湖南省重点学科建设项目(JSU071312Z01) 作品数:15 被引量:56 H指数:5 相关作者: 刘祝祥 陈义光 贺建武 李洪军 刘荷 更多>> 相关机构: 吉首大学 云南大学 更多>> 发文基金: 湖南省重点学科建设项目 国家自然科学基金 湖南省高校科技创新团队支持计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 环境科学与工程 轻工技术与工程 更多>>
发酵车间空气源细菌淀粉酶产生菌筛选及多样性分析 被引量:6 2015年 采用平板水解圈法(plate hydrolysis spot method)对分离自酒鬼酒发酵车间空气样品的细菌进行淀粉酶产生菌筛选,运用基于16S rRNA基因序列的分析方法对高酶活菌株进行系统发育多样性分析。结果表明,73个受试菌株中,有23株为淀粉酶产生菌,占受试菌株的31.5%,其中有9株为高酶活菌。23个淀粉酶产生菌类群多样性和物种多样性较高,属于4个大的系统发育类群(Actinobacteria、Deinococcus-Thermus、Firmicutes、Proteobacteria)中的10个科(Bacillaceae、Deinococcaceae、Intrasporangiaceae、Microbacteriaceae、Micrococcaceae、Nocardiaceae、Propionibacteriaceae、Pseudomonadaceae、Rhodobacteraceae、Xanthomonadaceae)的13个属,可分为21个物种。进一步分析表明,9株高酶活菌属于细菌域(Eubacteria)的4个大的系统发育类群(Actinobacteria、Deinococcus-Thermus、Firmicutes、Proteobacteria)的7个科(Bacillaceae、Deinococcaceae、Micrococcaceae、Microbacteriaceae、Nocardiaceae、Rhodobacteraceae、Xanthomonadaceae),归属于8个属。研究结果表明,酒鬼酒发酵车间空气源细菌存在较高比例的淀粉酶产生菌,且这些菌株具有较高的类群多样性和物种多样性。 刘荷 樊林 程金莲 肖建青 钟小娟 余冰 李洪军 刘祝祥 陈义光关键词:系统发育分析 高望界土壤放线菌抗菌活性筛选及生物学特征 2016年 为了从土壤环境中筛选产生抗菌活性物质的放线菌,采用琼脂扩散法对分离自湖南省高望界自然保护区森林土壤的169株放线菌进行抗菌活性检测,采用16S RNA基因序列分析法进行系统发育分析,采用常规方法进行生物学特性研究。结果表明,有47株受试菌株的发酵产物显示抗菌活性阳性(27.8%),其中6株具有较强抗菌活性。形态观察结果表明,这6株菌株均为典型的产丝产孢放线菌,在多数培养基上生长良好,气生菌丝和孢子丝丰富。系统发育分析表明,6株菌株均属于链霉菌属(Streptomyces),归为5个物种。菌株JSM 147612、JSM 147786、JSM 147831和JSM 147846分别与链霉菌属的已知物种S.violascens(序列相似性为99.93%)、S.malachitospinus(99.65%)、S.anulatus(99.72%)和S.aureus(99.38%)系统发育关系最为密切;菌株JSM 147823和JSM 147842之间的序列相似性为99.86%,应该属于同一物种,与它们系统发育关系最为密切的是S.albidoflavus(相似性分别为99.72%和99.58%)。 程金莲 刘祝祥 易旻 刘荷 李佑稷 张丽 贺建武 陈义光关键词:放线菌 抗菌活性 系统发育 栉江珧相关细菌抗菌活性筛选及系统发育分析 被引量:2 2013年 采用8种敏感指示菌(革兰阳性和阴性菌各3株,真菌2株),利用琼脂扩散法,对分离自南海硇洲岛潮汐带栉江珧(Atrina pectinata)样品的细菌进行抗菌活性筛选,并对具有较强生物活性的菌株进行系统发育分析和生物学特征观察。结果显示,125个分离菌株中,有18株的发酵液具有抗菌活性,占受试菌种总数的14.4%,其中6株(JSM 112006、JSM 114095、JSM 114060、JSM 112019、JSM 114054、JSM 114093)具有较强的抗菌活性。基于16S rRNA基因序列的系统发育分析表明,这些活性菌株类群多样性较高,分属于4个属:菌株JSM 112006属于Marinobacter属;JSM 114095属于Halomonas属;JSM 114060和JSM 112019属于Salinivibrio属;JSM 114054和JSM 114093属于Staphylococcus属。研究结果表明,南海硇洲岛潮汐带栉江珧分离菌株中存在一定比例的抗菌活性菌株,且这些细菌具有较为丰富的类群多样性。 朱泓溢 肖建青 刘祝祥 刘荷 李洪军 贺建武 钟小娟 陈义光关键词:栉江珧 抗菌活性 系统发育分析 Cd、Pb胁迫下湿地匍灯藓(Plagiomnium acutum)叶绿素荧光特性研究 被引量:8 2014年 采用浸没培养实验研究了不同浓度Cd(0、1、5、10 mg·L-1)、Pb(0、10、25、50 mg·L-1)单一以及二者低、中、高浓度组合复合处理对湿地匍灯藓(Plagiomnium acutum)叶绿素荧光以及细胞膜透性的影响。结果表明:(1)湿地匍灯藓Fv/Fm、Fv/Fo、Fv′/Fm′、ETR、Y(II)的下降程度与Cd、Pb胁迫浓度及胁迫时间存在明显的剂量、时间-效应关系;随胁迫时间延长,Y(NO)总体呈现持续上升的趋势,qN表现为先升后降,而qP则呈现出先降后升趋势。(2)湿地匍灯藓的叶绿素荧光参数对Pb、Cd胁迫的响应存在差异,单一Pb胁迫初期各荧光参数即出现不同程度的下降,单一Cd胁迫下上述参数均在处理第4 d才出现明显下降;在胁迫第1 d,中、低浓度Cd、Pb单一及复合胁迫均引起湿地匍灯藓的Fv/Fm、Fv/Fo、Fv′/Fm′增加。(3)Cd、Pb胁迫均使处理液电导率升高,升幅大小顺序为Cd/Pb复合胁迫>Cd胁迫>Pb胁迫。表明湿地匍灯藓在Cd、Pb胁迫初期可通过应激性增加PSII活性中心数来抵御重金属的毒害,但由于电子传递和热耗散能力较弱,使PSII活性中心受损,最终导致光合系统损伤;Cd、Pb复合胁迫对湿地匍灯藓细胞膜的损伤和毒害作用显著强于单一胁迫,Cd对细胞膜的毒害作用又强于Pb;Fv/Fo可作为Cd、Pb胁迫的敏感指标。 李朝阳 吴昊 田向荣 李菁 李菁 杜晓濛关键词:CD PB 叶绿素荧光特性 槲蕨多糖的提取工艺优化及其抑菌性研究 2018年 以槲蕨块茎为材料,采用水提醇沉法提取槲蕨多糖。在单因素考察的基础上,以多糖的得率为响应值,料液比、提取温度、提取时间为自变量,建立数学模型,利用响应面法获得槲蕨多糖的最佳提取工艺。采用纸片扩散法比较了不同浓度多糖的抑菌效果。结果表明:槲蕨多糖最佳提取工艺条件为:料液比1∶25,提取时间2.0 h,提取温度为85℃,在此优化条件下多糖得率为7.57%,与响应面分析预测值7.61%基本相符。槲蕨多糖对杆菌有明显的抑制作用,对供试球菌无明显抑制效果,多糖最低抑菌浓度为10 mg/m L。 孙见行 张丽 江润芳 曹露君 李朝阳关键词:槲蕨 多糖 响应面法 抑菌作用 酒鬼酒制曲车间产淀粉酶细菌筛选和系统发育 被引量:5 2014年 采用平板水解圈法对酒鬼酒制曲车间空气的细菌进行产淀粉酶活性筛选,运用基于16SrRNA基因序列的分析法对高酶活菌株进行系统发育分析.研究结果表明,65株受试菌株中,有24.6%的菌株(16株)淀粉水解酶活性呈阳性,其中有4株(JSM 2145008,JSM 2155001,JSM 2155017,JSM 2175012)产淀粉水解酶能力较强.基于16SrRNA基因序列的系统发育分析表明,这4个菌株分别属于细菌域3个大的系统发育类群中3个科的3个属.菌株JSM 2145008属于放线菌门微球菌科,与节杆菌属(Arthrobacter)的氧化节杆菌的系统发育关系最为密切,它们之间的16SrRNA基因序列相似性高达99.8%,且在系统进化树上形成一个稳定的亚分支;菌株JSM 2155001和JSM 2175012属于异常球菌——栖热菌群异常球菌科的异常球菌属(Deinococcus),分别与该属的大琼异常球菌和云威异常球菌系统发育关系最为密切(序列相似性分别为99.6%和99.9%);菌株JSM 2155017属于厚壁菌门芽孢杆菌科,与芽孢杆菌属(Bacillus)的同温层芽孢杆菌系统发育关系最为密切(序列相似性为100%),它们以极高的自展值支持(boostrap value,100%)在系统进化树上聚在一起.上述实验结果表明,酒鬼酒制曲车间空气源细菌中存在较高比例的产淀粉酶菌株,且这些菌株具有较高的类群多样性. 李洪军 樊林 程金莲 刘祝祥 陈义光关键词:淀粉酶活性 系统发育分析 酒鬼酒发酵车间空气源细菌产酯酶活性菌株筛选及多样性分析 被引量:4 2015年 采用平板水解圈法(plate hydrolysis spot method)对分离自酒鬼酒发酵车间空气的细菌进行产酯酶活性菌株筛选,采用基于16S r RNA基因序列的分析方法对高酶活菌株进行系统发育多样性分析。结果表明,73个受试菌株中,有51株酯水解酶活性菌株呈阳性,占受试菌株的69.9%。其中有9株(JSM 2215018、JSM 2215021、JSM2215027、JSM 2215104、JSM 2215109、JSM 2215116、JSM 2215117、JSM 2215126、JSM 2215132)具有较强的酯酶活性。系统发育分析表明,这9株菌属于细菌域(Eubacteria)的4个大的系统发育类群(Actinobacteria,DeinococcusThermus,Firmicutes,Proteobacteria)的8个科(Bacillaceae,Deinococcaceae,Microbacteriaceae,Micrococcaceae,Moraxellaceae,Nocardiaceae,Rhodobacteraceae,Xanthomonadaceae)的8个属:JSM 2215018属于Microbacterium属;JSM 2215021属于Arthrobacter属;JSM 2215027属于Bacillus属;JSM 2215104属于Xanthomonas属;JSM 2215109属于Deinococcus属;JSM 2215116属于Acinetobacter属;JSM 2215117和JSM 2215132属于Paracoccus属;JSM2215126属于Rhodococcus属。研究结果表明,酒鬼酒发酵车间空气源细菌存在较高比例的产酯酶菌株,且这些菌株具有较高的类群多样性。 刘荷 黎有有 程金莲 樊林 钟小娟 余冰 李洪军 刘祝祥 陈义光关键词:微生物 系统发育分析 硇洲岛潮汐带牡蛎相关可培养细菌多样性 被引量:5 2013年 【目的】了解南海硇洲岛潮汐带香港巨牡蛎(Crassostrea hongkongensis)相关可培养细菌的多样性。【方法】应用纯培养法分离样品中的细菌(含放线菌),采用基于16S rRNA基因序列的系统发育分析方法研究这些分离菌株的生物多样性。【结果】用补充0–25%(W/V)NaCl的MA、MH和NA培养基从样品中分离到102株细菌,在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取74个代表性菌株进行基于16S rRNA基因序列的系统发育分析。结果表明,这些菌株归为38个物种,属于4个大的系统发育类群(Gamma-Proteobacteria,Alpha-Proteobacteria,Bacteroidetes,Firmicutes)的16个科、18个属。大多数菌株属于Gamma-Proteobacteria亚门(45株,60.8%),其余依次是Firmicutes门(12株,16.2%)、Bacteroidetes门(11株,14.9%)和Alpha-Proteobacteria亚门(6株,8.1%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的有效发表种典型菌株之间(16S rRNA基因序列相似性为94.3%–99.8%)存在一定的遗传差异,其中JSM 111069可能代表Carnobacteriaceae科的潜在新属;菌株JSM 111039和JSM 111085可能分别代表Bacillus属的两个新物种,菌株JSM 111020、JSM 111072和JSM 111090可能分别代表Pseudoalteromonas、Proteus和Idiomarina属的新物种。【结论】南海硇洲岛潮汐带牡蛎中存在较为丰富的原核生物多样性,并潜藏着一定数量的微生物新类群(物种)。 肖建青 朱泓溢 刘祝祥 刘荷 贺建武 李洪军 钟小娟 李文均 陈义光关键词:香港巨牡蛎 RRNA基因 系统发育分析 细菌多样性 南海硇洲岛潮汐带栉江珧可培养细菌的系统发育多样性 被引量:2 2014年 【目的】研究南海硇洲岛潮汐带栉江珧(Atrina pectinata)样品相关可培养细菌的多样性。【方法】采用纯培养法和基于16S r RNA基因序列的系统发育分析,法对样品中可培养细菌(含放线菌)的类群多样性、物种多样性和遗传多样性进行研究。【结果】用补充0–25%(质量体积比)Na Cl的MA、MH和NA培养基从栉江珧样品中分离到125株细菌。在形态观察和部分生理生化实验结果的基础上去冗余,选取90个代表性菌株进行基于16S r RNA基因序列的系统发育多样性分析。结果表明,这90个分离菌株分属于3个大的系统发育类群(Gamma-proteobacteria、Firmicutes、Actinobacteria)、6个科、10个属,可分为33个物种。优势类群为厚壁菌门(Firmicutes)(56株,62.2%)和γ-变形杆菌亚门(Gamma-proteobacteria)(31株,34.5%)。大多数菌株与其系统发育关系最密切的已知物种的典型菌株之间存在一定的遗传差异(16S r RNA基因序列相似性为95.7%–99.9%),其中有5株可能代表新的分类单元(Potential new taxa)。分析表明,菌株JSM 112024可能代表了盐单胞菌科(Halomonadaceae)的一个属一级新分类单元;菌株JSM 112019、JSM 114045、JSM 114058和JSM 114083可能分别代表盐弧菌属(Salinivibrio)、芽孢杆菌属(Bacillus)、盐单胞菌属(Halomonas)和枝芽孢菌属(Virgibacillus)的新物种。【结论】湛江硇洲岛潮汐带栉江珧中存在较为丰富的可培养细菌物种多样性和系统发育多样性,并潜藏着较多的新微生物类群(物种)。 刘荷 朱泓溢 肖建青 刘祝祥 程金莲 贺建武 李文均 陈义光关键词:栉江珧 可培养细菌 RNA基因 系统发育分析 一株耐高温纤维素降解菌的分离筛选及鉴定 被引量:13 2017年 为了分离筛选耐高温的纤维素高效降解菌,从鸡粪蘑菇渣高温堆肥中取样,采用滤纸富集培养基进行富集培养、刚果红纤维素培养基进行分离纯化培养、滤纸条培养基和刚果红纤维素培养基进行初筛培养、液体发酵测定纤维素酶活法进行复筛培养,利用形态特征观察、生理生化特征检测和基于16SrRNA基因序列的系统发育分析法进行初步鉴定,结果分离筛选到1株耐高温纤维素降解菌XD-3.该菌株在50℃生长良好、羧甲基纤维素酶(CMCase)活力达6.14±0.37U/mL.综合形态特征、生理生化特性、基于16S rRNA基因序列的系统发育分析,菌株XD-3初步鉴定为解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens). 易旻 杨玉婷 李梦霖 张丽 贺建武 刘祝祥 陈义光关键词:RRNA基因 系统发育分析 解淀粉芽孢杆菌