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中国科学院知识创新工程重要方向项目(KSCX2SW223)
作品数:
1
被引量:6
H指数:1
相关作者:
刘新春
张佩珩
江先阳
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相关机构:
中国科学院
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发文基金:
中国科学院知识创新工程重要方向项目
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相关领域:
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江先阳
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刘新春
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计算机研究与...
年份
1篇
2005
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一种面向生物信息学的可重构加速卡的设计与实现
被引量:6
2005年
人类基因组测序工作完成后,对基因数据的处理和分析能力提出了更高的要求.生物信息学的基本研究方法之一就是计算,其算法的特点是数据量较大、算法比较简单、运算类型单一、重复性较强、潜在的并行度较高.用现有的大规模并行机或超级服务器等通用系统解决这些问题,既浪费系统的资源,使用维护也比较复杂,有些问题甚至无法在限定的时间内完成.提出了一种比较通用的算法可重构硬件加速卡的体系结构,以全局SmithWaterman算法为例,阐述了从算法到硬件实现的映射过程,并指出了将其他类型算法映射到该加速卡上的可行性.
张佩珩
刘新春
江先阳
关键词:
可重构
FPGA
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