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国家自然科学基金(20773089)

作品数:7 被引量:8H指数:2
相关作者:薛英鄢国森李强根吕巍郭勇更多>>
相关机构:四川大学西南民族大学四川农业大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金Scientific Research Foundation for the Returned Overseas Chinese Scholars, State Education Ministry教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
相关领域:理学医药卫生更多>>

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 6篇理学
  • 1篇医药卫生

主题

  • 3篇密度泛函
  • 3篇密度泛函理论
  • 3篇泛函
  • 3篇泛函理论
  • 2篇甲基
  • 2篇N
  • 1篇亚氨基
  • 1篇英文
  • 1篇正离子
  • 1篇支持向量
  • 1篇支持向量机
  • 1篇三唑
  • 1篇失活
  • 1篇取代基
  • 1篇取代基效应
  • 1篇酰化
  • 1篇酰化反应
  • 1篇脱氧
  • 1篇向量
  • 1篇向量机

机构

  • 5篇四川大学
  • 1篇四川农业大学
  • 1篇西南民族大学

作者

  • 5篇薛英
  • 3篇鄢国森
  • 2篇李强根
  • 1篇张成华
  • 1篇张嫦
  • 1篇邹平
  • 1篇孙元元
  • 1篇吕巍
  • 1篇郭勇

传媒

  • 2篇化学学报
  • 2篇物理化学学报
  • 1篇中国科学(B...
  • 1篇Chines...
  • 1篇Scienc...

年份

  • 2篇2010
  • 2篇2009
  • 3篇2008
7 条 记 录,以下是 1-7
排序方式:
基于机器学习方法的激素敏感脂肪酶抑制剂活性预测(英文)被引量:4
2010年
脂肪组织中,激素敏感脂肪酶(HSL)被认为是调节脂肪酸代谢的关键限速酶.HSL在糖尿病的发病过程中起重要作用,抑制HSL活性有助于糖尿病的治疗,因此探索新颖的HSL抑制剂成为当前研究的热门.在激素敏感脂肪酶的作用机制和三维结构缺乏的情况下,需要发展预测HSL抑制剂的方法.本文采用几种机器学习方法(支持向量机(SVM)、k-最近相邻法(k-NN)和C4.5决策树(C4.5DT))对已知的HSL抑制剂与非抑制剂建立分类预测模型.252个结构多样性化合物(123个HSL抑制剂与129个HSL非抑制剂)被用于测试分类预测系统,并用递归变量消除法选择与HSL抑制剂相关的性质描述符以提高预测精度.本研究对独立验证集的总预测精度为75.0%-80.0%,HSL抑制剂的预测精度为85.7%-90.5%,非HSL抑制剂的预测精度为63.2%-68.4%.支持向量机方法给出最好的总预测精度(80.0%).本研究表明支持向量机等机器学习方法可以有效预测未知数据集中潜在的HSL抑制剂,并有助于发现与其相关的分子描述符.
吕巍薛英
关键词:机器学习方法
N,N-二甲基-N′-(2′,3′-二脱氧-3′-硫代胞苷)甲脒水解机理的理论研究
2008年
采用密度泛函理论B3LYP/6-31+G(d,p)方法研究了N,N-二甲基-N′-(2′,3′-二脱氧-3′硫代胞苷)甲脒(甲脒-3TC)分子在气相和水溶液中的水解反应机理.考虑了两条可能的反应途径:水分子首先进攻C=N双键的途径(PathA)和先进攻C—N单键的过程(PathB).计算结果表明气相中两条途径的第一步均是速率控制步骤,PathA比PathB更有利.采用自洽反应场极化连续模型(CPCM模型)在B3LYP/6-31+G(d,p)水平上研究了反应体系在水溶液中的溶剂化效应.溶液中第一条途径PathA仍是最优途径.
张嫦薛英
TD-DFT Calculation on the UV-Vis Spectra of Complex 8-((Trimethoxysilyl)methylthio)quinoline·SnCl_4被引量:2
2009年
Electronic structures and absorption spectra properties of complex 8-((trimethoxysilyl)methylthio)quinoline.SnCh in gas phase and MeCN media have been investigated by using DFT/TD-DFT method. The calculated lowest-energy absorption band shows different mechanisms under these two conditions, and it bears LMCT/LLCT/ILCT character in MeCN solution and LLCT/ILCT character in gas phase. The calculated absorption bands of the title complex in MeCN solvent are in good agreement with the experimental results, and calculation results indicate that the very weak experimentally observed lowest-energy absorption band of the title complex in MeCN solvent originates from the spin-forbidden singlet-triplet transitions.
曾义陈新薛英
关键词:TD-DFT
密度泛函理论研究温度和取代基对4-亚芳基亚氨基-1,2,4-三唑-3(2H)-酮气相热分解的影响
2009年
采用密度泛函理论(DFT)方法,在B3LYP/6.31++G(d,p)水平上研究了4-亚芳基亚氨基-1,2,4-三唑-3(2H)-酮及其类似物的气相热分解反应.从热力学性质、几何结构参数、自然电荷分布、温度效应等角度探讨不同取代基对标题物热分解反应的影响.结果表明:R(R=H,CH2CH2CN)取代基对反应影响很小;而苯环上Y(Y=MeO,Me,H,C1和N02)取代基对活化自由能(△G≠)、键长(△R≠)、键角(△a≠)和自然电荷(△q≠)变化的影响与Harnmet常数(力呈现线性关系△P≠=pσ+C(P=G,R,a和q,r〉0.95).给电子基团使得相应的活化自由能降低,键长变短,键角变大,自然电荷增加;吸电子反之.
邹平李强根薛英鄢国森
关键词:密度泛函理论取代基效应
四唑负离子与脒正离子复合物稳定性的理论研究被引量:1
2008年
采用密度泛函B3LYP/6-31+G(d,p)方法和自洽反应场极化连续模型(PCM)研究四唑负离子与脒类(乙脒或苄脒)正离子形成的两种形式的复合物(末端和侧端)及甲酸根负离子与脒类(乙脒或苄脒)正离子形成的复合物在气相和二甲亚砜(DMSO)溶剂中的稳定性.在气相中,四唑-乙脒和四唑-苄脒复合物的相互作用能(△E)末端分别比侧端的大3.56和3.72kJ/mol,表明末端复合物稍占优势.甲酸与乙脒和苄脒的复合物的相互作用能(△E)分别比四唑与乙脒和苄脒的复合物的大59.35和58.99kJ/mol,表明脒与甲酸形成复合物时相互作用更强.溶剂DMSO的作用使得所有复合物的相互作用能变小,但脒与四唑的相互作用仍比脒与甲酸的弱.前者的结合常数与后者的相比只有1/315(乙脒)和1/218(苄脒),这与实验结果相一致.
孙元元张成华薛英鄢国森
关键词:密度泛函理论
Theoretical study on the hydrolysis mechanism of N,N-dimethyl-N′-(2′,3′-dideoxy-3′-thiacytidine)formamidine
2008年
The hydrolysis mechanisms of N,N-dimethyl-N′-(2′,3′-dideoxy-3′-thiacytidine)formamidine (FA-3TC) in the gas phase and in aqueous solution were studied by use of the density functional theory B3LYP/6-31+G(d, p) method. Two possible reaction pathways in the title reaction were considered. In one pathway water attacks the C=N double bond first (path A) while in the other water attacks the C—N single bond first (path B). The calculated results indicate that the first step in both pathways is the rate-limiting process and path A is more favorable than path B in the gas phase. The effect of solvent water on the title reaction was assessed at the B3LYP/6-31+G(d, p) level of theory based on the po-larizable continuum model (CPCM). In water the first mechanism (path A) is also favored.
ZHANG Chang1 & XUE Ying2? 1 College of Chemistry and Environment Protection Engineering, Southwest University for Nationalities, Chengdu 610041, China
关键词:N
脂肪酰胺水解酶催化三联体膦酰化失活的机理:一个模型体系的理论研究(英文)被引量:1
2010年
甲基花生四烯基氟代膦酸酯(MAFP)是脂肪酰胺水解酶(FAAH)的一个抑制剂.FAAH的丝氨酸241(Ser241)-丝氨酸217(Ser217)-赖氨酸142(Lys142)催化三联体被MAFP膦酰化后将导致FAAH失活.本文采用B3LYP/6-311G(d,p)和MP2/6-311G(d,p)方法及一个简化的计算模型体系对这个膦酰化抑制反应进行理论研究.考虑了两种反应途径.PathA涉及FAAH的催化三联体的所有残基,是一个分步的加成-消除过程,形成两性离子的三角双锥中间体,其中第一步反应是决速步骤.在这个反应途径中,Ser217和Lys142对亲核试剂Ser241起到碱催化活化的作用,而Ser217充作Lys142和Ser241之间的桥梁.此外,溶剂中的一个水分子作为Lys142和MAFP间的"氢桥"具有关键的作用,通过给出和接收质子促进了长距离的质子转移.PathB是催化三联体中的残基Lys142被突变为丙氨酸以后的膦酰化反应,也是一个分步过程.水的本体溶剂效应通过极化连续介质模型(PCM)估算.计算结果显示膦酰化反应的PathA是优势途径,在水溶液中其决速步骤的活化能垒为64.9kJ·mol-1.FAAH催化三联体中残基Lys142的变异会降低膦酰化反应的速率,这与实验结果相一致.
李强根薛英郭勇鄢国森
关键词:密度泛函理论
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