国家自然科学基金(81071760)
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
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- 相关机构：中山大学中山大学附属第一医院中山医学院更多>>
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- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- Endophilin B1基因及蛋白的生物信息学分析被引量：1
- 2012年
- 目的:利用生物信息学方法分析人Endophilin B1基因以及蛋白的结构,为进一步研究其功能和参与的调控机制提供一定的理论依据。方法:通过GenBank搜索Endophilin B1基因及蛋白序列,采用生物信息学方法分析该基因在不同物种中的差异,分析该蛋白的亚细胞定位,二级结构,功能域以及抗原表位。结果:该基因编码一个长度为365个氨基酸的蛋白,具有两个BAR和SH3两个功能域。Endophilin B1蛋白理论分子量为40796.3,理论等电点为5.78。二级结构中α螺旋(H)占56.44%,β折叠(E)占5.48%,无规卷曲占38.08%。Endophilin B1蛋白含有4个可能的N连接糖基化位点,5个潜在的酪蛋白激酶II磷酸化位点,7个豆蔻酰基化位点,3个PKC磷酸化位点以及2个酪氨酸激酶磷酸化位点。并进一步利用DNAstar软件分析了了该蛋白的抗原表位。结论:利用生物信息学预测出的结构和功能信息,能为Endophin B1蛋白的相关研究提供一定的信息基础。
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- 关键词：B1BARDOMAINDOMAIN
- 前列腺特异性膜抗原新型剪接变异体PSME基因及蛋白的生物信息学分析
- 2012年
- 目的通过对PSME的生物信息学分析,更多的了解该基因及蛋白结构与功能的相关信息。方法运用生物信息学方法分析PSME基因结构,序列及其编码蛋白的理化性质和结构与功能特征,蛋白相互作用网络以及抗原表位。结果用ExPASy的Computer PI/Mw、SMART等软件对其氨基酸序列进行分析,该蛋白的PI值为6.38,相对分子质量约为78 000。二级结构中α螺旋(H)占34.66%,β折叠(E)占12.93%,无规卷曲占52.41%。PSME信号肽位于1～22位氨基酸,150～248位为肽酶结构域,639～703位为转铁蛋白受体二聚体,且含有多个糖基化位点。通过DNA Star软件分析得到了PSME蛋白的抗原表位。结论利用生物信息学预测出的结构和功能信息,能为PSME蛋白的相关研究提供信息基础。
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- 关键词：生物信息学前列腺特异性膜抗原
- Bif-1对前列腺癌LNCap细胞生物学行为的影响被引量：1
- 2012年
- 目的研究Bif-1基因的过表达对前列腺癌细胞凋亡、增殖以及迁移过程的影响。方法构建Bif-1基因全克隆并转染LNCap细胞,上调细胞中Bif-1基因的表达水平,通过流式细胞术检测细胞转染前后的细胞凋亡情况;通过MTT法检测细胞的增殖能力变化;通过划痕试验检测细胞迁移能力的变化。结果转染Bif-1基因后,Real-time PCR检测发现LNCap细胞中Bif-1基因mRNA水平△△CT高于对照组10倍以上;Western blotting条带光密度值提高2倍以上。实验组细胞凋亡比例升高至31.90%,细胞增殖能力减弱。实验组和对照组中LNCap细胞划痕愈合速度基本相同,差异无统计意义(P>0.05)。结论 Bif-1基因在LNCap细胞中的过表达促进了细胞凋亡,抑制细胞的增殖能力,而对前列腺癌细胞的迁移能力无显著影响。基因有可能作为一个潜在的前列腺癌治疗靶点。
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- 关键词：前列腺癌细胞凋亡
