深圳市科技计划项目(200802074)
- 作品数：5 被引量：13H指数：3
- 相关作者：王晓辉鲍毅何太平陈琳石向东更多>>
- 相关机构：深圳市疾病预防控制中心广东医学院北京大学第一医院更多>>
- 发文基金：深圳市科技计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 人类免疫缺陷病毒1型vpr基因变异研究
- 2010年
- 目的 分析HIV-1毒株vpr基因变异规律.方法 RT-PCR扩增HIV-1毒株vpr基因,经测序后构建基因进化树并分析其亚型分布;比较Vpr蛋白32～46位关键肽段氨基酸序列的差异;分析国内外Vpr蛋白77位氨基酸多态性的分布差异.结果 01_AE为HIV-1主要亚型（49.53%）;B亚型vpr基因组内变异最大;Vpr蛋白77位存在多态性,分别编码谷氨酰胺、精氨酸和组氨酸残基,这种多态性在国内外分布差异无统计学意义（P=0.617）.结论 HIV-1毒株vpr基因分型以01_AE亚型为主,vpr基因存在多态性,与国内外报道一致.
- 王晓辉秦彦珉程慧石向东陈琳
- 关键词：人类免疫缺陷病毒1型VPR基因基因多态性
- 深圳地区120株HIV-1膜区和结构蛋白区基因变异分析
- 2010年
- 目的研究深圳地区HIV-1病毒株在膜区和结构蛋白区基因变异情况,比较不同亚型毒株之间基因离散率的差异。方法收集HIV-1感染者新鲜血浆,提取血浆中HIV-1病毒株RNA,RT-PCR套式扩增env区和gag区基因,基因测序后进行序列比对和分析,构建基因进化树,计算基因离散率。结果各亚型毒株在env区相互之间基因离散率最大的是B亚型和07-BC亚型,最小的是07-BC亚型和08-BC亚型;各亚型毒株在gag区相互之间基因离散率最大的是01_AE亚型和07-BC亚型,最小的是07-BC亚型和C亚型。结论 07-BC、08-BC及C亚型在两个基因片段上基因距离均最近,说明这三个亚型可能有共同的起源。
- 秦彦珉王晓辉石向东甘永霞张燕
- 关键词：分子流行病学
- 深圳市HIV-1分子流行病学及不同亚型混合感染研究被引量：5
- 2011年
- 目的了解深圳市HIV分子流行病学及不同亚型混合感染情况。方法对429例HIV-1感染者进行详细的流行病学调查,提取外周静脉抗凝血中的病毒核酸,RT-PCR巢式扩增病毒的包膜蛋白(env)和核心蛋白(gag)基因的核酸片段,结合HIV数据库和Mega软件分析测序结果,建立进化树,确定每个基因的亚型。结果在400份合格序列的样本中有01-AE、07-BC、08-BC、02-AG 4种重组型和B、C 2种亚型,01-AE是主要流行株;有6例样本的env和gag区基因分型结果存在不一致情况。结论深圳市存在HIV-1多亚型共流行和混合感染情况。
- 鲍毅王晓辉何太平程锦泉徐小元
- 关键词：HIV-1基因测序
- 深圳市HIV-1在同性和异性传播中的分子流行病学分析被引量：4
- 2010年
- 全世界HIV-1感染者中，约3／4通过性传播途径感染，其中约有1／4是通过男男性途径感染的。深圳市HIV经静脉吸毒传播在20世纪90年代占主导地位，进入新世纪后，异性性传播逐渐转变为主要的传播途径。近几年，同性传播感染人数急剧升高。本研究试图从分子流行病学的角度来研究深圳市同性和异性传播途径中病毒株的变异规律。
- 鲍毅王晓辉陈琳何太平石向东赵锦杨峥嵘
- 关键词：HIV-1感染者分子流行病学流行病学分析异性性传播吸毒传播
- 深圳市男男性行为人群人类免疫缺陷病毒1型流行株的聚集性分析被引量：4
- 2011年
- 目的研究深圳市男男性行为(MSM)人群人类免疫缺陷病毒1(HIV-1)亚型的聚集性,为艾滋病的预防治疗提供科学依据。方法 RT-PCR巢式扩增深圳市MSM人群HIV-1病毒的gag基因和env基因,结合HIV数据库和MEGA4.02软件分析测序结果,确定亚型;建立进化树,比较各亚型的组内基因离散率。结果深圳市MSM人群中HIV-1流行株以CRF01-AE为主,占53.0%,与CRF07-BC、CRF08-BC、B、C共同存在,各个亚型均形成了簇集(cluster);B亚型cluster的基因离散率最大(gag区:9.5%,env区:16.1%),CRF01-AE形成了3个独立的cluster。结论深圳市MSM人群中流行的HIV-1毒株是复杂的,并且不同亚型的毒株也有各自的变异,以CRF01-AE和B亚型最为典型,病毒基因的变异对病毒的表型,疾病的进程及耐药性的影响尚待进一步研究。
- 王晓辉鲍毅何太平陈琳程锦泉
- 关键词：人类免疫缺陷病毒1型男男性行为基因变异聚集性分析
