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博士后科研启动基金(LXZZ2005003)
作品数:
2
被引量:7
H指数:2
相关作者:
于伟
崔健秋
吴少慧
付荣华
张眉眉
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相关机构:
辽宁省疾病预防控制中心
中国疾病预防控制中心病毒
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发文基金:
博士后科研启动基金
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相关领域:
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辽宁省甲3亚型流感病毒HA1基因特性分析
被引量:4
2009年
目的了解2001—2006年间辽宁省甲3亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法采用辽宁省流感监测的咽拭分离株,对其中的7株甲3病毒核酸提取,经逆转录一聚合酶链反应(RT—PCR),扩增产物测序,推导出其氨基酸序列,并用DNAMAN软件包中的Alignment做了差异和同源性比较,用Mega软件包中的Neighbor Joining方法,通过与NCBI数据库中2000--2006年28株H3N2流感病毒同源比对后,制作种系进化树,进行基因进化特征分析。结果序列分析发现,甲3亚型流感病毒与WHO当年的疫苗株A/California/7/2004比较,在其HA1核酸序列上有12处碱基不同,4个氨基酸位点发生了替换。基因及氨基酸序列同源性下降。与WHO北半球疫苗株A/Wisconsin/67/2005序列更接近,但仍有4处碱基不同。结论甲3亚型流感病毒基因序列发生了变异,与甲3亚型疫苗株A/California/7/2004同源性有下降趋势,提示其抗原可能发生部分漂移或更换,与南方浙江2005年株、WHO北半球2006--2007疫苗株A/Wisconsin/67/2005序列接近,提示南方春夏季流感流行株极有可能在北方秋冬季流行,对流感流行病学监测,疫苗株使用指导都具有重要意义。
吴少慧
舒跃龙
赵卓
姚文清
于伟
张眉眉
崔健秋
刘敏
付荣华
赵晓光
关键词:
正粘病毒科
辽宁省甲1亚型流感病毒HA1基因变异分析
被引量:3
2007年
目的了解2000~2006年辽宁省甲1亚型流感病毒HA1基因变异特征。方法利用辽宁省流感监测的咽拭分离株中的甲1亚型流感病毒核酸,采用逆转录-聚合酶链反应(RT—PCR)扩增,测序,并推导出其氨基酸序列,进行基因进化特征分析。结果辽宁省2000~2002年均分离到甲1亚型流感病毒,但消失了近3年后,2005年底又出现,且基因序列碱基发生变异,与2005年以前的病毒株和疫苗株A/New Caledonia/20/1999比较,在其HA1蛋白分子上存在有4个氨基酸位点(187位W〉R,188位Y〉F,209位Q〉K,249位V〉A)发生了替换。基因序列及氨基酸序列同源性均有下降。结论辽宁省2000~2006年甲1亚型流感病毒基因序列发生了明显变异,与甲1亚型疫苗株A/New Caledonia/20/1999同源性有下降趋势,提示其抗原可能发生部分漂移或更换,这对流行季节疫苗选择和流行病学研究都具有重要意义。
吴少慧
何雅慧
于伟
张眉眉
崔健秋
刘敏
付荣华
赵晓光
关键词:
流感病毒
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