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质检公益性行业科研专项项目(200810517)

作品数：4 被引量：21H指数：3
相关作者：赵文军朱水芳田国忠林彩丽牟海青更多>>
相关机构：中国检验检疫科学研究院中国林业科学研究院中国农业大学更多>>
发文基金：质检公益性行业科研专项项目国家自然科学基金重庆市自然科学基金更多>>
相关领域：农业科学更多>>

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇农业科学

主题

  • 2篇植原体
  • 2篇泡桐
  • 2篇泡桐丛枝病
  • 2篇丛枝病
  • 1篇质粒
  • 1篇全长
  • 1篇染色
  • 1篇染色体
  • 1篇系统进化
  • 1篇系统进化分析
  • 1篇脉冲场
  • 1篇脉冲场电泳
  • 1篇进化
  • 1篇进化分析
  • 1篇抗血清
  • 1篇分子
  • 1篇分子鉴定
  • 1篇分子特征
  • 1篇杆菌
  • 1篇RDNA基因

机构

  • 4篇中国检验检疫...
  • 3篇中国林业科学...
  • 2篇中国农业大学
  • 1篇西南大学

作者

  • 4篇赵文军
  • 3篇林彩丽
  • 3篇田国忠
  • 3篇朱水芳
  • 2篇牟海青
  • 1篇李婷婷
  • 1篇李怀方
  • 1篇杨旭光
  • 1篇范在丰
  • 1篇周涛
  • 1篇李志红
  • 1篇胡佳续
  • 1篇杨毅
  • 1篇王曦茁
  • 1篇孙现超
  • 1篇郭民伟
  • 1篇宋传生
  • 1篇张宁
  • 1篇史梦蝶

传媒

  • 1篇微生物学报
  • 1篇河南农业科学
  • 1篇植物病理学报
  • 1篇植物检疫

年份

  • 1篇2013
  • 3篇2011
共 4 条 记 录，以下是 1-4
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排序方式：
苦楝丛枝植原体质粒的测定与分子特征被引量：4
2011年
【目的】测定苦楝丛枝植原体(CWB植原体)质粒并分析其分子特征。【方法】扩增苦楝丛枝植原体质粒片段并进行系统进化分析,预测质粒编码蛋白的跨膜区、亚细胞定位;以质粒pCWBFq repA为模板制备探针,利用Southern blot方法检测苦楝丛枝植原体及其他几种植原体的质粒。【结果】测定了苦楝丛枝植原体福清株系的一个质粒pCWBFq,该质粒全长4446 bp,A+T含量为73.5%,编码6个蛋白,其中pCWBFq P2-P5五个编码蛋白分别含有3、2、1和2个跨膜区,其信号肽(Singnal Peptide,SP)信号值分别为0.989、0.505、0.918和0.914。氨基酸序列相似性比较表明:pCWBFq RepA蛋白与其他植原体质粒RepA的同源性在9.6%-85.6%之间,而pCWBFq SSB蛋白与其他植原体质粒SSB的同源性在74.0%-89.4%之间。用pCWBFq repA探针检测到苦楝丛枝植原体中质粒的存在,同时也能够检测到16SrI组的泡桐丛枝植原体(PaWBNy),海南长春花绿变植原体(PeVHn),苦楝丛枝植原体福州株系(CWBFz)和桑树萎缩植原体濮阳株系(MDPy)中的质粒,但16SrV组的枣疯植原体北京株系(JWBBj)、樱桃致死黄化西昌株系(CLYXc)和重阳木丛枝南昌株系(BiWBNc)中未能检测到任何杂交信号。【结论】苦楝丛枝植原体质粒pCWBFq编码的6个蛋白中,除与质粒复制有关的RepA和SSB外,另外4个均为含有疏水结构的分泌蛋白或膜蛋白。植原体质粒的同源基因间存在程度不同的变异,其中repA基因在所有植原体质粒上均存在,但变异性相对较大,而ssb基因仅存在于16SrI组植原体质粒中,且变异相对较小。16SrI组的CWBFq、PaWBNy、PeVHn、CWBFz和MDPy中均存在数量和大小不同的质粒,而16SrV组的JWBBj、CLYXc和BiWBNc中或含有的质粒因与pCWBFq repA探针的同源性较低而不能被检测到。
宋传生林彩丽田国忠赵文军朱水芳牟海青胡佳续王曦茁郭民伟
关键词：质粒系统进化DNA杂交
泡桐丛枝植原体抗原膜蛋白抗血清的制备及应用被引量：9
2011年
根据报道的泡桐丛枝植原体(Paulownia witches'-broom phytoplasma,PaWB)抗原膜蛋白(antigenic membrane pro-tein,AMP)基因的核苷酸序列设计引物,提取发病泡桐总DNA,经PCR扩增并成功克隆泡桐丛枝植原体amp基因。序列分析表明,amp基因由696个核苷酸组成,编码231个氨基酸残基,与GenBank中登录的2个泡桐丛枝植原体的膜蛋白核苷酸序列同源性为100%。将amp基因91-604 nt部分序列(命名为ampd)克隆到原核表达载体pGEX-4T-3,诱导后,经SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳分析,表明融合蛋白在大肠杆菌BL21(DE3)中得到了高效表达。以纯化的带GST标签的AMPD融合蛋白为抗原免疫德国大白兔,制备了PaWB-AMPD抗血清。利用该血清,通过Western印迹、点印迹、ELISA、间接免疫荧光和免疫捕获PCR试验均能在发病泡桐组织中特异检测到泡桐丛枝植原体。
牟海青周涛赵文军朱水芳林彩丽李怀方范在丰田国忠
关键词：泡桐丛枝病植原体大肠杆菌
泡桐丛枝植原体染色体全长及两个rRNA操纵子定位研究被引量：6
2011年
本实验以泡桐丛枝植原体为材料,运用差速离心和脉冲场电泳(Pulsed Field Gel Electrophoresis,PFGE),获得了无寄主DNA污染、完整的泡桐丛枝植原体染色体,并用Southern blot杂交进行了验证,建立了植原体全基因组的研究方法。同时对泡桐丛枝植原体染色体进行内切酶I-CeuI不完全酶切,测定了染色体全长,并定位了2个非连锁的rRNA操纵子在染色体上的位置,完成了泡桐丛枝植原体部分物理图谱的构建。实验结果表明,泡桐丛枝植原体染色体全长约为1 100kb,2个rRNA操纵子在染色体上相距500～600kb。
杨毅杨旭光林彩丽田国忠赵文军李志红朱水芳
关键词：染色体脉冲场电泳
许昌泡桐丛枝病植原体的分子鉴定被引量：3
2013年
对采自河南许昌的表现丛枝症状的泡桐样品进行了病原鉴定,并通过序列同源性分析确定了其分类地位。采用16SrDNA基因的通用引物R16mF2/R16mR1、R16F2n/R16R2和延伸因子(EF-Tu)tuf基因的通用引物fTufu/rTufu,对样品总DNA进行PCR扩增,分别得到了约1.2kb和840bp的特异条带。经克隆测序,并在NCBI网站比对分析,确定所得序列分别为植原体特定的16SrDNA和tuf基因序列。将测得序列与已报道的翠菊黄化组植原体序列进行同源性比对,并构建系统进化树,显示河南许昌的泡桐丛枝病植原体属于16SrⅠ-D亚组。
李婷婷史梦蝶张宁赵文军孙现超
关键词：泡桐丛枝病植原体RDNA基因系统进化分析
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