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国家教育部博士点基金(20102325120002)

作品数:8 被引量:44H指数:5
相关作者:柏锡朱延明纪巍才华罗晓更多>>
相关机构:东北农业大学中国科学院黑龙江中科瑞合环保技术服务有限公司更多>>
发文基金:国家教育部博士点基金国家自然科学基金教育部科学技术研究重点项目更多>>
相关领域:农业科学生物学更多>>

文献类型

  • 8篇中文期刊文章

领域

  • 6篇农业科学
  • 3篇生物学

主题

  • 4篇基因
  • 3篇蛋白
  • 3篇大豆
  • 2篇生物信息
  • 2篇生物信息学
  • 2篇生物信息学分...
  • 2篇转基因
  • 2篇转录
  • 2篇转录因子
  • 2篇胁迫
  • 1篇盐碱
  • 1篇盐碱胁迫
  • 1篇野生
  • 1篇野生大豆
  • 1篇植物
  • 1篇生大豆
  • 1篇同源
  • 1篇同源蛋白
  • 1篇拟南芥
  • 1篇农杆菌

机构

  • 7篇东北农业大学
  • 2篇中国科学院
  • 1篇黑龙江中科瑞...

作者

  • 7篇柏锡
  • 5篇朱延明
  • 4篇才华
  • 4篇纪巍
  • 3篇罗晓
  • 2篇翟红
  • 2篇王洋
  • 1篇吴婧
  • 1篇赵阳
  • 1篇曹蕾
  • 1篇李勇
  • 1篇唐立郦
  • 1篇刘欣
  • 1篇刘冬冬
  • 1篇赵晓雯
  • 1篇吴芳芳
  • 1篇林凡敏
  • 1篇胡梦然
  • 1篇狄少康
  • 1篇王明超

传媒

  • 4篇东北农业大学...
  • 2篇大豆科学
  • 1篇作物杂志
  • 1篇Journa...

年份

  • 2篇2014
  • 2篇2013
  • 3篇2012
  • 1篇2011
8 条 记 录,以下是 1-8
排序方式:
野生大豆盐碱胁迫响应基因GsZFP1的克隆及序列分析被引量:9
2012年
盐碱胁迫是影响植物生长、发育和产量的重要因素,野生大豆是优良的非生物胁迫抗性材料。为了获得在植物渗透胁迫反应中起关键作用的功能基因,研究以耐盐碱东北野生大豆(Glycine sojaL.G07256)为试材,利用前期构建的野生大豆碱胁迫基因芯片表达谱,从中选出一个在盐碱胁迫早期上调表达,经Blast分析预测属于C2H2类型的锌指转录因子(探针号Gma.17534.1.S1_at),命名为GsZFP1。对GsZFP1基因进行芯片结果的sqRT-PCR验证,并通过同源克隆的方法克隆得到GsZFP1的cDNA序列。利用"ORF Finder"及ExPASy的ProtParam工具分析表明GsZFP1蛋白长度为325 aa,分子质量约35.14 ku,预测等电点为9.99。其锌指结构特征为Cys-X2-Cys-X3-Phe-X5-Phe-X2-His-X3-4-His,并且不含QALGGH保守结构域。该基因是野生大豆中首次被发现的不含QALGGH motif C2H2类型的锌指蛋白,并且参与到非生物胁迫反应。该结果将为研究GsZFP1基因在非生物胁迫中的功能,并为认识不含QALGGH保守结构域的C2H2类型的锌指蛋白在非生物胁迫中的作用奠定基础,为耐渗透胁迫基因工程研究提供潜在的基因资源,为植物耐渗透胁迫机理研究提供依据。
罗晓曹蕾王明超胡梦然柏锡纪巍才华朱延明
关键词:野生大豆盐碱胁迫锌指蛋白
大豆Glyma08g02580及其同源蛋白的生物信息学分析
2014年
WRKY蛋白是一个植物特有的转录因子,最古老的WRKY转录因子具有2个高度保守的WRKY结构域,大概起源于15亿-20亿年前的真核生物。虽然所有的WRKY蛋白质主要通过特异地结合靶基因启动子区域的W盒序列而调控其表达,但各家族成员的生物学功能存在着各自的特异性。通过生物信息学方法,结合大豆基因组数据库、高等植物基因组注释数据库和NCBI等相关数据库,识别、筛选并获得了大豆WRKY基因家族的蛋白序列,以实验室前期克隆得到大豆基因Glyma08g02580.1为目的基因,分析其在拟南芥、水稻等高等植物中的同源蛋白,并对其进行了系统进化分析;同时利用GEO的芯片数据对大豆在碱胁迫下的根和叶基因表达谱进行了分析,通过相关分析,获得了大豆基因组中全部的WRKY蛋白及对应的分类结果,由表达谱分析结果进一步证明了WRKY基因表达的组织特异性。
刘冬冬王洋柏锡
关键词:WRKY转录因子生物信息学系统进化分析基因表达谱
拟南芥MYBC1转录因子介导ABA调节的种子萌发被引量:5
2011年
MYBC1编码具有单一结构域的MYB类转录因子,前期研究中发现它调控拟南芥的抗冷性。为了进一步揭示MYBC1与干旱、盐及ABA的关系,采用Real-time RT-PCR方法分析了MYBC1基因在拟南芥的根中的表达特性。结果表明,在拟南芥的根中MYBC1不能被干旱与高盐诱导,但能够被冷及外源的ABA诱导表达。通过对mybc1突变体的进一步研究发现,MYBC1还参与了ABA介导的种子萌发,mybc1突变体表现出对ABA更强的敏感性,但突变体在耐盐及耐旱能力上并没有改变。由此可知,MYBC1参与了ABA介导的种子萌发,可能没有参与抗盐及抗旱性。
柏锡翟红朱延明
关键词:拟南芥种子萌发
UPF0497家族成员At2g39530基因参与植物非生物胁迫应答的研究
2013年
UPF0497(Uncharacteristic protein family 0497)是一个功能未知的膜蛋白家族,近期研究表明,该家族5个成员与拟南芥凯氏带的形成有关。研究对UPF0497家族成员启动子序列进行分析,发现该家族两个成员(At2g39530和At2g03700)启动子序列中具有DRE顺式作用元件,推测该蛋白家族成员可能参与植物非生物胁迫应答。选取At2g39530基因进行研究,结果表明At2g39530是一种根增强性表达并且存在于细胞核与细胞质中的蛋白,以ABA非依赖途径对非生物胁迫产生响应。这一结果为研究UPF0497家族在非生物胁迫中的作用提供参考。
柏锡刘欣翟红朱延明才华纪巍罗晓
关键词:膜蛋白胁迫响应
大豆耐盐性鉴定体系的建立被引量:7
2013年
采用沙土水溶液的培养方法,以3个主栽大豆品种合丰50、合丰55和绥农28为试验材料,分别在种子发芽期(VE期)、第二片三出复叶长出期(V2期)进行不同浓度的NaCl处理,测定种子发芽率、死亡叶面积率、相对株高盐害率等表型指标,检测丙二醛含量、相对电导率等耐盐性生理指标。数据分析表明,该方法能区分不同品种、不同处理浓度的盐害程度,反映出相同品种、不同处理浓度间的差异,证明该方法能够用于大豆耐盐性鉴定。通过该鉴定体系测定3个大豆品种的耐盐性,最终选出在VE期抑制50%种子发芽NaCl浓度、V2期死亡叶面积率和对照之间存在显著差异的最小NaCl筛选浓度,并把V2期的死亡叶面积率作为衡量耐盐性的主要表型指标,丙二醛含量作为主要生理指标。研究结果可用于大豆耐盐性的鉴定、转基因耐盐大豆的鉴定等领域,具有重要应用价值。
柏锡吴芳芳林凡敏赵晓雯狄少康朱延明李勇才华纪巍
关键词:大豆耐盐性转基因
Research Progress in Digging and Validation of miRNA Target Genes Using Experimental Methods被引量:1
2012年
MicroRNAs (miRNAs) are a group of regulatory RNAs that regulate gene expression post-transcriptionally by the degradation or translational inhibition of their target messenger RNAs (mRNAs). Regulation is accomplished when the 22-25 nucleotide miRNAs bind to complementary sequences in the 3'-untranslated regions (UTR). One barrier to miRNA research is to find target genes. Although computational target predictions have shed light on important aspects of microRNA target recognition, questions remain concerning the rates of false positives. In addition, we do not completely understand how microRNAs can recognize and regulate their targets. As such, experimental positive predictions and allow for an unbiased stu ap dy proaches are required, which can reflect in vivo processes, eliminating false of microRNA target recognition. In this review, we summarized experimental approaches that have been described for the identification and validation of mRNA targets associated with specific miRNAs.
Luo XiaoBai XiCai HuaJi WeiLiu XinTang Li-liZhu Yan-ming
关键词:MIRNATARGET
GsZFP1基因植物表达载体构建及对苜蓿的遗传转化被引量:5
2012年
从野生大豆中获得的具有耐旱、耐冷特性的锌指转录因子GsZFP1基因,构建到以CaMV35S为启动子、E12为增强子的植物表达载体pCEOM中,以bar基因为筛选标记基因,通过农杆菌介导法将构建的植物表达载体转化苜蓿品种农菁1号的子叶节,用含0.5mg/L草丁磷的筛选培养基进行筛选,获得了70株抗性植株,用PCR检测得到20株bar基因阳性植株,将获得的转基因植株进行GsZFP1基因的RT-PCR鉴定,获得3株RT-PCR阳性植株。结果表明,GsZFP1基因在苜蓿中得到表达。
唐立郦朱延明才华纪巍罗晓吴婧赵阳柏锡
关键词:苜蓿农杆菌介导转基因株系
大豆NAC基因家族生物信息学分析被引量:17
2014年
NAC转录因子是植物特有的具有多种生物功能的一类重要转录因子,广泛参与植物生长发育以及生物与非生物逆境应答等。本文利用生物信息学手段,结合大豆基因组数据库及NCBI数据库,识别、筛选并获得了大豆NAC家族基因的蛋白序列,并对其进化关系、在基因组上的定位分布以及理化特性进行了预测和分析。结果显示具有NAC结构域的152条大豆氨基酸序列认为是假定NAC蛋白质,共分为10个亚家族,连锁群定位结果发现大豆的20条染色体上均有NAC转录因子的分布,其中第12号染色体上分布最多。不同亚族间的大豆假定NAC蛋白质理化特性存在一定的差异,无规则卷曲和α-螺旋是蛋白质二级结构最大量的结构元件,并散布于整个蛋白。本研究结果将为大豆NAC基因家族的进一步功能分析奠定重要的研究基础。
王洋柏锡
关键词:大豆生物信息学
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