌体,通过检测重复序列长度的变化,发现两种化学药物在不同程度上可以促使含(GAA)42和(ATTCT)43质粒发生删除,而含(GCCT)18质粒的长度没有发生变化。 赵宏宇 蔡禄 赵秀娟 王晶妍 陈元秀 刘水峰关键词:遗传病 丝裂霉素C 甲基磺酸乙酯 化学药物导致的与Friedreich共济失调相关的GAA重复序列不稳定性的研究 被引量:2 2010年 Friedreich共济失调是由位于FRDA基因上的GAA重复序列动态突变扩增所引起的,目前其不稳定性机制还不清楚。为了探索化学药物对GAA重复序列的作用,本实验构建了含有(GAA)42的重组质粒,转入大肠杆菌中,分别经过丝裂霉素C和甲基磺酸乙酯连续多次处理后,检测其长度变化发现,两种化学药物在不同程度上都可以促使(GAA)42发生删除,且删除后长度多数处于体内的正常范围。试验结果表明,化学药物可以促进与Friedreich共济失调相关的GAA重复序列发生删除。本工作为研究Friedreich共济失调的致病机理及治疗方案奠定了一定的基础。 赵宏宇 蔡禄 赵秀娟 王晶妍 陈元秀 刘水峰关键词:GAA FRIEDREICH共济失调 丝裂霉素C 甲基磺酸乙酯 基于裸DNA晶体结构的DNA结构力常数的计算 2006年 依据最新NDB数据库中裸DNA晶体结构数据,考虑DNA结构的序列依赖特性,对10个二联体计算了DNA动力学结构模型中的关键参数:力常数矩阵,矩阵中的非对角项反映了结构参数间的关联. 毛爱华 崔向军关键词:DNA 晶体结构 力常数