中国博士后科学基金(2005037803)
- 作品数：10 被引量：22H指数：3
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- 相关机构：四川农业大学昆明动物园西南林学院更多>>
- 发文基金：中国博士后科学基金四川省教育厅自然科学科研项目国家自然科学基金更多>>
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- 7个灵长类物种PRSS12基因编码区序列测定与进化分析被引量：1
- 2010年
- 参考人的PRSS12基因组序列(NT016354),分段设计多对引物,对灵长类系统发育中代表不同谱系的7个物种的PRSS12基因蛋白质编码序列进行了PCR扩增、序列测定和拼接,结果获得了7个非人灵长类物种PRSS12基因的完全编码序列,全长为2628bp(大猩猩2631bp,黄猩猩2634bp),均含有13个完整的外显子。同源性分析表明,灵长类PRSS12的核苷酸和氨基酸序列均显示出高度的保守性。其基因进化速率也非常缓慢,每10亿年每个位点的平均非同义替换数仅为0.20个,平均同义替换数仅为1.13个。选择性检验表明,在灵长类的进化历程中,PRSS12其因保持着由纯化性选择所致的强烈的功能束缚,这暗示着该基因在灵长类的神经系统发育和认知能力发展中可能起着关键的功能性作用。进一步分析表明,纯化性选择实际上主要作用于PRSS12基因的SRCR功能结构域编码区,该结构域起着介导PRSS12基因编码蛋白结合于其它细胞表面或胞外蛋白质的重要作用。
- 徐怀亮
- 关键词：灵长类分子进化
- 藏酋猴毛干DNA的3种提取方法被引量：7
- 2010年
- 为寻求一种从藏酋猴毛干中提取总DNA的有效方法,从一藏酋猴个体背部剪取数量不等的毛干样品(不含毛囊),经蛋白酶K消化后,分别采用高盐沉淀抽提法、酚氯仿抽提法、纳米磁珠抽提法分离获得用于PCR扩增的模板DNA,通过紫外分光光度计测定OD值并计算出质量浓度,同时进行琼脂糖凝胶电泳和PCR扩增检测,分析3种方法提取藏酋猴毛干DNA的质量差异。每处理设置10个重复。结果表明,纳米磁珠法提取藏酋猴毛干中DNA是一种快捷、简便、经济、高效、安全的有效方法;进行毛发取样时以5～10根较为合适。
- 徐怀亮汪宴廷姚永芳黄晓峰倪庆永程安春潘阳
- 关键词：藏酋猴DNA
- 白颊噪鹛消化系统形态的初步研究被引量：5
- 2008年
- 白颊噪鶥消化系统的形态学初步观察与研究,结果表明:白颊噪鶥舌呈长三角形,舌尖分叉呈"V"字型,粘膜上具有尖端指向后方的栉状突;食道颈胸分段不明显,食管全长43.33mm,食管与嗉囊分界不明显;腺胃上圆形乳突少而稀,肌胃发达;肠几乎与体长相等,小肠较发达,雄鸟约长182.8mm,占肠道总长88.8%;雌鸟约长196.38mm,占肠道总长88.6%;具有左右侧盲肠,占肠道总长4.87%;直肠占肠道总长6.4%;肝分左右两叶;胰细长形,分两小叶。这些消化道特征说明白颊噪鶥是以食虫为主的杂食性鸟类。
- 姚永芳徐怀亮潘阳
- 关键词：形态学
- 野猪生长激素基因的克隆与序列分析被引量：1
- 2010年
- 参考家猪GH基因序列[M17704.1],设计1对特异引物,用PCR方法从野猪基因组中扩增出1条长约1.8kb的DNA片段。PCR产物经PMD18-TVector载体转化感受态DH5α株大肠杆菌,获得重组克隆子。结果表明:野猪生长激素基因DNA序列长1792bp,含完整的5个外显子和4个内含子,与家猪、牛、山羊、河马、狗、小鼠和恒河猴的GH基因cDNA序列同源性分别为99.19%、89.6%、89.7%、94.6%、92.9%、86.9%、77.3%。其cDNA所编码氨基酸与牛、山羊、河马、狗、小鼠和恒河猴同源性分别为98.74%、83.9%、83.9%、92.5%、90.7%、81.6%、65.5%。所测野猪生长激素基因序列与13个家猪品种的GH基因序列比较,检出54个核苷酸变异位点(外显子12个,内含子36个,侧翼区6个),其中24个为各家猪品种内所不具有的新变异位点,即野猪种群特有变异位点。在外显子的12个变异位点中,有8个可导致氨基酸残基的改变。这些结果,表明了野猪GH基因在进化过程中的保守性和多态性。
- 徐怀亮姚永芳朱庆杨晓军
- 关键词：生长激素基因克隆野猪
- 野猪白细胞抗原DQB外显子2核苷酸多态性研究被引量：1
- 2013年
- 采用DNA测序技术测定了15头野猪235 bp的SLA-DQB基因外显子2序列,结合GenBank中报道的另外3头野猪和18头家猪共36头个体的相应序列,重点进行野猪SLA-DQB外显子2的核苷酸多态性分析。结果:18头野猪中检出26个变异位点,其中2个为单变异位点,24个为简约信息位点。同时发现7个野猪群体所特有多态位点,占野猪突变位点总数的26.92%;野猪235 bp的SLA-DQB基因外显子2序列的非同义突变率较高,占总突变位点总数的84.62%;野猪的单倍型多样度为(0.971±0.027),核苷酸多样度为(0.034 69±0.005 89)。用Kimura双参数法计算野猪种群内个体的平均遗传距离为0.037,野猪种群和家猪种群间的平均遗传距离为0.053。这些结果表明野猪SLA-DQB外显子2具有较丰富的核苷酸多态性;在家猪品种改良中,野猪具有潜在的遗传价值。
- 董高华徐怀亮姚永芳黄晓峰
- 关键词：SLA-DQB野猪外显子2
- 野猪肌细胞生成素基因的克隆与序列分析被引量：1
- 2010年
- 参考家猪(X89007)MyoG基因序列设计2对特异引物,用PCR方法首次从野猪基因组中扩增出2个大小分别约为1.6 kb和1.0 kb的DNA片段,其PCR产物经pMD-18T载体转化感受态DH5α株大肠杆菌,获得重组克隆子。DNA测序和序列拼接表明:野猪肌细胞生成素基因DNA序列长2 466bp,含完整的3个外显子和2个内含子,与家猪、牛、马、狗、小鼠和人的MyoG基因的cDNA序列同源性分别为99.8%、92.4%、92.7%、89.7%、90.8%和94%,其cDNA编码氨基酸序列与家猪、牛、马、狗、小鼠和人的同源性分别为100%、96.4%、95.9%、94.1%、96.4%、96.8%;对野猪MyoG基因组序列与9个家猪品种的相应同源序列进行比较,检出16个核苷酸变异位点,且其中有5个为家猪中不具有的新变异位点,其变异位点主要发生在内含子部分,尤其是内含子1中的变异位点比例最大(11个)。这些结果表明,野猪肌细胞生成素基因的编码序列在进化过程中是高度保守的,而内含子部分尤其是第1内含子具有丰富的序列多态性。对117个限制性酶切位点扫描分析发现,野猪MyoG基因核苷酸序列中含有78个酶切位点,其中有5个酶切位点包含变异位点,尤其是1 153位点的T突变成G所产生的SmaI(CCC/GGG)或XmaI(C/CCGGG)酶切位点为野猪所特有。所测DNA序列已提交到GenBank中,获得的序列号为:FJ356697。
- 徐怀亮姚永芳朱庆潘阳
- 关键词：野猪肌细胞生成素克隆
- 猪獾苦味受体T2R2基因的分子克隆与进化分析被引量：1
- 2009年
- 苦味的感知是机体有效的自我保护机制之一。文章采用PCR和克隆测序方法首次从猪獾基因组中获得一全长为1169bp的苦味受体T2R2基因DNA序列(GenBank登录号:FJ812727)。该序列含有完整的1个外显子(无内含子),大小为915bp,编码304个氨基酸残基。其蛋白质等电点为9.76,分子量为34.74kDa。拓扑结构预测显示猪獾T2R2蛋白上含有N?糖基化位点、N-肉豆蔻酰化位点各1个,蛋白激酶C磷酸化位点2个。整个蛋白质多肽链含有7个跨膜螺旋区,4个细胞外区和4个细胞内区。亲水性/疏水性分析表明,猪獾T2R2蛋白质为一疏水性蛋白,其亲水性区段所占比例较小。种间相似性比较显示,猪獾T2R2基因与犬、猫、牛、马、黑猩猩和小鼠的T2R2基因cDNA序列相似性分别为91.4%、90.6%、84.4%、85.4%、83.8%、72.1%,氨基酸序列相似性分别为85.5%、85.8%、74.0%、77.6%、75.3%、61.5%。核苷酸替换计算和选择性检验结果表明,猪獾T2R2基因与犬、猫、牛、马、黑猩猩和小鼠间存在着强烈的纯净化选择(Purifying selection),即强烈的功能束缚(Functional constraint),进一步分析发现该选择作用实际上主要存在于跨膜区。猪獾、犬、猫、牛、马、黑猩猩和小鼠的T2R2基因外显子核苷酸序列构建的基因树与其物种树的拓扑结构是相一致的,表明T2R2基因适合于构建不同物种间的系统进化树。
- 徐怀亮姚永芳朱庆
- 关键词：猪獾克隆分子进化分析
- 松鸦消化系统形态的初步研究被引量：1
- 2008年
- 对松鸦消化系统的形态学作了初步的观察与研究,为松鸦的保护利用、饲养及生物学研究提供形态学的基础资料,结果表明:松鸦舌呈宽阔三角形,舌尖分叉呈"V"字型,分叉深为0.96 mm,黏膜上具有尖端指向后方的栉状突;食道颈胸分段不明显,食管全长55.34 mm,食管与嗉囊分界明显,嗉囊显著膨大;腺胃上具有数目较多且均匀分布的圆形乳突,肌胃发达;肠全长454 mm,约为体长的2.06倍,小肠较发达,长419 mm,占肠道总长92%;左右侧盲肠长5.46 mm,占肠道总长1.2%;直肠占肠道总长2.6%;肝分左右两叶;胰细长形,分两小叶。这些消化道特征说明松鸦是以食虫为主的杂食性鸟类。
- 姚永芳徐怀亮潘阳
- 关键词：形态学
- 核苷酸多态性分析野猪SLA-DQB外显子2的被引量：4
- 2012年
- 本试验采用DNA测序技术测定了15头野猪235bp的SLA-DQB基因外显子2序列,结合GeneBank中报道的另3头野猪和18头家猪共36个个体的相应序列,重点对野猪SLA-DQB外显子2进行核苷酸多态性分析。结果表明野猪SLA-DQB外显子2具有较丰富的核苷酸多态性;在家猪品种改良中,野猪具有潜在的遗传价值。
- 董高华董高华徐怀亮姚永芳黄晓峰
- 关键词：野猪外显子2
