安徽省高校省级自然科学研究项目(2006KJ224B)
- 作品数：4 被引量：2H指数：1
- 相关作者：刘武艺张克军更多>>
- 相关机构：阜阳师范学院中国科学院更多>>
- 发文基金：安徽省高校省级自然科学研究项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学更多>>
- (R)-/(S)-2-(5-氟尿嘧啶-1-基-乙酰基)氨基-3-羟基丙酸甲酯和DNA相互作用的电化学研究
- 2011年
- 以自组装制得的DNA修饰电极为工作电极,采用循环伏安法以Fe(CN)63-/4-为电活性指示剂,研究了抗癌药物R型和S型的2-(5-氟尿嘧啶-1-基-乙酰基)氨基-3-羟基丙酸甲酯(简称为(R)-5FUSer和(S)-5FUSer)与DNA的相互作用。循环伏安测试结果表明:(1)体系的式电位随(R)-5FUSer和(S)-5FUSer浓度的增加呈现负移行为,可以推知(R)-5FUSer和(S)-5FUSer分子则优先通过静电结合模式与DNA发生作用;(2)5FUSer和DNA的作用与药物手性结构有关系,(S)-5FUSer和与DNA的结合平衡常数大约是(R)-5FUSer和DNA结合常数的10倍,本研究对于遗传工程中以DNA为靶标的药物设计有重要的意义。
- 张克军刘武艺
- 关键词：DNA循环伏安法
- 非洲爪蟾的碱性螺旋-环-螺旋转录因子的鉴定与初步分析
- 2011年
- 碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)转录因子在真核生物的生长发育相关的基因表达调控过程中发挥着重要的作用。本文根据现有非洲爪蟾基因组数据,利用生物信息学方法初步鉴定爪蟾的bHLH基因,收集了其结构、家族分类和GO功能富集等信息,进行了初步分析。结果,在非洲爪蟾基因组数据库中共发现98个bHLH转录因子,它们可以分别归到6大组(A-F)的32个亚家族中。通过基因本体论(GO)的富集分布统计发现有42个显著富集分布的GO注释语句,其中转录调控活性(GO:0030528)、转录调控(GO:0045449)、DNA结合(GO:0003677)、转录(GO:0006350)和DNA依赖的转录调控(GO:0006355)等出现的频率很高,表明这些GO术语是爪蟾bHLH基因的共同功能;此外,许多爪蟾bHLH基因在一些重要的发育或生理过程(如肌肉器官和眼的发育)中发挥着重要的调控作用。这些研究结果将有助于进一步的研究。
- 刘武艺
- 关键词：转录因子基因本体论基因组分析
- 基因本体论的蟾蜍bHLH转录因子功能富集分布被引量：1
- 2011年
- 基因本体论是国际上标准的基因和蛋白质功能知识词汇。利用基因本体论的功能富集分布比较和分析了两种蟾蜍bHLH基因分子功能分布特点。结果发现,两种蟾蜍的bHLH基因均有显著富集分布的GO注释语句,其中转录调控活性(GO:0030528)、转录调控(GO:0045449)、DNA结合(GO:0003677)、RNA代谢过程调控(GO:0051252)、DNA依赖的转录调控(GO:0006355)、转录(GO:0006350)和转录因子活性(GO:0003700)等频率很高,表明这些GO注释是蟾蜍bHLH基因常见的功能;此外,蟾蜍bHLH基因在肌肉器官发育、神经管和眼发育等一些重要的发育或生理过程的基因表达调控中发挥着重要的作用。
- 刘武艺
- 关键词：蟾蜍BHLH基因本体论功能注释
- 热带爪蟾bHLH转录因子鉴定与进化分析被引量：1
- 2012年
- 爪蟾是重要的生物医学模式动物。文章根据NCBI公布的热带爪蟾(Xenopus tropicalis)基因组数据,利用生物信息学方法提取和鉴定了爪蟾全基因组范围的碱性螺旋-环-螺旋(bHLH)基因信息,应用系统发生方法进行分类并做基因本体论(Gene Ontology,GO)功能富集分布分析,以期从整体上探讨爪蟾bHLH转录因子基因家族的分类及功能。结果表明,在热带爪蟾基因组数据库中发现了70个bHLH转录因子,其中69个可以分别归到6大组(A^F)的34个亚家族中,另一个为"孤儿因子"(Orphan)基因。GO富集分布统计发现有51个显著富集分布的GO注释语句,其中转录调控活性、转录调控、DNA结合、RNA代谢过程调控、DNA依赖的转录调控、转录和转录因子活性等出现频率很高,表明这些GO术语是爪蟾bHLH基因最常见的功能;许多bHLH转录因子在一些重要的发育或生理过程中发挥调控作用,如肌肉组织和器官(横纹肌、骨骼肌、眼部和咽部肌肉)的分化和发育、消化系统发育、咽部和感觉器官的发育、碱基和核苷及核酸的代谢调控、生物合成过程调控、DNA结合和蛋白质异聚化活性等。另外,还有一些重要信号通路(Signaling pathway)的GO术语显著地富集。文章还对Hes转录因子家族做了进化分析。这些结果为热带爪蟾bHLH基因的进一步研究打下了很好的基础。
- 刘武艺
- 关键词：爪蟾系统发生分析转录因子基因本体论
