国家自然科学基金(31300004)
- 作品数：23 被引量：86H指数：6
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- 广州弗朗西斯菌的鉴定与命名以及获得国际认可的经验介绍
- 2014年
- 本文以广州弗朗西斯菌（ Francisella guangzhouensis）为实例，阐述如何利用生物信息资源进行细菌新种的鉴定、如何进行新种的命名和命名的拉丁化、如何进行新种的合格化、以及《国际细菌命名法》中与新种命名和鉴定相关的一些内容，从而为临床微生物学工作者发现和命名新的病原菌提供指导。
- 屈平华陈茶
- ITS基因测序对须癣毛癣菌的鉴定分析
- 2016年
- 目的探讨ITS基因测序对须癣毛癣菌进行分子生物学鉴定的可行性,以确定致病菌株的种属。方法从病人头皮及头发分离出一株真菌,采用直接涂片镜检和培养的方法,观察其镜下形态和菌落特征,同时取纯培养物进行普通PCR,PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳分析,Tanon-3500凝胶成像系统进行鉴定,收集目的片段进行ITS基因测序。结果本菌的镜下形态和培养特征与其他毛癣菌属极其相似,难以直接鉴定分离菌为须癣毛癣菌,将其纯培养后用真菌通用引物ITS4、ITS5进行PCR扩增,所得的扩增片段大小约700 bp,将目的片段送至公司进行双向测序,测序结果经Blast比对,须癣毛癣菌与之相符率达99.5%。结论 ITS基因测序可以准确鉴定从临床分离的须癣毛癣菌。
- 陈富张伟铮屈平华李松秦笙罗燕芬
- 关键词：须癣毛癣菌PCR技术
- 嗜肺军团菌核酸疫苗研究进展被引量：1
- 2014年
- 嗜肺军团菌通过气溶胶的形式感染人和动物,引起军团菌性肺炎,危害极其严重,但该病目前尚无有效的预防措施。军团菌病疫苗的研究经历了灭活疫苗、减毒活疫苗和蛋白亚单位疫苗不同阶段,但至今尚未能在临床得到应用。核酸疫苗作为一种新型疫苗,能有效诱导机体产生细胞免疫应答,符合兼胞内寄生菌嗜肺军团菌的预防需要,并且还具有诸多其他优点,引起了研究者们的兴趣。对嗜肺军团杆菌核酸疫苗的研究现状进行了简要介绍。
- 柴海云朱庆义
- 关键词：嗜肺军团菌核酸疫苗免疫原性免疫保护性
- 长滩军团菌荧光原位杂交探针的设计研究
- 2014年
- 目的设计一条特异性的长滩军团菌荧光原位杂交探针,并验证其特异性与敏感度,初步建立长滩军团菌的荧光原位杂交检测法。方法以长滩军团菌16S rRNA特异性位点设计杂交探针。在数据库中对探针序列进行特异性检验,优化反应条件,以军团菌标准菌株和环境分离菌株验证探针的特异性,并以模拟水样验证探针灵敏度。结果生物信息学分析表明,设计的探针LEG long序列与长滩军团菌16S rRNA序列完全配对,与其他军团菌种均存在1个碱基以上的错配。菌株验证实验证明LEG long探针可与长滩军团菌的标准菌株和环境分离株特异性杂交,与其他军团菌种和非军团菌属菌株无杂交信号。探针检测灵敏度可达1.49×103 CFU/ml。结论本研究设计的探针LEG long可用于长滩军团菌的高特异性和高灵敏度检测。
- 顾全胡朝晖赵利伟范晓姗严慧朱庆义
- 关键词：荧光原位杂交探针
- 基因芯片在军团菌分型检测中的应用被引量：2
- 2016年
- 基因芯片技术已广泛地应用于微生物研究中,它具有高通量、高时效性、重复性强等优点。本文主要阐述基因芯片技术的基本原理及其在军团菌检测、血清分型与分子分型等方面的应用概况。
- 范晓姗严慧朱庆义
- 关键词：军团菌基因芯片分子分型
- 血清NSE、SCC、CYFRA21-1和CEA联合检测对肺癌的诊断价值被引量：16
- 2016年
- 目的探讨血清肿瘤标志物神经原特异性烯醇化酶(NSE)、鳞状上皮细胞癌抗原(SCC)、细胞角蛋白19片段抗原(CYFRA21-1)和癌胚抗原(CEA)在肺癌诊断中的应用价值。方法回顾性分析139例肺癌、98例肺良性疾病患者及78例健康体检者血清NSE、SCC、CYFRA21-1和CEA水平及相关临床资料。结果 (1)肺癌患者血清四种肿瘤标志物的水平均高于肺良性疾病组及健康对照组(P<0.05),肺良性疾病组与健康对照组间差异无统计学意义(P>0.05)。(2)NSE水平在小细胞肺癌(SCLC)组中最高,与肺鳞癌组和肺腺癌组相比差异有统计学意义(P<0.05);SCC和CYFRA21-1水平在肺鳞癌组中最高,与肺腺癌组和SCLC组相比差异有统计学意义(P<0.05);CEA水平在肺腺癌组中最高,与肺鳞癌组和SCLC组相比差异有统计学意义(P<0.05)。(3)NSE、CYFRA21-1和CEA联合检测肺癌灵敏度87.8%,特异性54.7%,该组合的约登指数最大(0.43);NSE和CEA联合检测在诊断肺腺癌中效能最高,灵敏度和特异性均为71.7%;CYFRA21-1和CEA联合检测肺鳞癌效能最高,灵敏度96.7%,特异性56.6%;NSE单项检测小细胞肺癌效能最高,灵敏度76.5%,特异性71.7%。(4)NSE、SCC、CYFRA21-1和CEA在肺癌检测中ROC曲线下面积分别为0.812、0.403、0.710、0.667。结论 NSE、SCC、CYFRA21-1和CEA对肺癌的诊断均有一定的价值,但单项肿瘤标志物检测的灵敏度和特异性存在局限性,联合检测可提高肺癌的诊断阳性率。
- 李沫郑敏玲许振杰吴行贵屈平华
- 关键词：神经原特异性烯醇化酶鳞状上皮细胞癌抗原肺癌
- 临床微生物参考实验室现状与建设的思考被引量：4
- 2018年
- 目前临床微生物学检验面临已知病原不断变异和“新病原”不断出现的巨大挑战。针对当前临床微生物检验所存在的问题及国内外微生物参考实验室的建设现状，本文就临床微生物参考实验室的定位和职责，以及如何建设等进行了初步的探讨。
- 屈平华陈茶
- 关键词：临床微生物
- 嗜肺军团菌生物膜形成及其影响因素被引量：1
- 2015年
- 嗜肺军团菌在自然环境和人工供水系统中普遍存在,能够在阿米巴原虫和其他原生动物体内繁殖,所引起的军团菌病主要表现为严重的呼吸系统疾病。但在自然环境中,嗜肺军团菌的生存和繁殖受到多菌种生物膜形成和繁殖的影响,一些军团菌病的暴发与生物膜的存在相关。因此,阻止自然环境和人工水系统中生物膜的形成显然已成为降低水污染的有效策略之一。根据近年来的报道分别对影响嗜肺军团菌生物膜形成的生化因子和嗜肺军团菌的毒力因子,以及其他生物物种在嗜肺军团菌生物膜形成过程中所起的不同作用等进行综述。
- 严慧朱庆义
- 关键词：嗜肺军团菌生物膜
- 3株马赛分枝杆菌的分离鉴定及特征分析被引量：3
- 2013年
- 目的报告对临床分离的3株马赛分枝杆菌的种型鉴定和特征分析。方法对3株临床分离株进行生化鉴定、16S rRNA和rpoB基因测序鉴定,用微量肉汤稀释法进行药敏实验。结果生化鉴定无法确定种型,且光滑型/粗糙型菌落差异明显;16S rRNA鉴定结果显示,其与龟-脓肿分枝杆菌群高度同源(相似度>99.7%),联合rpoB基因测序分析可鉴定为马赛分枝杆菌;药敏试验结果显示,其对万古霉素、利奈唑胺、头孢西丁等耐药,其中粗糙型菌耐药性更强。结论马赛分枝杆菌是近年来出现的新型致病菌,其粗糙型感染应予以重视。
- 李松蔡杏珊陈茶屈平华张伟铮秦笙鄂顺梅
- 关键词：菌血症耐药性
- 应用16SrRNA基因序列分析与细菌生化反应鉴定膝关节脓液分离的念珠状链杆菌被引量：7
- 2014年
- 目的:对我院一名患者左膝关节脓液中分离到的1株少见病原菌进行16S rRNA基因测序鉴定,探讨该方法在临床病原菌鉴定方面的意义。方法:采用16S rRNA基因序列的测定、细菌形态学以及商品化的Vitek 2全自动细菌鉴定药敏系统、API 20NE、API 20E与API 50CH系统的生化实验进行细菌的表型鉴定。结果:该菌在血平板和巧克力平板生长缓慢,麦康凯平板不生长;血平板上菌落形态呈1~2 mm"油煎蛋"圆形凸起,边缘光滑、半透明、湿润;镜下革兰染色阴性,呈链状排列,菌体1~3μm,呈圆形、卵圆形或梭形等;Vitek 2 GN-13、API 20NE、API 20E均为不能鉴定的细菌;16S rRNA基因序列分析的结果显示该菌与念珠状链杆菌的相似度为100%。结论:该膝关节脓液分离出的病原菌为念珠状链杆菌,16S rRNA基因序列分析能提供有力的遗传学证据,结合细菌的生化反应可准确地鉴定该菌。
- 张伟铮邓光远屈平华陈文科林冬玲陈茶
- 关键词：生化反应RRNA
