国家自然科学基金(30900329)
- 作品数：10 被引量：38H指数：4
- 相关作者：段会龙李昊旻张寅升吕旭东郑翔更多>>
- 相关机构：浙江大学浙江工商大学浙江大学医学院附属儿童医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划深圳市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 中文病历文本中时间信息自动标注
- 2012年
- 病历文本中标准化的时间信息及其关联临床事件的自动提取,对促进临床决策支持和医疗信息挖掘等应用具有重要意义。虽然很多研究已提出多种面向临床事件的提取方法,然而在时间信息自动标注领域的研究还未达到实际利用的水平。这主要是由于中文病历文本中时间信息表达的多样性、相互关联性和不明确性所致。为此本研究首先利用基于正则表达式的时间信息自动识别方法实现基本时间信息的提取,然后通过分析和研究中文病历文本中参考时间的种类和选取规律,将时间信息自动识别结果进行计算并自动标注为国际时间标注标准TIMEX2形式。本方法在包含1 207条时间信息的147份实际病历文本语料中进行了验证,结果显示时间识别的F值为92.82%,时间标注的F值为90.80%,为时间信息的后续利用奠定了良好的基础。
- 周小甲周庆利李昊旻吕旭东
- 关键词：正则表达式
- 基于电子病历的患者相似性分析综述被引量：8
- 2018年
- 预测患者未来的健康状态具有重要社会意义和科学价值。医疗大数据的积累为通过数据挖掘和分析来获得预测模型,或建立预测方法提供新的基础。患者相似性分析基于普适的患者间距离评估,从大量临床实践数据中获取疾病发展的普遍规律,从而为使用通用的计算机辅助临床决策支持框架、达到个性化诊疗提供了可能。目前该技术已在癌症、内分泌疾病、心脏疾病等大量领域得到初步的验证,并成为医学人工智能技术向临床转化最重要的一个方向。首先综述患者相似性分析的理论基础和研究进展,详细阐述患者相似性分析的一般性计算框架,讨论其中所涉及的大量关键技术,如数据预处理、降维、计算概念间距离和构建相似组等,以期为国内同行提供关于该领域研究的最新进展。同时指出目前患者相似性的研究还存在问题和挑战,为国内开展相关研究提供参考。
- 贾峥宗瑞杰段会龙李昊旻
- 关键词：电子病历数据挖掘
- 循证临床决策支持系统概述被引量：4
- 2018年
- 临床决策支持系统(CDSS)经过多年发展日趋完善,各类CDSS在临床实践中获得了广泛应用。在医学知识迅速更新的当下,各种基于最佳临床证据的医学知识未能被及时地传播到临床工作中并有效影响诊疗实践。在此背景下,人们开始关注CDSS在促进循证医学应用中的作用,由此产生了"循证临床决策支持系统"概念,并成为CDSS领域的重要研究主题之一。围绕这一主题,本研究首先对CDSS发展历史进行回顾,然后对循证临床决策支持系统产生背景和相关工作进行介绍,最后对循证临床决策支持系统未来的研究热点展开了讨论。
- 张寅升李昊旻段会龙
- 关键词：临床决策支持系统循证医学
- 利用条件随机场实现中文病历文本中时间关系的自动提取被引量：1
- 2010年
- 从临床病历文本中自动提取医学问题的相关时间属性可以服务于诸如临床决策支持、数字化临床路径等多种医疗信息应用,因此在医学语言处理领域,面向病历文本的时间信息自动提取研究在国际上已开展多年,而中文环境下的相关研究仍属空白。本研究提出了一种基于条件随机场(CRF)的时间关系自动提取算法实现了中文医学病历文本中面向医学问题的时间属性自动提取。该机器学习方法以经过医学问题和时间信息语义标注的病历文本为训练内容,时间关系结果标注采用以医学问题为中心的模式,即仅提取所关心医学问题的时间属性。在此方法框架下通过实验,重点分析了不同的CRF学习模板对于时间关系提取的影响,实验以63份实际病历作为实验文本,以多次交叉验证的方式获得不同学习模板情况下时间关系自动提取准确率的平均值,通过分析实验数据总结了CRF学习模板设计的一般规律,实验中最佳模板情况下时间关系提取正确率可达86.94%,这些结果将为后续研究提供基础。
- 周小甲李昊旻段会龙吕旭东
- 关键词：信息提取条件随机场
- 可扩展的临床决策支持应用集成架构被引量：3
- 2015年
- 设计并实现一种可扩展的临床决策支持应用集成与管理系统架构.通过调用和数据互操作2个层面的临床决策支持应用工具集成规范,将临床评分器、计算器以及决策支持系统等应用工具集成到临床信息系统中,提供一整套的应用工具注册、管理和推送机制,实现对于不同类型和不同功能应用工具的靶向推送.将系统架构在实际临床信息环境下进行评估.结果表明:该方法可以解决临床决策支持应用工具与临床信息系统的基本互操作问题,并能使临床决策应用工具融入到临床工作流程中.
- 郑翔张寅升黄震震贾峥段会龙赵饮虹李昊旻
- 关键词：临床决策支持
- 基于双层建模的知识表达方法在医学知识库构建中的应用被引量：2
- 2017年
- 医学知识库是临床决策支持系统(CDSS)的重要组成部分。目前部署在医院内部的CDSS通常针对特定的需求(如合理用药、辅助诊断),其知识库所涵盖的知识种类比较单一。构建一个整合多种不同医学知识种类的协同知识库,能够使得不同类型的知识内容作为一个有机整体提供更加全面和有效的决策支持应用。提出一种基于双层建模的知识表达方法,首先分析和归纳临床信息化环境下影响诊疗决策的各类医学知识,如诊断知识、治疗知识、药学知识等,并对它们之间的协同关系进行定义,形成认知模型,然后针对特定的知识推理和计算的需求,为每一种知识类型选取具体的知识表达形式,形成最终的计算模型。基于该双层建模方法所研发的临床决策支持系统在三甲医院已运行4年多,实践表明该系统有效解决不同知识类型的集成和推理的需要,为构建整合和全面的知识应用奠定基础。
- 张寅升王瑞乔清治李昊旻吕旭东段会龙
- 关键词：知识表达知识库临床决策支持系统
- 中文病历文本中的时间表达分类与识别
- 时间表达式识别是时序语义标注的关键技术之一,其结果的好坏直接影响时间信息后续利用的效果。国外相关领域研究成果不能直接应用于中文,国内此领域的研究大多针对新闻语料,无法满足医学领域的时间表示识别要求,因此专门针对医学病历语...
- 周小甲李昊旻吕旭东段会龙
- 关键词：生物医学工程人工智能
- 文献传递
- 药物不良反应知识库的建设以及统计分析被引量：10
- 2015年
- 目的:建立一个药物与不良反应对应关系的知识库,为药物不良反应的监测以及药物不良反应研究提供一个在线资源。方法:首先通过网络爬虫从互联网获取中文的药品说明书数据,然后通过自然语言处理的方法自动从药品说明书中提取相应的不良反应,并构建相应的知识库来存储药品与不良反应的关系,最后对该知识库药品以及药品的分类进行了不良反应的统计分析。结果:建立了一个由3 683个药品和39 583个药品与不良反应关系组成的知识库,统计表明76.6%的药物有明确不良反应,其中94.5%的药物都有多于1个的不良反应;给出了不良反应最多的10种药品以及最常见的不良反应;通过对不良反应最多的100个药物的ATC分类统计显示其中多数属于抗感染药物、心血管药物和抗肿瘤药及免疫制剂三类。结论:搭建了该药物不良反应知识库网站提供免费在线查询和下载http://www.cktp.org:8006/Display/ADE,可以服务于临床药物不良反应监测和相关的不良反应研究。
- 葛彩霞张寅升陈维红段会龙李昊旻
- 关键词：药物不良反应知识库
- 一种面向诊疗协议的知识表达及转化方法被引量：2
- 2014年
- 基于最佳循证依据来规范医疗行为,能够有效提高医疗质量和保障医疗安全。而各类循证医学诊疗协议(如标准医嘱集和临床路径),在临床实践中并未得到普遍认可和广泛利用,其中一个重要原因是诊疗协议在临床信息环境中被简化为套餐式的医嘱集,缺乏对于个体的适应性和复杂知识的执行力,因此被临床工作者称为"菜谱医疗"。本论文提出一种诊疗协议的知识表达和转化方法,在支持传统规范化表达的临床诊疗协议的同时,能够管理、调用和集成各类个性化的临床决策支持应用,以支持个性化执行和完成复杂医学知识的转化。基于此方法设计和实现了一个临床知识转化平台,通过与临床信息系统的集成可以智能推荐诊疗方案,并提供可扩展的个性化执行环境,允许以插件的形式转化复杂临床循证知识,为个性化和精细化的循证医疗提供了一种技术解决方案。
- 张寅升李振叶李昊旻郑翔吕旭东段会龙
- 关键词：循证医学知识表达知识转化
- 面向循证医学知识转化的相关概念及研究现状被引量：10
- 2016年
- 医学领域每年都有大量的研究成果被发表出来,而这些以文献为主要载体的知识难以被及时地传播给临床工作者并有效影响临床决策,从而导致了"知识与实践之间的鸿沟",阻碍了循证医学的贯彻和实施。针对这一问题,知识转化被提出并成为近些年的研究热点,其目标就在于将文献中基于最佳临床证据的医学知识及时且有效地转化为临床实践。目前学术界对于知识转化存在不同程度的理解差异,而且知识转化易与转化研究等概念混淆。为此,本文对知识转化的定义、影响因素、过程模型和研究现状进行了系统的阐述,以期为知识转化提供基础性参考。医学工作者在实践循证医学的过程中应强化知识转化的理念,并综合运用政策、经济和技术等系统性的手段来加速知识向临床实践的转化。
- 张寅升李昊旻段会龙
- 关键词：知识转化循证医学
