云南省自然科学基金(2004C0002Q)
- 作品数：12 被引量：131H指数：7
- 相关作者：徐丽华李文均职晓阳唐蜀昆姜成林更多>>
- 相关机构：云南大学西南林学院中国科学院更多>>
- 发文基金：云南省自然科学基金国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 拟诺卡氏菌16S rRNA,gyrB,sod和rpoB基因的系统发育分析被引量：15
- 2007年
- 为了更好地了解拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)各物种间的系统发育关系,该属现有有效描述种的gyrB,sod和rpoB基因的部分序列被测定,结合16S rRNA基因,对拟诺卡氏菌属进行了系统发育重建。研究发现拟诺卡氏菌属gyrB,sod和rpoB基因的平均相似性分别为87.7%、87.3%和94.1%,而16S rRNA基因的平均相似性则达到96.65%,3个看家基因均比16S rRNA具有更高的分歧度。比较基于不同基因的系统树发现,由gyrB基因得到的系统树拓扑结构与16S rRNA得到的结构在亚群上基本一致。因此,gyrB基因在拟诺卡氏菌属的系统分类上比16S rRNA基因更具优越性。
- 杨玲玲职晓阳李文均
- 关键词：系统发育分析RRNA基因
- 建立放线菌门的证据被引量：13
- 2006年
- 放线菌是细菌域中的一个重要类群,其分类地位一直受到人们的关注。《伯杰氏细菌系统学手册》第二版,把放线菌从厚壁菌门中的一个纲提升为放线菌门。目前的研究发现,在细胞色素C氧化酶1亚基(Cox1)、CTP合成酶以及谷氨酰tRNA合成酶(GluRS) 3个蛋白中存在着放线菌特异的插入或缺失序列,可以将放线菌与其它细菌区分开,为放线菌门的建立提供了新的有力证据。简述了国内外的研究信息,并提出了自己的一些观点,供国内学者参考。
- 职晓阳蔡曼杨玲玲李文均徐丽华刘志恒姜成林
- 关键词：RRNA
- 嗜盐放线菌分离方法被引量：34
- 2007年
- 盐环境放线菌是一类独特的微生物资源。介绍了盐环境放线菌的种类,生理特性,影响嗜盐放线菌分离效果的基本因素,分离方法存在的问题,以及嗜盐放线菌分离的最新研究进展。推荐了3种适于分离嗜盐放线菌的培养基及分离方法。认为15%或以上NaCl浓度、一定比例的复合盐和培养基成分是高选择性分离嗜盐放线菌的关键。
- 唐蜀昆姜怡职晓阳娄恺李文均徐丽华
- 关键词：嗜盐放线菌
- 新疆艾丁湖嗜盐放线菌纤维素酶特性初探被引量：3
- 2007年
- 从本实验室已分离到的新疆艾丁湖嗜盐放线菌中,筛选出29株具有纤维素酶活性的菌株,其分别属于拟诺卡氏菌属、链单孢菌属、糖单孢菌属、多孢放线菌属及糖多孢菌属.并测定各菌株滤纸酶、单一内切葡聚糖酶及外切葡聚糖酶活力.经综合分析,就所分离到的嗜盐放线菌而言,多孢放线菌属的菌株YIM 90570具有较高的滤纸酶活力,链单孢菌属的菌株YIM 90577和YIM 90598分别具有较高的内切葡聚糖酶和外切葡聚糖酶活力.
- 蔡曼胡松楠职晓阳唐蜀昆李文均
- 关键词：嗜盐放线菌内切葡聚糖酶
- 艾丁湖盐碱环境分离菌株特异性多重PCR快速鉴定
- 2007年
- 参照糖单孢菌属(Saccharomonospora)和拟诺卡氏菌属(Nocardiopsis)的特异性引物,建立多重PCR反应体系快速鉴定分离自新疆艾丁湖盐碱环境分离的118株嗜盐菌株,检测出14株糖单孢菌属菌株,17株拟诺卡氏菌属菌株.研究发现2株普氏菌属菌株出现针对糖单孢菌属的特异性条带,退火温度提高至61℃时可消除这种假阳性扩增.应用多重PCR快速鉴定方法可提高对盐碱环境中的这2个类群初步鉴定以及筛选工作的速度和效率.
- 吴晋元职晓阳唐蜀昆李文均
- 关键词：多重PCR
- 两株具有抗癌活性内生细菌的分离及分类被引量：14
- 2007年
- 从西双版纳植物样品爵床[Rostellularia procumbens(L.) Nees]中分离到2株具有较强抗癌活性的内生细菌YIM 56077和YIM 56081。通过对其进行表型特征、生长及生理生化特性、细胞化学组份以及系统进化分析,发现这2株菌与B.flexus IFO15715T的亲缘关系最近,但它们在生长、生理生化等特征上表现明显差异,是芽胞杆菌属的2个具有开发潜力的新菌株。
- 李洁陈华红赵国振熊智徐丽华
- 关键词：内生菌抗癌活性系统发育
- 大香格里拉土壤放线菌组成分析及生物活性测定被引量：10
- 2009年
- 【目的】探究大香格里拉地区的土壤放线菌组成及其抑菌和酶活性,为放线菌新药物先导化合物和高活性酶的筛选提供资源。【方法】从大香格里拉地区不同海拔高度采集220份土样,用4种培养基,分别进行了常温放线菌和低温放线菌的分离。从常温放线菌中选择25株代表菌株进行了初步分类鉴定。采用琼脂扩散法,检测了其对4株细菌和7株农作物致病真菌的抑菌活性;利用特异性引物扩增法,筛选了其聚酮合酶(PKSⅠ、PKSⅡ)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因和多烯类化合物合成酶(CYP)基因。同时,检测了低温菌的多种酶活性。【结果】25株常温代表菌的系统发育分析显示它们分属于放线菌目的6个亚目、12个科、15个属。其中14株菌的NRPS及11株的CYP基因筛选呈阳性。低温条件下分离到的111株放线菌,88%属于耐冷菌,12%是嗜冷菌,它们中的大部分能利用明胶、纤维素,甲壳素等。【结论】研究结果显示,大香格里拉森林土壤蕴涵着种类和活性丰富的放线菌,为放线菌资源的开发利用和保护提供了新依据。
- 曹艳茹姜怡徐丽华
- 关键词：生物活性
- 聚酮类化合物生物合成途径基因阳性菌株生物多样性研究被引量：20
- 2005年
- 从中国云南省采集土样,采用GPY培养基、淀粉_酪素琼脂培养基和甘油天门冬酰胺琼脂培养基分离得到了876株细菌放线菌菌株。经聚酮类化合物基因筛选得到75株Ⅰ型和Ⅱ型聚酮类化合物生物合成基因双阳性的菌株,经抗菌活性、形态、生理等结果分析比较,选取其中的10株进行了16SrDNA序列分析。在物种多样性方面,分离到的菌分布至少有7个科,8个属。其中有链霉菌科的链霉菌属,分枝杆菌科的分枝杆菌属,链孢囊菌科的链孢囊菌属和野野村菌属,诺卡氏菌科的诺卡氏菌属,微球菌亚目的一新属、产碱杆菌科的无色杆菌属和β_亚纲中与紫色杆菌属紧邻的一革兰氏阴性菌新属。综合其表型、基因型特征,初步确定其中8株为新物种。研究表明利用新的思路和程序从自然环境分离、鉴定未知菌是微生物资源开发利用的关键。
- 徐平李文均高慧英徐丽华姜成林
- 关键词：基因筛选放线菌RDNA生物多样性
- 武陵山放线菌多样性被引量：21
- 2008年
- 【目的】为了探究武陵山放线菌多样性,以便从新放线菌菌株中发现新的潜在药物先导化合物。【方法】从武陵山采集280份土样,采用纯培养的方法,用4种培养基分离到1134株放线菌。选择其中30株代表菌进行了初步分类鉴定;以3株细菌和7株农作物致病真菌作为指示菌,检测其抑菌活性;利用特异性引物扩增的方法,检测是否具有聚酮合酶(PKSⅠ、PKSⅡ)基因、非核糖体多肽合成酶(NRPS)基因和多烯类化合物合成酶(CYP)基因。【结果】分离到的武陵山放线菌中,链霉菌占70%以上,还有小单孢菌等8个科13个属,其中有5个菌株是潜在的新种。选取的30株实验菌对细菌、真菌有不同程度的抗菌活性;其中含有4类化合物合成基因的菌株占23%～60%。【结论】武陵山原始森林土壤中,放线菌多样性很丰富,且存在很多未开发的稀有类群。有抑菌活性的菌株,可用于进一步的药物开发利用。
- 曹艳茹姜怡陈义光唐蜀昆秦盛赵国振徐丽华
- 关键词：放线菌多样性
- 1株碱杆菌属菌株的分离和鉴定被引量：1
- 2006年
- 从新疆采集的盐土样品中分离到1株革兰氏阳性、严格好氧、产孢、嗜盐细菌菌株YIM012，对其进行了系统分类学研究．菌株YIM 012为杆菌，生长最适温度为28～45℃，最适pH7．0～8．0，并能在70～250g/L的盐质量浓度中生长良好．其DNA的G＋c的摩尔分数为39％，16SrRNA基因序列分析结果显示，该菌株与碱杆菌属Alkalibacillus salilacus（DSM 16460^T）亲缘关系最近，相似性达到99．6％，但与同属其它2个有效种间相似性低于96％．杂交结果显示其与A．salilacus亲缘关系低于20％，并且在生理生化方面也有差异．综合分析，确定该菌株为碱杆菌属的1个新种，将其命名为嗜盐碱杆菌（Alkalibacillus halophilus）．
- 田新朋张玉琴唐蜀昆职晓阳陈冲李文均徐丽华姜成林
- 关键词：RRNA基因DNA-DNA杂交
