东莞市科技计划项目(B200501)
- 作品数:5 被引量:27H指数:4
- 相关作者:刘宇虎柳娟钟东郭文英张振书更多>>
- 相关机构:东莞市人民医院南方医科大学南方医院更多>>
- 发文基金:东莞市科技计划项目国家自然科学基金广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- IFITM1克隆测序及生物信息学分析被引量:3
- 2009年
- 目的研究干扰素诱导的跨膜蛋白-1基因(interferon induced transmembrane protein 1.IFITM1)克隆、测序,对序列进行分析,并获取生物学信息。方法以IFITM1的cDNA为模板,用Pfu酶做PCR扩增,在EcoR Ⅰ和Hind Ⅲ双酶切后,将IF—ITM1的cDNA片段克隆到pUCm—T质粒,对重组的pUCm—T-IFITM1测序后,采用All GenBank+EMBL+DDBJ+PDBSe—quences Database和Simple Modular Architecture Research Tool(SMART)对IFITM1的eDNA进行生物信息学分析。结果扩增后,含有IFITM1基因eDNA的PCR产物约1000bp,IFITM1的eDNA成功克隆到pUCm—T质粒并进行测序。序列分析结果显示,IFITM1结构cDNA全长683bp,有2个外显子。IFITM1的mRNA编码的氨基酸在37~57和87~107有2个跨膜区,编码125个氨基酸的多肽,其蛋白相对分子质量为14kDa。结论,IFITM1基因的成功扩增、克隆、测序,获取了IFITM1基因的eDNA、mRNA以及编码蛋白质氨基酸的生物学信息,有利于研究IFITM1基因与大肠癌的关系。
- 刘宇虎钟东柳娟杨兴龙张振书肖冰郭文英
- 关键词:结直肠癌基因克隆生物信息
- IFITM1基因在结直肠癌中的作用研究进展被引量:4
- 2009年
- 刘宇虎
- 关键词:结直肠癌消化道恶性肿瘤PROTEIN大肠癌
- 胃肠道间质瘤CD117、CD34、SMA、S-100蛋白、Vim、结蛋白的表达及临床意义被引量:13
- 2008年
- 目的探讨胃肠道间质瘤(GISTs)的临床病理诊断,以及CD117、CD34、SMA、S-100蛋白、波形纤维蛋白(Vim)、结蛋白表达的临床意义。方法回顾分析了35例手术后经病理确诊的GISTs临床资料及辅助检查结果,免疫组化检测肿瘤组织CD117、CD34、SMA、S-100蛋白、Vim、结蛋白等抗原标志物的表达,分析对GISTs的诊断意义。结果35例GISTs发生于胃11例、小肠11例、腹腔5例。主要临床表现有腹胀、腹痛、消化道出血、腹部肿块。肿瘤组织中CD117、CD34的阳性表达率分别为94.3%和91.4%,显著高于SMA、S-100蛋白、Vim、结蛋白的表达(P<0.001),也显著高于在平滑肌瘤中的表达(P<0.0001);GISTs中结蛋白的阳性表达率2.9%,显著低于CD117和CD34(P<0.05);也显著低于在平滑肌瘤中的表达(P<0.001)。结论GISTs多发生于胃和小肠,胃肠镜、超声内镜和CT检查对间质瘤有较大诊断价值,而CD117阳性、CD34阳性及结蛋白结蛋白阴性对GISTs有确诊意义。
- 柳娟刘宇虎
- 关键词:胃肠道间质瘤CD117CD34平滑肌肌动蛋白S-100蛋白结蛋白
- 干扰素诱导的跨膜蛋白-1基因的扩增、克隆及蛋白表达被引量:5
- 2005年
- 目的研究干扰素诱导的跨膜蛋白-1(interferon-inducibletransmembraneprotein-1,IFITMP-1)基因的扩增、克隆及蛋白表达。方法以含IFITMP-1基因的cDNA为模板,用Pfu酶做PCR扩增,用EcoRⅠ和HindⅢ双酶切,将目的基因克隆到pUCm-T质粒测序。进一步克隆到pET-Trx蛋白表达载体质粒,优化蛋白表达条件。结果含有IFITMP-1基因的PCR产物约1000bp。重组pUCm-T质粒经EcoRⅠ、HindⅢ双酶切,有相应大小的cDNA片段插入,测序结果显示其序列正确,证实目的基因的扩增、克隆成功,并成功克隆进pET-Trx蛋白表达载体,经IPTG诱导,在BL21(DE3)plysS中有融合蛋白表达。结论成功扩增克隆IFITMP-1基因,并成功表达该基因编码的蛋白,为进一步研究IFITMP-1基因在大肠癌中的作用奠定了基础。
- 刘宇虎钟东柳娟张振书陈村龙武金宝肖冰郭文英
- 关键词:干扰素大肠肿瘤PCR克隆蛋白表达
- 干扰素诱导的跨膜蛋白-1对诊断结直肠癌的临床价值被引量:7
- 2008年
- 目的探讨干扰素诱导的跨膜蛋白-1(IFITM1)基因在肿瘤组织中的表达,血清抗IFITM1的抗体反应以及对临床诊断结直肠癌的意义。方法应用半定量RT-PCR方法检测IFITM1基因mRNA在正常大肠粘膜、结直肠癌组织、大肠炎性息肉、腺瘤性息肉、胃癌、食管癌和肝癌组织中的表达。采用Western印迹法检测患者血清抗IFITM1的抗体反应。分析有IFITM1基因表达癌肿的病理特点。结果结直肠癌组织中IFITM1基因mRNA表达率为47.4%(18/38),显著高于大肠腺瘤性息肉的15%(3/20)和胃癌组织的4.8%(1/21)(P<0.05),而正常大肠粘膜、大肠炎性息肉、食管癌和肝癌组织均无表达。结直肠癌组织IFITM1基因mRNA呈强表达,其表达水平(0.8048±0.2273)显著高于大肠腺瘤性息肉(0.4447±0.0989)(P<0.001)。结直肠癌血清相应的抗体反应率为36.8%(14/38),明显高于胃癌的9.5%(2/21)(P<0.05),而在食管癌、肝癌、大肠炎性息肉和大肠腺瘤性息肉以及健康人血清则未检测出相应的抗体反应。有IFITM1基因表达的结直肠癌多数直径大于5cm,侵及浆膜,有淋巴结和远处转移,多属DukesC期和D期,以高分化腺癌为主。结论IFITM1基因可能在结直肠癌的发生、发展和转移过程中起重要作用,有望成为临床诊断结直肠癌的一个良好标志物。
- 刘宇虎柳娟郭健游志坚王在国钟东杨兴龙张振书肖冰郭文英
- 关键词:结直肠癌基因表达抗体反应