博士科研启动基金(BJ08-30)
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
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- 相关机构：内蒙古农业大学内蒙古大学更多>>
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- 相关领域：生物学更多>>
- 一个大数据库中预测蛋白质二级结构被引量：2
- 2012年
- 本文在1个大数据库中采用广义的2次判别法来预测蛋白质二级结构。在包含2640个蛋白的数据库中,先是定义4肽结构字,然后利用3种4肽结构字建立多样性源同时结合二次判别法来预测21残基片段中心残基的二级结构,最后在误差允许范围内对预测结果进行修正,自洽检验和独立检验的三态预测精度均超过83%。在同样的数据库中,与其它预测软件相比较,显示了我们的方法是占优势的。
- 冯永娥罗辽复
- 关键词：蛋白质二级结构
- 加入Contact number信息来预测蛋白质二级结构
- 2011年
- 蛋白质的功能是由其结构决定的,其中蛋白质二级结构是其3级结构的基础和重要的组成单元。本文采用结构字和contact number数建立多样性源,同时利用二次判别法来预测1个序列片段中心残基的二级结构。对CB513库中81个蛋白进行检验,结果发现增加contact number数建立的多样性源,其预测精度Q3提高了1.12%.这表明c,ontact number信息有助于提高预测二级结构精度。
- 冯永娥罗辽复
- 关键词：CONTACTNUMBER
- 应用化学位移预测蛋白质二级结构被引量：1
- 2015年
- 蛋白质二级结构预测是生物信息学中最重要的课题之一。本文从氨基酸序列的原子信息出发,以6种原子化学位移的均值作为新的特征参量,应用二次判别法对蛋白质二级结构进行预测,取得了较好的结果。3折交叉检验得到预测总精度为77.46%,其中alpha螺旋、beta折叠的预测准确率分别达到92.36%和81.39%。在同样的数据库中,与其它预测软件相比较,显示了我们算法的优越性。
- 李喆媛冯永娥
- 关键词：蛋白质二级结构化学位移
