江西省教育厅科学技术研究项目(GJJ12069) 作品数:4 被引量:5 H指数:1 相关作者: 周艳 刘金辉 邹淑慧 肖九长 余克花 更多>> 相关机构: 南昌大学 江西省儿童医院 赣州市人民医院 更多>> 发文基金: 江西省教育厅科学技术研究项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 更多>>
乙型肝炎病毒外膜蛋白的分子生物学研究进展 2013年 乙型肝炎病毒(Hepatitis B Virus,HBV)外膜蛋白含PreS1、PreS2和S 3种蛋白,位于病毒颗粒的外表面,参与病毒颗粒的吸附、组装与成熟,在保护性免疫应答反应中起重要作用,HBV感染肝细胞所合成的外膜蛋白对肝细胞的生长、代谢,甚至是恶性转化产生一系列重要的生物学调节效应,外膜蛋白的变异使得HBV对受染肝细胞的影响非常复杂且成多样化,在病毒性乙型肝炎慢性化及其相关疾病演变过程的分子病理机制扮演重要角色。 周艳 邹淑慧 刘金辉关键词:乙型肝炎病毒 外膜 S蛋白 PRES1蛋白 PRES2蛋白 儿童感染的乙型肝炎病毒X基因的分子特征分析 被引量:1 2013年 目的初步调查儿童感染的乙型肝炎病毒(HBV)X基因的分子特征。方法收集20例儿童慢性乙型肝炎(乙肝)患者的血清标本,抽提血清中的HBV DNA,采用PCR扩增HBV X基因并测序,利用Clustal X、Bioedit软件对PCR产物序列进行X基因的突变分析。结果 20例HBV X基因突变区主要集中在羧基端aa120—150,氨基酸序列突变点分别为I127T、K130M、V131I、P145R、A146G/C、C148R/H和N149G/D;核苷酸序列突变点分别为T1753C、A1762T、G1764A、T1800C、C1807G、C1810G、A1811T、A1814C、T1815C、C1817T、A1819G和C1820A。结论儿童感染的HBV X存在突变,集中在羧基端aa120—150,对儿童乙肝的演变会产生重要影响。 邹淑慧 周艳 余克花 刘金辉关键词:乙型肝炎病毒 X基因 儿童 江西地区儿童感染的乙型肝炎病毒全基因组序列分析 被引量:3 2014年 目的:初步调查江西地区乙肝疫苗免疫儿童感染的乙型肝炎病毒全基因组的分子特征。方法收集江西省儿童医院11445份乙肝疫苗免疫儿童血清标本,采用酶联免疫吸附试验检测 HBV-M,抽提乙肝表面抗原(HB-sAg)阳性血清中的 HBV DNA,分3个相互重叠片段 PCR 扩增 HBV 基因并测序,采用 ContigExpress 软件对所测序列拼接成全基因组序列,分析各读码框核苷酸和氨基酸变化。对 HBV 不同基因型以及所获得的 HBV 全基因组的 S 基因序列进行系统进化树的构建以确定基因型。结果11445份血清样品中,检测出117份 HBsAg 阳性标本,进行分段重叠扩增并测序,最终拼接出58份完整的 HBV 基因组,均为 B 基因型和 adw 血清型。对各开放读码框进行序列比对发现 PreS 区存在散在分布的突变:如 A2990C→ H48P、A2999C→ N51T、C3041T→ P65L、C3097A→L84I 和 A3136G→ T97A;S 区突变集中在120~200 aa,主要突变位点为 C533A→ P127T、A541C→Q129H、G588C→G145A、T753A→F200Y;前 C 区突变位点有 A1814C/T1815C→M1P、G1896A→ W28*,C 区出现1例 C1913A→P5T 变异;P 区出现散在分布的突变位点,未发现与耐药性有关的突变位点,其 RT 区 YMDD 核序也未发生变异;X 区氨基端主要突变点为:G1437T/A→ G22C/S、G1476A→ G35R 和 G1503A/T/C/T1504G→V44I/F/L/C,羧基端突变集中在120~150 aa,出现5例 A1762T/G1764A→K130M/V131I 突变。结论了解分析儿童 HBV 全基因组的分子特征和突变情况,为疫苗免疫儿童感染乙肝的预防和治疗提供病毒学分子信息。 邹淑慧 夏方娜 周艳 肖九长 刘金辉关键词:乙型肝炎病毒 全基因组 儿童 不同基因型HBV大S蛋白生物信息学初步比较分析 被引量:1 2012年 目的对不同基因型HBV的大S蛋白进行生物信息学比较研究,并分析其意义。方法从Gen—Bank中获取不同基因型(A~J)HBV的大S蛋白核苷酸与氨基酸序列,采用Clustal X,Bioedit软件进行核苷酸和氨基酸序列比对,计算核苷酸和氨基酸同源性,应用在线软件TMHMMv2.0以及AntheProt5.0软件分析大S蛋白跨膜区、信号肽与二级结构。结果不同基因型大S蛋白基因核苷酸同源性为83.0%~95.3%,氨基酸同源性为79.5%~95.5%;preS1功能结构域(氨基酸1~75)含有多个高变异位点(氨基酸3、氨基酸28、氨基酸40、氨基酸43和氨基酸73);S蛋白有4次跨膜,S蛋白膜外功能结构域(氨基酸99~172)较保守,含有多个保守的半胱氨酸残基位点;S蛋白中存在潜在信号肽结构,氨基酸27和氨基酸98为潜在信号肽断裂位点;不同基因型大S蛋白均富含潜在仪螺旋、B折叠和卷曲结构。结论不同基因型HBV大S蛋白中差异较大区域是preS1,而S区相对较保守,为抗HBV药物设计、基因工程疫苗改良和HBV的致病机制等的研究提供依据。 邹淑慧 周艳 熊英 刘金辉 莫冰关键词:乙型肝炎病毒 生物信息学