江苏省高技术研究计划项目(BG2007328)
- 作品数：18 被引量：152H指数：9
- 相关作者：傅洪拓龚永生吴滟蒋速飞熊贻伟更多>>
- 相关机构：中国水产科学研究院淡水渔业研究中心南京农业大学更多>>
- 发文基金：江苏省高技术研究计划项目国家科技支撑计划农业科技跨越计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 海南沼虾ITS-1序列分析被引量：2
- 2009年
- 为了了解海南沼虾遗传方面信息,利用ITS-1分子标记技术对珠江海南沼虾群体作了研究。研究结果表明:①其ITS-1片段在1700～1900bp之间,较日本沼虾短;②其碱基含量变化范围为:27%～30%(A),27%～31%(G),14%～16%(C),43%～46%(G+C);③其ITS-1序列中包含着非常丰富的SSR序列信息,具体为(AG)n,(GA)n,(AGT)n,(AGC)n,GCA)n重复,在个体中出现的比例分别为100%,100%,25%,12.5%,12.5%。(AG)n,(GA)n是多态位点;④BLAST比对结果表明,海南沼虾同日本沼虾和刀额新对虾都有较高的同源性。此研究结果在一定程度上填补了海南沼虾ITS-1方面研究的空白,同时也为海南沼虾后续研究提供了理论参考。
- 姚建华傅洪拓龚永生吴滟
- 关键词：海南沼虾ITS-1SSR微卫星
- 应用SSR和SRAP标记构建青虾遗传连锁图谱被引量：9
- 2012年
- 采用SSR和SRAP标记结合拟测交策略构建青虾（Macrobrachium nipponense）遗传连锁图谱。共有175个标记（含27个SSR、148个SRAP标记）分布在53个连锁群上。每个连锁群含2~8个标记,其中不少于3个标记的连锁群有35个,连锁对18个,平均每个连锁群的标记数为3.3个;连锁群长度在6.7~91.2 cM之间,相邻标记间最大间隔为49.0 cM,最小为1.4 cM,平均间隔为13.1 cM。青虾框架图谱长度为997.2 cM,图谱观察总长度为2 270.5cM,根据估算,青虾遗传连锁图谱预期长度为4 380.6 cM,图谱的覆盖率为51.83%。本研究构建了青虾遗传连锁图谱,该图谱也是淡水虾蟹类第一张遗传连锁图谱,可为青虾QTL定位、基因克隆、遗传选育等提供指导,并为进一步构建高密度的青虾遗传连锁图谱奠定了基础。
- 乔慧吴滟傅洪拓龚永生蒋速飞熊贻伟
- 关键词：青虾日本沼虾SSRSRAP遗传连锁图谱
- 日本沼虾不同地理种群的遗传多样性研究被引量：9
- 2008年
- 笔者采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对6个地理种群(微山湖、洪泽湖、太湖、龙感湖、洪湖、珠江)的日本沼虾各30个个体进行了遗传多样性分析。在筛选出的18个引物中共检测到201个位点,大小在100-2000bp之间。多态位点141个,多态位点比例70.15%;各种群的多态位点数为30-99不等,多态位点比例为21.13%-55.93%。日本沼虾中国不同地理种群的平均遗传杂合度为0.2446,各种群内平均遗传杂合度为0.1132-0.2071。Shannon信息指数(I)为0.1695-0.2950。日本沼虾6个地理种群的两两地理种群间遗传分化指数Gst值在0.2116-0.4442之间,种群间总的遗传分化指数Gst0值为0.4858,Nm值在0.6257-1.8628之间,表明日本沼虾种群间已经发生显著或重要分化。同时发现OPX-830bp、OPI-360bp为珠江种群区别于其他种群的特征标记。聚类分析结果表明,洪湖种群与龙感湖种群,洪泽湖种群与微山湖种群分别先聚在一起,再与太湖种群聚类,最后与珠江种群聚合在一起。
- 蒋速飞傅洪拓熊贻伟吴滟龚永生
- 关键词：日本沼虾地理种群RAPD
- 青虾高血糖激素基因全长cDNA序列的克隆及表达分析被引量：11
- 2013年
- 本研究首次克隆了青虾(Macrobrachium nipponense)高血糖激素(crustacean hyperglycemic homone,CHH)基因全长cDNA序列,并使用荧光定量PCR技术首次检测了CHH基因在青虾不同组织中的表达。青虾CHH基因cDNA全长1 017 bp,包括241 bp的5′UTR,408 bp的开放阅读框(ORF),355 bp的3′UTR,开放阅读框编码135个氨基酸。成熟肽包含6个CHH家族中位置保守的Cys残基。青虾CHH成熟肽C端为GK,确定为ES型CHH基因。蛋白相似度比对显示,所分离的青虾CHH被归为CHH家族I型肽。系统进化树分析表明,青虾CHH多肽与罗氏沼虾聚在一起,具有最近的亲缘关系。荧光定量PCR检测显示,CHH基因在青虾不同组织中均有表达,其表达量由高到依次为眼柄、精巢、腹神经节、脑、肠、肝、心脏、卵巢。以卵巢为参照其表达量设为1时,眼柄与精巢CHH基因表达量分别为卵巢的500倍和250倍,由此推测CHH基因可能与雄性生殖过程相关。
- 金舒博王宁乔慧傅洪拓吴滟龚永生蒋速飞熊贻伟
- 关键词：青虾CDNA定量PCR
- 青虾泛素特异性蛋白酶9基因Usp9全长cDNA序列的克隆及表达分析被引量：1
- 2015年
- 本研究首次克隆了青虾的Usp9(ubiquitin-specific protease 9)基因全长c DNA序列,并在青虾中使用荧光定量PCR技术首次检测了Usp9基因在不同组织和发育阶段中的表达变化。青虾Usp9基因c DNA全长1259 bp,包括162 bp的5’UTR,978 bp的开放阅读框以及116 bp的3’UTR。氨基酸序列比对分析显示,青虾Usp9蛋白与太平洋牡蛎(Crassostrea gigas)、凤仙花熊蜂(Bombus impatiens)及灰短尾负鼠(Monodelphis domestica)的蛋白相似度分别为99%、97%和95%。应用MEGA5.1软件对青虾与其他物种的Usp9氨基酸进行系统进化树分析,结果表明,青虾Usp9与同为甲壳纲的钩额型蚤状溞聚为一支,具有最近的亲缘关系。采用荧光定量PCR技术检测了Usp9基因的时空表达,水温28℃时,Usp9基因在青虾发育的后幼体发育期第5天PL5出现表达高峰。Usp9基因在6种成体组织中均有表达,表达水平依次为:脑>腹神经>精巢>卵巢>肌肉>肠。而在雌雄组织差异表达分析表明,精巢中Usp9基因表达量比卵巢的比值为2.86,脑组织中雄虾的表达量比雌虾为2.27,差异均为极其显著(P<0.01)。这表明Usp9基因的表达和雄性偏向基因趋势是一致的(雄性表达:雌性表达≥1.5)。本研究为进一步开展青虾Usp9基因功能等相关研究奠定了基础,并可为青虾性别的遗传调控机制研究提供参考。
- 袁晖周巧张世勇傅洪拓孙盛明乔慧张文宜
- 关键词：青虾基因克隆
- 青虾生长性状相关的微卫星标记筛选被引量：13
- 2010年
- 青虾,学名日本沼虾（Macrobrachium nipponense）,又称河虾。属于甲壳纲（Crustacea）,十足目（Decapoda）,长臂虾科（Palaemonidae）,沼虾属（Macrobrachium）。
- 傅洪拓万山青付春鹏乔慧吴滟龚永生蒋速飞熊贻伟
- 关键词：青虾微卫星生长性状分子标记
- 日本沼虾ITS1序列分析及SNPs位点的筛选被引量：8
- 2010年
- 研究采用直接测序法,分析日本沼虾(Macrobrachium nipponense)rDNA基因内转录间隔区ITS1的DNA序列,以筛选日本沼虾SNPs位点。共分析了32个太湖水域野生日本沼虾样本,结果表明,日本沼虾ITS1序列平均长度为1749.8bp,是迄今已报道的最长的ITS1序列,A、G、T和C的平均含量分别为29.9%、28.3%、27.7%、14.0%,G+C的含量平均为42.3%。通过序列比对,共筛选出22个SNPs位点,SNPs位点出现频率为0.0126,其中9个为C/T转换(占40.91%),4个为A/G转换(占18.18%),2个为A/T颠换(占9.09%),5个为T/G颠换(占22.73%),1个为A/C颠换(占4.55%),1个A/T或C颠换(占4.55%)。日本沼虾ITS1序列的22个SNP位点中,21个位点为2个等位基因,1个位点出现了3个等位基因,为复等位基因位点。日本沼虾ITS1序列中还发现3个具有多态性的微卫星位点、1个高度变异区以及大量的缺失、插入。研究首次对日本沼虾ITS1序列进行了分析,并发现了大量的SNP位点,为日本沼虾遗传育种研究提供了新的分子标记。
- 张洪伟傅洪拓吴滟龚永生王庆夏德全
- 关键词：日本沼虾RDNA内转录间隔区ITS单核苷酸多态性SNP
- SRAP分子标记技术及其在水产育种中的应用前景被引量：3
- 2009年
- SRAP分子标记技术,即相关序列扩增多态性,是目前较为新型的一种分子标记技术,以其独特的优点,被广泛应用于物种遗传多样性分析、基因定位、种质资源鉴定三个方面。本文综述了国内外SRAP分子标记技术的应用成果,并结合水产育种工作实际,认为SRAP分子标记技术在水产育种中的应用前景非常广阔。
- 姚建华傅洪拓龚永生吴滟
- 关键词：SRAP遗传多样性分析基因定位种质资源鉴定
- 丁香酚抑制日本沼虾应激反应效果的研究被引量：2
- 2010年
- 本实验以丁香酚和日本沼虾为对象,研究了丁香酚对日本沼虾因温度的急剧变化和形态测量所造成的应激反应的抑制效果。结果显示,丁香酚浓度为500mg/L时,对照组和实验组的存活率开始呈显著下降趋势的温差幅度分别为10和14℃;当温差为18℃时,对照组存活率为0,实验组存活率为0.653±0.033;当温差达到10℃后,实验组存活率明显高于对照组存活率(P<0.05)。形态测量结果显示,实验组的断肢率显著低于对照组,而存活率显著高于对照组(P<0.05)。研究表明,丁香酚可明显提高日本沼虾存活率,并显著抑制日本沼虾的应激反应。
- 何新龙傅洪拓龚永生吴滟熊贻伟蒋速飞
- 关键词：丁香酚日本沼虾麻醉剂应激反应
- 磁珠富集法筛选日本沼虾微卫星序列
- 采用磁珠富集法筛选日本沼虾微(Macrobrachium nipponensis)卫星序列。总计获得了95个阳性克隆,78个克隆含有微卫星序列,其中完美型47个,占60.2%,不完美型25个,占32.0%,混合型6个,占...
- 李法君傅洪拓乔慧李明爽
- 关键词：日本沼虾微卫星磁珠富集
- 文献传递
