深圳市科技计划项目(201102104)
- 作品数:4 被引量:105H指数:4
- 相关作者:何雅青杨洪李苑姚相杰罗敏更多>>
- 相关机构:深圳市宝安区疾病预防控制中心深圳市疾病预防控制中心南方医科大学更多>>
- 发文基金:深圳市科技计划项目更多>>
- 相关领域:医药卫生更多>>
- 深圳市腹泻患者星状病毒感染的分子流行病学特征被引量:10
- 2013年
- 目的了解深圳地区感染性腹泻中星状病毒的感染情况,并研究其分子流行病学特点。方法采集深圳市2010年1月至2011年12月2083例疑似腹泻患者粪便标本,同时采集30例健康人粪便标本作为对照,采用荧光RT-PCR检测星状病毒核酸;然后使用特异性引物,对星状病毒核酸阳性标本进一步采用RT—PCR方法扩增星状病毒的ORF2区域,对PCR扩增产物经纯化、测序后进行序列分析,同时对病例的流行病学资料进行统计分析。结果星状病毒检出率为1.39%(29/2083);其中6月龄以下、6~11月龄、12—35月龄和36月龄以上患者检出率分别为2.96%(5/169)、1.48%(8/707)、2.48%(3/121)和1.20%(13/1086);星状病毒在冬季检出率较高,春季次之,夏季和秋季则较少发生。对ORF2区域进行基因测序和分析显示,深圳地区星状病毒以HAstV.1为主要流行株,HAstV-2、HAstV-5亦有检出,其他型别则未检出。其中HAstV-1又可分为3个亚组,分别与GenBank上的德国株(AY720892)、印度株(AB551380)和巴西株(AY846638)有较高的亲缘关系,其核苷酸同源性分别为98.3%-99.1%、96.0%~100%和98.0%~100%。结论星状病毒是深圳地区病毒性腹泻的重要病原之一,HAstV-1是深圳地区星状病毒的主要流行株,应加强对星状病毒腹泻的监冽。
- 张海龙杨洪罗敏唐屹君姚相杰冼慧霞阳帆何雅青李苑张克春
- 关键词:星状病毒分子流行病学
- 2010—2011年深圳市宝安区诺如病毒的分子特征分析被引量:13
- 2013年
- 目的了解深圳市宝安区诺如病毒腹泻的分子流行病学特点。方法采集深圳市宝安区2010年1月至2011年12月486例疑似病毒性腹泻患者粪便标本,使用商品化的GⅡ型诺如病毒荧光PCR试剂盒检测GⅡ型诺如病毒核酸。随机挑选若干GⅡ型诺如病毒阳性标本,用GⅡ型诺如病毒特异性引物COG2F/G2-SKR进行RT—PCR扩增,其他所有阴性标本用GI型诺如病毒特异性引物GI—SKF/GI—SKR进行RT—PCR扩增。阳性产物回收纯化并测序,用ClustalW和MEGA5.0生物软件对诺如病毒序列进行序列比对和系统进化分析。结果48份随机挑选的GⅡ型诺如病毒阳性标本中检mGⅡ.4/2006b型36株,GⅡ.4/2008型3株,GⅡ.5型9株;无诺如病毒GⅠ型检出。结论GⅡ型是2010年1月至2011年12月深圳市宝安区诺如病毒的主要型别,其中GⅡ.4/2006b是最重要的流行株。
- 张海龙李苑姚相杰冼慧霞杨洪罗敏何雅青
- 关键词:腹泻诺如病毒分子流行病学进化树
- 深圳市腹泻患者肠道腺病毒感染的分子流行病学特征被引量:13
- 2014年
- 目的 了解深圳地区感染性腹泻患者中肠道腺病毒的感染情况,并研究其分子流行病学特征.方法 采集深圳市2010年1月-2011年12月2083例疑似腹泻患者便标本,采用荧光PCR法检测肠道腺病毒核酸;应用特异性引物,对肠道腺病毒核酸阳性标本进一步扩增肠道腺病毒的hexon区,PCR扩增产物测序后,进行腺病毒型别鉴定和进化树分析,同时对病例的流行病学资料进行统计分析.结果 肠道腺病毒检出率为1.82%(38/2083);其中6月龄以下、6-11月龄、1-4岁和5岁以上患者检出分别为3.55%(6/169)、0.85%(6/707)、15.70%(19/121)和0.64%(7/1086);肠道腺病毒的感染无明显的季节变化特征,但不同月份检出率差异较大,介于0% ~4.76%之间.对hexon区序列分析结果显示,深圳地区肠道腺病毒以41型为主要流行株,无40型肠道腺病毒的检出.结论 肠道腺病毒是深圳地区病毒性腹泻的重要病原体之一,41型肠道腺病毒是深圳地区肠道腺病毒的主要流行株,应加强对肠道腺病毒腹泻的监测.
- 张海龙李苑赵德坚刘滕颖子冼慧霞杨洪罗敏姚相杰何雅青
- 关键词:肠道腺病毒分子流行病学
- 2010年广东省深圳市病毒性腹泻监测结果分析被引量:76
- 2012年
- 目的了解广东省深圳市病毒性腹泻的感染情况。方法采用实时荧光定量-聚合酶链反应对2010年1-12月深圳市925例疑似腹泻患者粪便标本同时进行轮状病毒、诺如病毒、星状病毒和肠道腺病毒核酸检测。结果 4种常见腹泻病毒的检出率分别为25.30%、20.11%、1.51%和2.27%。轮状病毒和诺如病毒全年各月均维持较高的检出率;轮状病毒感染有明显的季节特征,秋冬季为发病高峰;诺如病毒感染则无特殊的季节特征。0~2岁年龄组患者的感染率显著高于3岁以上年龄组患者。结论 2010年深圳市病毒性腹泻呈高发状态,其中轮状病毒和诺如病毒是主要的病原之一,星状病毒与肠道腺病毒的检出率较低。应加强对病毒性腹泻,尤其是婴幼儿病毒性腹泻的监测。
- 张海龙李苑张克春杨洪阳帆罗敏冼慧霞姚相杰何雅青
- 关键词:病毒性腹泻轮状病毒诺如病毒星状病毒肠道腺病毒