广州市科技计划项目(2013J4100078)
- 作品数:3 被引量:39H指数:3
- 相关作者:可小丽卢迈新刘志刚王淼高风英更多>>
- 相关机构:中国水产科学研究院珠江水产研究所广东海洋大学广东省农业科学院动物卫生研究所更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目广州市科技计划项目中国水产科学研究院基本科研业务费专项基金更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 罗非鱼无乳链球菌强毒株基因组表达文库的构建及鉴定被引量:5
- 2015年
- 为了筛选罗非鱼(Oreochromis niloticus)无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)在鱼体内特异诱导表达基因,该研究构建了罗非鱼无乳链球菌强毒株Hod-1的基因组表达文库。采用Sau3AI对无乳链球菌菌株Hod-1基因组DNA进行不完全酶切,回收大小为0.5—2.0kb的DNA片段,并与经BamHI单酶切且去磷酸化的pET-28a/b/c表达载体连接,转化表达宿主菌BL21(DE3)。结果显示,所构建的无乳链球菌菌株Hod.1基因组表达文库含1.024×10^5个克隆,远大于覆盖无乳链球菌全基因组所需的最小库容量(45579个)。PCR检测结果显示重组子中外源片段的插入率为94%,插入片段大小为0.5—2.0kb,且分布均匀,测序结果显示插入序列与GenBank中无乳链球菌基因组序列同源性高达99%以上。结果表明该研究成功构建了罗非鱼无乳链球菌的基因组表达文库,该文库可用于无乳链球菌在罗非鱼体内诱导表达基因的筛选。
- 刘志刚可小丽卢迈新方伟王淼朱华平高风英曹建萌
- 关键词:尼罗罗非鱼无乳链球菌
- 罗非鱼-鱼腥草共生养殖池塘沉积物菌群结构与功能特征被引量:26
- 2015年
- 为探究鱼腥草浮床对罗非鱼池塘沉积物中细菌群落的影响,采用Biolog-Eco和PCR-DGGE技术,对比分析了2013年9—11月鱼腥草浮床(试验塘)和常规养殖(对照塘)2种模式下,罗非鱼养殖池塘沉积物中菌群的结构和功能多样性特征。Biolog-Eco结果显示:9月份试验塘沉积物微生物代谢强度和菌群多样性指数均低于对照塘;但10—11月份则明显高于对照塘,且不同月份丰富度指数与对照塘相比均差异显著(P<0.05),说明鱼腥草浮床在养殖中、后期能有效增加细菌生物量和提高种群丰富度。主成分分析(PCA)显示:试验塘和对照塘不同月份沉积物中菌群对羧酸类碳源的相对利用率差异较大,且不同月份利用碳源的差异程度为10月>11月>9月;DGGE结果显示:试验塘和对照塘沉积物主要的菌群结构组成相似,分属于6个门,包括变形菌门(Proteobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌门(Chloroflexi)、蓝细菌门(Cyanobacteria)和梭杆菌门(Fusobacteria),其中变形菌门(54.17%)均为优势菌群,但同一月份试验塘菌群多样性均明显多于对照塘。结果表明,鱼腥草浮床具有增加罗非鱼池塘沉积物菌群功能多样性和优化菌群结构的作用。
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- 关键词:吉富罗非鱼